公开(公告)号：CN116959610A

公开(公告)日：2023-10-27

申请号：CN202310832162.0

申请日：2023-07-06

Applicant: 中国科学院生态环境研究中心

Inventor： 邓晔 ,  杨兴盛 ,  王尚 ,  冯凯

IPC: G16C20/30 ,  G16C20/20

Abstract: 本申请提供一种推断环境系统中有机质分子转化的方法，包括：获取同一环境系统的多个样品；确定每个样品中有机质的分子式和相对丰度；根据所有样品确定的分子式构建分子式库；计算分子式库中每个分子对的分子差异；根据所有分子差异构建第一分子差异库；根据相对丰度计算每个分子差异对应的分子对的关联性系数；将关联性系数大于或等于第一预设值的分子对对应的分子差异组成第二分子差异库；计算第二分子差异库中每种分子差异的第二占比大于第一占比的显著性系数；筛选显著性系数小于第二预设值的分子差异作为该环境系统的分子转化。本申请提供的推断环境系统中有机质分子转化的方法，简单方便，可以快速有效推断发生的分子转化，可靠性强。

公开(公告)号：CN114381502B

公开(公告)日：2023-12-29

申请号：CN202111683745.9

申请日：2021-12-24

Applicant: 中国科学院生态环境研究中心

Inventor： 邓晔 ,  颜程良 ,  王尚 ,  沈文丽 ,  何晴

IPC: C12Q1/686 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q1/689 ,  C12N15/11 ,  C12R1/065

Abstract: 与物种进化间的联系。操作简单且成本低廉。本申请提供一种植物根际固氮菌多样性检测引物组、试剂盒及方法。方法包括：对采集的植物样本进行预处理，得到菌悬液；将经过细胞密度计算的菌悬液、乳化剂与融合PCR引物组混合，并在单细胞内将固氮功能基因和标记物种信息的基因连接并扩增，得到融合产物；对融合产物进行萃取，并用琼脂糖凝胶电泳，切胶纯化，得到纯化融合产物；以纯化融合产物为模板，与巢式PCR引物组混合后，反应得到巢式PCR产物；利用巢式PCR产物制备文库，并进行测序，根据测序结

公开(公告)号：CN114381502A

公开(公告)日：2022-04-22

申请号：CN202111683745.9

申请日：2021-12-24

Applicant: 中国科学院生态环境研究中心

Inventor： 邓晔 ,  颜程良 ,  王尚 ,  沈文丽 ,  何晴

IPC: C12Q1/686 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q1/689 ,  C12N15/11 ,  C12R1/065

Abstract: 本申请提供一种植物根际固氮菌多样性检测引物组、试剂盒及方法。方法包括：对采集的植物样本进行预处理，得到菌悬液；将经过细胞密度计算的菌悬液、乳化剂与融合PCR引物组混合，并在单细胞内将固氮功能基因和标记物种信息的基因连接并扩增，得到融合产物；对融合产物进行萃取，并用琼脂糖凝胶电泳，切胶纯化，得到纯化融合产物；以纯化融合产物为模板，与巢式PCR引物组混合后，反应得到巢式PCR产物；利用巢式PCR产物制备文库，并进行测序，根据测序结果分析植物根际固氮菌的多样性。能够在单细胞水平上将固氮功能基因与标记物种信息的基因连接起来，根据测序结果分析微生物的功能基因与物种进化间的联系。操作简单且成本低廉。