公开(公告)号：CN119220637A

公开(公告)日：2024-12-31

申请号：CN202310772151.8

申请日：2023-06-28

Applicant: 北京大学

Inventor： 李文 ,  卢健森 ,  汤富酬 ,  文路

IPC: C12Q1/6806 ,  C12Q1/6869 ,  G16B5/00 ,  G16B20/20 ,  G16B20/10 ,  G16B30/00 ,  G16B30/10 ,  G16B30/20 ,  G16B40/00 ,  G16B40/30

Abstract: 本发明公开了用于单细胞染色体构象捕获中的三代测序用DNA分子的扩增方法及其装置。本发明的方法在制备单细胞三代测序的测序文库时，在Tn5转座酶的接头序列中添加条码序列以及在PCR扩增引物序列中添加条码序列，根据组合的条码序列区分不同的单细胞，对不同来源的DNA扩增产物混合达到了第三代测序平台对模板量的要求，可以实现对不同通量单细胞的需求进行单细胞三代Hi‑C的测序，结合配套的生物信息学分析方法，本发明的方法可实现单细胞三维基因组建模、单细胞的降维和聚类、单细胞的拷贝数变异、单细胞的结构变异鉴定、辅助单细胞组装和/或鉴定单细胞的染色质高阶相互作用，完成染色质和/或染色体构象捕获。