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公开(公告)号:CN110512024B
公开(公告)日:2022-03-18
申请号:CN201910836010.1
申请日:2019-09-04
Applicant: 北京市农林科学院
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供一种通过SNP分子标记检测桃果实酸性状的方法,所述标记位点来自桃长链脂肪醇脱氢酶(PpFAO4A,Prupe.5G013900)基因,其编码核苷酸序列(Coding Sequence,CDS)的第1827位的碱基为A或者G。本发明的方法可用于桃果实低酸风味的早期预测和品种资源的鉴定,还可用于栽培桃遗传背景分析及筛选,以及桃优异单株的选育,具有广阔的应用前景。
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公开(公告)号:CN107746896B
公开(公告)日:2021-03-16
申请号:CN201711181446.9
申请日:2017-11-23
Applicant: 北京市农林科学院
IPC: C12Q1/6895 , A01H1/04
Abstract: 本发明公开了与桃果皮绒毛性状相关的SNP标记及其应用。本发明提供了三个与桃果皮绒毛性状相关的SNP分子标记及成套的KASP引物组合,可用于桃育种材料果皮性状及果实油桃和毛桃表型的快速鉴定。本发明的鉴定方法成本低、结果准确可靠、操作简单周期短,利于大样本量的检测,在桃新品种的果实绒毛性状及果实油桃和毛桃表型的预测上有重要的意义,能有效提升桃育种效率和准确性。
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公开(公告)号:CN110512024A
公开(公告)日:2019-11-29
申请号:CN201910836010.1
申请日:2019-09-04
Applicant: 北京市农林科学院
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供一种通过SNP分子标记检测桃果实酸性状的方法,所述标记位点来自桃长链脂肪醇脱氢酶(PpFAO4A,Prupe.5G013900)基因,其编码核苷酸序列(Coding Sequence,CDS)的第1827位的碱基为A或者G。本发明的方法可用于桃果实低酸风味的早期预测和品种资源的鉴定,还可用于栽培桃遗传背景分析及筛选,以及桃优异单株的选育,具有广阔的应用前景。
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公开(公告)号:CN106557657A
公开(公告)日:2017-04-05
申请号:CN201611039234.2
申请日:2016-11-21
Applicant: 北京市农林科学院
IPC: G06F19/00
CPC classification number: G06F19/18
Abstract: 本发明涉及一种基于GEMMA的GWAS分析方法及装置,其特征在于包括:将vcf文件一次性转换为GEMMA所需的bim、fam、bed文件;将所得bim,bed,fam文件通过GEMMA进行关联分析;对关联分析后的结果分别进行制作曼哈顿图、QQ图和SNP注释文件,完成GWAS分析。本发明将vcf文件和表型文件作为输入,一次性生成GWAS分析结果,大大提高了分析效率,使GWAS分析更加快捷,简单。使基于GEMMA的GWAS流程一体化,能灵活的分三个模块进行操作,也可一次性输入参数以执行整个流程,分析参数的调整十分灵活。
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公开(公告)号:CN103333228A
公开(公告)日:2013-10-02
申请号:CN201310239692.0
申请日:2013-06-17
Applicant: 北京市农林科学院
Abstract: 本发明涉及基因工程领域,具体地,本发明涉及一种来源于果胶杆菌的蛋白HrpNX3及其基因与应用。本发明提供了一种来源于胡萝卜软腐果胶杆菌Pectobacterium carotovorum subsp.carotovorum的蛋白HrpNX3,其氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示,且本发明提供了编码上述蛋白HrpNX3的编码基因hrpNX3序列如SEQ ID NO.2所示。本发明的HrpNX3显著提高了模式植物拟南芥和名贵药材铁皮石斛对软腐病菌抗病性,可用于植物防治软腐病领域,具有广阔的应用前景和其巨大经济效益。
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公开(公告)号:CN120032190A
公开(公告)日:2025-05-23
申请号:CN202510509758.6
申请日:2025-04-22
Applicant: 慧诺瑞德(北京)科技有限公司 , 北京市农林科学院
