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公开(公告)号:CN108765283A
公开(公告)日:2018-11-06
申请号:CN201810410930.2
申请日:2018-05-02
Applicant: 华中科技大学
Abstract: 本发明公开了用于超分辨定位显微成像混合密度数据处理的装置和方法,该装置包括:数据采集卡、PC、FPGA板卡及GPU板卡。数据集卡用于采集相机探测到的原始图像数据,数据采集卡直接通过主板的PCIE插槽与PC连接;PC通过控制软件提取数据采集卡中原始图像数据,并将原始图像数据传输至FPGA板卡,FPGA板卡对原始图像数据中稀疏和高密度荧光分子进行判断及分类处理,并将稀疏和高密度分子子区域传输至PC;PC中的GPU板卡对稀疏和高密度分子分别用不同的定位算法进行处理。生物荧光样品中稀疏分子区域量大,定位速度快,但图像数量大。而高密度分子区域量相对较小,定位速度较慢。重建过程中,实现稀疏/高密度混合分子超分辨图像重建的实时处理和可视化。
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公开(公告)号:CN106897969A
公开(公告)日:2017-06-27
申请号:CN201710089310.9
申请日:2017-02-20
Applicant: 华中科技大学
Abstract: 本发明公开了一种用于超分辨定位显微成像的数据处理装置及方法,数据处理装置包括数据预处理电路和第一处理器。数据预处理电路包括探测器接口电路、多路复用电路、FPGA和第一接口电路。探测器接口电路快速获取并输出由探测器采集的荧光图。多路复用电路复制探测器采集的荧光图,至少一路为通路,不影响原电路结构。FPGA从荧光图中提取荧光分子子区域,并由第一接口电路将荧光分子子区域传输给第一处理器。第一处理器对荧光分子子区域进行定位处理,获得超分辨重建图。由于FPGA能够实现快速从荧光图中提取荧光分子子区域,并将其传输至第一处理器,由第一处理器获得超分辨重建图像,使得数据处理装置实现高精度超分辨图像实时重建。
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公开(公告)号:CN108765283B
公开(公告)日:2020-11-24
申请号:CN201810410930.2
申请日:2018-05-02
Applicant: 华中科技大学
Abstract: 本发明公开了用于超分辨定位显微成像混合密度数据处理的装置和方法,该装置包括:数据采集卡、PC、FPGA板卡及GPU板卡。数据集卡用于采集相机探测到的原始图像数据,数据采集卡直接通过主板的PCIE插槽与PC连接;PC通过控制软件提取数据采集卡中原始图像数据,并将原始图像数据传输至FPGA板卡,FPGA板卡对原始图像数据中稀疏和高密度荧光分子进行判断及分类处理,并将稀疏和高密度分子子区域传输至PC;PC中的GPU板卡对稀疏和高密度分子分别用不同的定位算法进行处理。生物荧光样品中稀疏分子区域量大,定位速度快,但图像数量大。而高密度分子区域量相对较小,定位速度较慢。重建过程中,实现稀疏/高密度混合分子超分辨图像重建的实时处理和可视化。
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公开(公告)号:CN106897969B
公开(公告)日:2019-08-30
申请号:CN201710089310.9
申请日:2017-02-20
Applicant: 华中科技大学
Abstract: 本发明公开了一种用于超分辨定位显微成像的数据处理装置及方法,数据处理装置包括数据预处理电路和第一处理器。数据预处理电路包括探测器接口电路、多路复用电路、FPGA和第一接口电路。探测器接口电路快速获取并输出由探测器采集的荧光图。多路复用电路复制探测器采集的荧光图,至少一路为通路,不影响原电路结构。FPGA从荧光图中提取荧光分子子区域,并由第一接口电路将荧光分子子区域传输给第一处理器。第一处理器对荧光分子子区域进行定位处理,获得超分辨重建图。由于FPGA能够实现快速从荧光图中提取荧光分子子区域,并将其传输至第一处理器,由第一处理器获得超分辨重建图像,使得数据处理装置实现高精度超分辨图像实时重建。
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公开(公告)号:CN105243677A
公开(公告)日:2016-01-13
申请号:CN201510560412.5
申请日:2015-09-02
Applicant: 华中科技大学
Abstract: 本发明公开了一种保证精度的实时单分子定位方法及系统。其中,该方法包括:先基于像素级定位参数对待处理图像进行区域提取;再对提取到的图像进行粗定位,得到提取到的图像的亚像素级定位参数;接着基于提取到的图像的亚像素级定位参数对提取到的图像进行精定位。由于经过粗定位得到的初始值(亚像素级定位参数)更接近于真实值,再据此进行精定位计算,因而减少了在精定位时的迭代次数,从而加快了超分辨图像的定位速度。这样,本发明在保证定位精度的情况下,加快了超分辨图像的定位速度。
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公开(公告)号:CN105243677B
公开(公告)日:2019-10-01
申请号:CN201510560412.5
申请日:2015-09-02
Applicant: 华中科技大学
Abstract: 本发明公开了一种保证精度的实时单分子定位方法及系统。其中,该方法包括:先基于像素级定位参数对待处理图像进行区域提取;再对提取到的图像进行粗定位,得到提取到的图像的亚像素级定位参数;接着基于提取到的图像的亚像素级定位参数对提取到的图像进行精定位。由于经过粗定位得到的初始值(亚像素级定位参数)更接近于真实值,再据此进行精定位计算,因而减少了在精定位时的迭代次数,从而加快了超分辨图像的定位速度。这样,本发明在保证定位精度的情况下,加快了超分辨图像的定位速度。
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