一种基于深度均衡模型的求解分子系统稳态方法

    公开(公告)号:CN119007843A

    公开(公告)日:2024-11-22

    申请号:CN202411108060.5

    申请日:2024-08-13

    Applicant: 北京大学

    Abstract: 本发明公开了一种基于深度均衡模型的求解分子系统稳态方法,包括:构建数据集,所述数据集中的数据为初始构象‑稳态构象的配对数据;将数据集中的数据划分为训练样本和测试样本;对训练样本先进行时间采样,而后按照布朗桥的路径概率进行采样,得到预处理后的训练样本;构建基于图Transformer或球谐函数表示的SE(3)等变神经网络模型;利用预处理后的训练样本对SE(3)等变神经网络模型进行训练,直至SE(3)等变神经网络模型收敛,得到训练好的SE(3)等变图神经网络模型;先从初始构象分布∏0中采样,生成一个粗糙构象;再通过模拟以下SDE从联合分布Π0,1中抽样,得到t=1的X1即为所需的稳态构象。

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