IPC: G06V10/764 , G06V10/762 , G06V10/56 , G06V10/80 , G06V10/82 , G06V10/30 , G06N3/0464 , G06N3/09
Abstract: 本申请提供一种植物表型分析方法,能够根据植物盆栽的原始图像,确定其对应的深度图,对于盆栽植物来说背景离拍摄镜头比较远,根据深度图能够快速准确的将盆栽与背景分离得到对应的背景簇和植物簇,进而根据该植物簇得到准确的盆栽掩码图像;由于花盆颜色比较好区分,对原始图像进行颜色分析确定对应的花盆区域,提取准确的花盆掩码图像;利用能对土壤进行准确识别的图像处理模型,对原始图像进行分析识别出土壤区域,得到准确的土壤掩码图像;最后就可以从盆栽掩码图像中将花盆掩码图像部分和土壤掩码图像部分去除,进而剩余部分就是准确的植物掩码图像,就能根据该植物掩码图像进行准确的表型分析,得到该植物准确的表型参数。
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公开(公告)号:CN108130378B
公开(公告)日:2021-08-20
申请号:CN201611091395.6
申请日:2016-12-01
Applicant: 北京市农林科学院
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种与桃果实甜酸风味性状相关的SNP标记及其应用。本发明提供了检测待测桃树基因组的g.1495589位点的基因型的物质在鉴定或辅助鉴定待测桃树的果实是否为酸性表型中的应用;所述g.1495589位点为5号染色体的第1495589位或序列1第601位核苷酸。本发明基于现有的284份测序及芯片的桃SNP标记数据,开展了与表型性状的关联分析,成功在5号染色体上定位到一个与甜酸相关的SNP标记,相较于之前的RAPD、AFLP、SSR标记,可将预测的准确性提高到85%以上,使得预测的结果更加可靠。在种子时期进行个体甜酸性表型的预测,提高选种效率、节约育种成本。
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公开(公告)号:CN107699633B
公开(公告)日:2021-07-27
申请号:CN201711182150.9
申请日:2017-11-23
Applicant: 北京市农林科学院
IPC: C12Q1/6895 , A01H1/04
Abstract: 本发明公开了与桃果实风味性状相关的SNP标记及其应用。本发明提供了2个与桃果实风味性状相关的SNP标记,并基于该SNP标记提供了鉴定桃果实风味性状的方法,可用于快速鉴定桃果实为酸表型还是非酸表型。本发明的检测方法的检测成本低、操作简单,预测的准确性在90%以上,在桃新品种的果实风味性状的预测上有重要的意义,能有效提升桃育种效率和准确性。
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公开(公告)号:CN118360290A
公开(公告)日:2024-07-19
申请号:CN202410321048.6
申请日:2024-03-20
Applicant: 北京市农林科学院
IPC: C12N15/29 , C07K14/415 , C12N15/82 , A01H6/74 , A01H5/08
Abstract: 本发明属于植物分子生物学领域,公开一种桃果肉单糖转运蛋白PpERDL16的桃NAC类转录因子PpNAC050A基因及其应用。所述基因编码的蛋白质的氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示。本发明证实所述基因能够与单糖转运蛋白PpERDL16启动子结合,并通过调控其活性,影响果糖的积累。进而在桃果肉中成功构建所述基因的过表达系统,可有效抑制单糖转运蛋白PpERDL16活性,增加果糖的在果肉中的积累,从而使果肉甜度增高。因此,通过过表达该基因可以改良桃果肉品质,为培育优质果实提供重要理论依据,具有广阔应用前景。
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公开(公告)号:CN108130378A
公开(公告)日:2018-06-08
申请号:CN201611091395.6
申请日:2016-12-01
Applicant: 北京市农林科学院
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种与桃果实甜酸风味性状相关的SNP标记及其应用。本发明提供了检测待测桃树基因组的g.1495589位点的基因型的物质在鉴定或辅助鉴定待测桃树的果实是否为酸性表型中的应用;所述g.1495589位点为5号染色体的第1495589位或序列1第601位核苷酸。本发明基于现有的284份测序及芯片的桃SNP标记数据,开展了与表型性状的关联分析,成功在5号染色体上定位到一个与甜酸相关的SNP标记,相较于之前的RAPD、AFLP、SSR标记,可将预测的准确性提高到85%以上,使得预测的结果更加可靠。在种子时期进行个体甜酸性表型的预测,提高选种效率、节约育种成本。
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