公开(公告)号：CN116110044A

公开(公告)日：2023-05-12

申请号：CN202310159234.X

申请日：2023-02-15

Applicant: 北京昌平实验室

Inventor： 任仙文 ,  钟韵山

IPC: G06V20/69 ,  G06V10/26 ,  G06V10/74 ,  G06V10/82 ,  G06N3/0455 ,  G06N3/092

Abstract: 本文涉及细胞分析技术领域，尤其涉及一种细胞分割方法、装置、计算机设备以及可读存储介质。所述方法包括，获取空间组学样本以及单细胞样本；获取所述空间组学样本的候选细胞中心；根据所述空间组学样本中每一标记物以及所述候选细胞中心的分布，得到所述空间组学样本中的初始细胞分割结果；根据所述初始细胞分割结果的标记物与所述单细胞样本的标记物的相似度，以及空间组学样本中标记物的距离得分，得到最终细胞分割结果。利用本文实施例，通过单细胞样本的标记物分布特征对空间组学样本中的细胞进行了分割，分割的准确性较高，基于单细胞数据弥补了空间组数据的不足，增强了空间组数据的生物学解释性。

公开(公告)号：CN115691676A

公开(公告)日：2023-02-03

申请号：CN202211436510.4

申请日：2022-11-16

Applicant: 北京昌平实验室

Inventor： 任仙文 ,  钟韵山 ,  周子翔

IPC: G16B40/00 ,  G06N3/047 ,  G06N3/0464 ,  G06N3/08

Abstract: 本文涉及细胞分析技术领域，尤其涉及一种分析组织细胞成分的方法、装置及存储介质。所述方法包括，获取单细胞的特征矩阵；根据所述单细胞的特征矩阵以及细胞权重矩阵，生成组织特征矩阵；训练所述组织特征矩阵与检测得到的组织特征矩阵之间的损失函数，得到最终细胞权重矩阵，其中所述损失函数包括了越相似的细胞其在组织中的含量也相似的特性。利用本文实施例，通过反应了组织和其中细胞生物学特征的损失函数进行反卷积计算，可以得到组织中单细胞的占比含量，提高反卷积计算的分辨率至单个细胞级别。