一种柳树全基因组40K SNP液相芯片及其应用

    公开(公告)号:CN119177306A

    公开(公告)日:2024-12-24

    申请号:CN202411097961.9

    申请日:2024-08-12

    Applicant: 兰州大学

    Abstract: 本发明为了以低成本、高效、简单的手段解决柳树育种难题,提供一种柳树全基因组40K SNP液相芯片,包括柳树40K位点探针混合液和杂交捕获试剂,所述柳树40K位点探针混合液包括柳树SNP背景位点探针和柳树SNP关联位点探针,每个位点至少2根捕获探针。该液相芯片用于柳树遗传多样性分析、分子遗传图谱构建、全基因组关联分析、品种真实性鉴定、分子标记辅助选择育种、全基因组选择育种,应用在柳树叶片检出试验中,对检出情况进行了统计,芯片共40188个位点,在16个样本原始SNP位点中平均检出率为97.39%,对16个样本数据合并进行统计后,位点检出率达99.9%,该方法大大节省了样本检测的服务周期,提高了柳树的育种效率。

    一种基于大数据的林木种植选品预测方法及系统

    公开(公告)号:CN119358821A

    公开(公告)日:2025-01-24

    申请号:CN202411393045.X

    申请日:2024-10-08

    Applicant: 兰州大学

    Abstract: 本发明公开了一种基于大数据的林木种植选品预测方法及系统,涉及林木种植选品技术领域,包括以下步骤:确定预测目标和预测的时间范围,收集预测目标种植区域的基因组数据、表型数据、种植数据和生长环境数据,并整合为数据集;对数据集进行预处理,提取数据集中的林木种植品种相关的特征,包括用途和关键性状,并通过统计方法,筛选出与林木种植品种影响的关键特征;根据数据特性和预测目标建立预测模型。本发明通过大数据技术的运用,整合并分析跨地区、跨品种的林木种植数据,识别出影响林木生长、产量及品质的关键因素,并基于这些共性因素,构建综合的评估体系,减少单一标准导致的误差,提高预测结果的准确性。

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