公开(公告)号：CN118995969A

公开(公告)日：2024-11-22

申请号：CN202411149856.5

申请日：2024-08-21

Applicant: 中国科学院生态环境研究中心

Inventor： 邓晔 ,  欧尤含·汉达 ,  何晴 ,  王丹蕊

IPC: C12Q1/689 ,  C12Q1/6895 ,  C12Q1/686 ,  C12N15/11

Abstract: 本申请提供一种定量土壤中真菌和细菌的引物探针组合、试剂盒、方法和应用，引物探针组合包括ITS探针和16S探针，在利用微滴数字PCR定量土壤中真菌和细菌时，16S引物对用于扩增细菌DNA，16S探针用于识别和检测细菌DNA的扩增产物并发出荧光信号，而ITS引物对用于扩增真菌DNA，ITS探针用于识别和检测真菌DNA的扩增产物并发出荧光信号，由于16S探针和ITS探针发出的荧光信号位于不同的荧光通道，因此就可以采用不同的荧光通道来分别对细菌DNA和真菌DNA进行检测，因此可以实现在同一个样本中准确且单独地测定细菌和真菌的含量。

公开(公告)号：CN114381502B

公开(公告)日：2023-12-29

申请号：CN202111683745.9

申请日：2021-12-24

Applicant: 中国科学院生态环境研究中心

Inventor： 邓晔 ,  颜程良 ,  王尚 ,  沈文丽 ,  何晴

IPC: C12Q1/686 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q1/689 ,  C12N15/11 ,  C12R1/065

Abstract: 与物种进化间的联系。操作简单且成本低廉。本申请提供一种植物根际固氮菌多样性检测引物组、试剂盒及方法。方法包括：对采集的植物样本进行预处理，得到菌悬液；将经过细胞密度计算的菌悬液、乳化剂与融合PCR引物组混合，并在单细胞内将固氮功能基因和标记物种信息的基因连接并扩增，得到融合产物；对融合产物进行萃取，并用琼脂糖凝胶电泳，切胶纯化，得到纯化融合产物；以纯化融合产物为模板，与巢式PCR引物组混合后，反应得到巢式PCR产物；利用巢式PCR产物制备文库，并进行测序，根据测序结

公开(公告)号：CN114381502A

公开(公告)日：2022-04-22

申请号：CN202111683745.9

申请日：2021-12-24

Applicant: 中国科学院生态环境研究中心

Inventor： 邓晔 ,  颜程良 ,  王尚 ,  沈文丽 ,  何晴

IPC: C12Q1/686 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q1/689 ,  C12N15/11 ,  C12R1/065

Abstract: 本申请提供一种植物根际固氮菌多样性检测引物组、试剂盒及方法。方法包括：对采集的植物样本进行预处理，得到菌悬液；将经过细胞密度计算的菌悬液、乳化剂与融合PCR引物组混合，并在单细胞内将固氮功能基因和标记物种信息的基因连接并扩增，得到融合产物；对融合产物进行萃取，并用琼脂糖凝胶电泳，切胶纯化，得到纯化融合产物；以纯化融合产物为模板，与巢式PCR引物组混合后，反应得到巢式PCR产物；利用巢式PCR产物制备文库，并进行测序，根据测序结果分析植物根际固氮菌的多样性。能够在单细胞水平上将固氮功能基因与标记物种信息的基因连接起来，根据测序结果分析微生物的功能基因与物种进化间的联系。操作简单且成本低廉。