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公开(公告)号：CN1773276A
公开(公告)日：2006-05-17
申请号：CN200410090806.0
申请日：2004-11-12
Applicant: 中国科学院计算技术研究所
Abstract: 本发明公开了一种用串联质谱中碎片离子的同位素峰预测离子分子式的方法，该方法从串联质谱和从各元素的原子个数待定的通用分子式中分别获取碎片离子的单同位素的质量以及各同位素谱峰相对于单同位素的相对丰度；将分别获取的质量和相对丰度做匹配以获得所述通用分子式中待定的各元素的原子个数的非负整数解，得到碎片离子的分子式。本发明的方法利用串联质谱中碎片离子的同位素谱峰信息，通过串联质谱碎片离子的同位素谱峰的模式计算此碎片离子对应的分子式。本发明的方法可以提供碎片离子准确的分子式信息，可对鉴定多肽序列的数据库搜索方法提供的候选序列进行鉴别；以及为求解多肽序列的de novo方法产生高可靠候选序列提供依据。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN105758928B
公开(公告)日：2019-04-30
申请号：CN201610109049.X
申请日：2016-02-26
Applicant: 中国科学院计算技术研究所 , 中国科学院生物物理研究所
IPC: G01N27/62
Abstract: 本发明公开了一种糖结构鉴定方法及糖结构鉴定装置，所述糖结构鉴定方法包括：步骤一：利用多级质谱信息进行待测糖结构谱峰对应的子结构预测，所述子结构作为对应谱峰的候选子结构；以及步骤二：利用De Novo糖结构鉴定技术，根据质谱谱峰对应的候选子结构组装出完整的糖结构。本发明基于糖结构多级质谱数据，采用De Novo糖结构鉴定技术，实现糖结构的鉴定，实现了多级质谱De Novo糖结构鉴定算法，通过有效的利用多级质谱信息，不仅显著提高了De Novo过程中枚举糖结构片段的效率，而且明显缩小了糖候选结构集合。
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公开(公告)号：CN104965020A
公开(公告)日：2015-10-07
申请号：CN201510290301.7
申请日：2015-05-29
Applicant: 中国科学院计算技术研究所 , 中国科学院生物物理研究所
IPC: G01N27/62
Abstract: 本发明提供一种多级质谱生物大分子结构鉴定方法，包括：1)获得样品的二级质谱作为当前质谱；2)在当前质谱中，选择产生下一级质谱的离子，基于所选择的离子进行质谱实验获得所述下一级质谱；3)使用层次贝叶斯模型将所述当前质谱的后验概率以先验概率的方式代入所述下一级质谱，进而对每个候选结构对应的理论质谱进行谱谱比对打分；4)如果无法根据当前的谱谱比对打分结果得出唯一的匹配结构，则将所述下一级质谱作为当前质谱，重复步骤2)进行下一级的质谱分析，直至得出唯一的匹配结构。本发明能够提升生物大分子结构尤其是糖结构同分异构体的鉴定准确度；能够显著降低多级质谱鉴定的开销，例如花费较少的样品量及鉴定时间。
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公开(公告)号：CN104965020B
公开(公告)日：2017-07-21
申请号：CN201510290301.7
申请日：2015-05-29
Applicant: 中国科学院计算技术研究所 , 中国科学院生物物理研究所
IPC: G01N27/62
Abstract: 本发明提供一种多级质谱生物大分子结构鉴定方法，包括：1)获得样品的二级质谱作为当前质谱；2)在当前质谱中，选择产生下一级质谱的离子，基于所选择的离子进行质谱实验获得所述下一级质谱；3)使用层次贝叶斯模型将所述当前质谱的后验概率以先验概率的方式代入所述下一级质谱，进而对每个候选结构对应的理论质谱进行谱谱比对打分；4)如果无法根据当前的谱谱比对打分结果得出唯一的匹配结构，则将所述下一级质谱作为当前质谱，重复步骤2)进行下一级的质谱分析，直至得出唯一的匹配结构。本发明能够提升生物大分子结构尤其是糖结构同分异构体的鉴定准确度；能够显著降低多级质谱鉴定的开销，例如花费较少的样品量及鉴定时间。
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公开(公告)号：CN105758928A
公开(公告)日：2016-07-13
申请号：CN201610109049.X
申请日：2016-02-26
Applicant: 中国科学院计算技术研究所 , 中国科学院生物物理研究所
IPC: G01N27/62
CPC classification number: G01N27/62
Abstract: 本发明公开了一种糖结构鉴定方法及糖结构鉴定装置，所述糖结构鉴定方法包括：步骤一：利用多级质谱信息进行待测糖结构谱峰对应的子结构预测，所述子结构作为对应谱峰的候选子结构；以及步骤二：利用De Novo糖结构鉴定技术，根据质谱谱峰对应的候选子结构组装出完整的糖结构。本发明基于糖结构多级质谱数据，采用De Novo糖结构鉴定技术，实现糖结构的鉴定，实现了多级质谱De Novo糖结构鉴定算法，通过有效的利用多级质谱信息，不仅显著提高了De Novo过程中枚举糖结构片段的效率，而且明显缩小了糖候选结构集合。
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公开(公告)号：CN100390537C
公开(公告)日：2008-05-28
申请号：CN200410090806.0
申请日：2004-11-12
Applicant: 中国科学院计算技术研究所
Abstract: 本发明公开了一种用串联质谱中碎片离子的同位素峰预测离子分子式的方法，该方法从串联质谱和从各元素的原子个数待定的通用分子式中分别获取碎片离子的单同位素的质量以及各同位素谱峰相对于单同位素的相对丰度；将分别获取的质量和相对丰度做匹配以获得所述通用分子式中待定的各元素的原子个数的非负整数解，得到碎片离子的分子式。本发明的方法利用串联质谱中碎片离子的同位素谱峰信息，通过串联质谱碎片离子的同位素谱峰的模式计算此碎片离子对应的分子式。本发明的方法可以提供碎片离子准确的分子式信息，可对鉴定多肽序列的数据库搜索方法提供的候选序列进行鉴别；以及为求解多肽序列的de novo方法产生高可靠候选序列提供依据。
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