公开(公告)号：CN118736236A

公开(公告)日：2024-10-01

申请号：CN202410768556.9

申请日：2024-06-14

Applicant: 中国科学院计算机网络信息中心

Inventor： 王鹏飞 ,  许萍 ,  龙晴晴 ,  周园春 ,  王学志 ,  孟珍

IPC: G06V10/40 ,  G06V10/80 ,  G06V10/774 ,  G06V10/778

Abstract: 本发明公开了一种针对细粒度属性对比融合的跨模态零样本哈希方法。本发明首先对图像的视觉属性进行特征提取，得到视觉表征矩阵；通过利用属性原型网络来捕获图像细粒度细节和独特的局部特征，计算并优化属性回归损失#imgabs0#根据属性的数值差异为每个图像构建正例和负例，并通过对比学习综合考虑属性的上下文信息制定属性级对比表征目标#imgabs1#引入类一致性约束#imgabs2#基于表征推导哈希网络引入超球面损失#imgabs3#实现更大的类间分离和压缩类间变异；联合#imgabs4#和#imgabs5#进行模型优化，得到未知类图像的预测标签。

公开(公告)号：CN118445429A

公开(公告)日：2024-08-06

申请号：CN202410409237.9

申请日：2024-04-07

Applicant: 中国科学院计算机网络信息中心

Inventor： 肖濛 ,  王学志 ,  周园春 ,  陈志坚 ,  许萍

IPC: G06F16/38 ,  G06F16/33 ,  G06F40/211 ,  G16B40/00

Abstract: 本发明公开了基于生物文献生成基因描述信息的方法、系统及介质，涉及生命科学领域，本发明通过获取与目标基因关联的生物文献，对获取的生物文献进行句子拆分和过滤，生成初级关键句集合；对生成的初级关键句集合中的每个句子均进行评分，按照评分高低进行排序，生成最终关键句集合；将最终关键句集合输入大语言模型，生成基因描述信息。本发明能够提高基因描述信息自动生成的效率和质量，克服信息冗余、语义不连贯问题。

公开(公告)号：CN119068996A

公开(公告)日：2024-12-03

申请号：CN202410989937.X

申请日：2024-07-23

Applicant: 中国科学院计算机网络信息中心

Inventor： 许萍 ,  周园春 ,  王鹏飞 ,  宁致远 ,  肖濛 ,  龙晴晴

IPC: G16B40/00 ,  G16B30/00 ,  G06F18/23213 ,  G06F18/25 ,  G06N3/042 ,  G06N3/0464 ,  G06N3/0455 ,  G06N3/0895

Abstract: 本发明公开一种用于解释单细胞RNA测序数据的孪生聚类方法及系统，属于生物信息技术领域。所述方法包括：对单细胞RNA测序数据进行预处理，得到预处理后的基因表达矩阵，并基于所述预处理后的基因表达矩阵构建细胞间的K最近邻图；对所述预处理后的基因表达矩阵进行特征空间增强，得到扰动属性矩阵#imgabs0#对所述细胞间的K最近邻图进行结构空间增强，得到增强图；基于所述扰动属性矩阵和所述增强图进行信息融合与编解码，得到所述单细胞RNA测序数据对应的聚类结果。本发明能够有效解决现有scRNA‑seq数据聚类方法面临的对细胞间信息探索不足、数据抗噪能力低以及对大型数据集可扩展性差的问题。

公开(公告)号：CN117540233A

公开(公告)日：2024-02-09

申请号：CN202311335095.8

申请日：2023-10-16

Applicant: 中国科学院计算机网络信息中心

Inventor： 周园春 ,  许萍 ,  王鹏飞 ,  肖濛 ,  宁致远

IPC: G06F18/23213 ,  G06F18/214 ,  G06F18/213 ,  G06F18/25 ,  G16B40/00 ,  G06N3/0455 ,  G06N3/084 ,  G06N3/088

Abstract: 本发明公开了一种基于深度图切割的scRNA‑seq数据聚类方法及装置，该方法包括：对原始的scRNA‑seq计数矩阵进行预处理，得到原始数据X，并分别构建所述原数数据X的协调协同图和垂直融合图；基于自动编码器提取原始数据X的表征矩阵H，并计算重构损失；结合表征矩阵H最小化协调协同图和垂直融合图的联合归一化切，以得到NCut损失；根据表征矩阵H进行基于最佳传输的自监督聚类，并计算聚类损失；联合重构损失、NCut损失以及聚类损失进行参数更新后，得到原始数据X的聚类结果。本发明可以解决scRNA‑seq实验中数据成指数增长带来的挑战，并获得更好的聚类精度。