一种应用于二代测序数据的STR分型方法

    公开(公告)号:CN119673273A

    公开(公告)日:2025-03-21

    申请号:CN202411745019.9

    申请日:2024-11-29

    Abstract: 本发明提供了一种应用于二代测序数据的STR分型方法,涉及生物技术领域。该方法具体为:定制STR基因座配置文件;构建STR基因座的侧翼序列k‑mer索引库;结合CIGAR值和k‑mer索引从序列比对文件的每条READ中提取STR等位基因序列;构建STR基因座的PCR影峰模型,用最大似然估计法估计PCR影峰模型的参数;使用二代测序样本数据集估计候选等位基因频率;利用给定序列比对文件提取的等位基因集合计算所有候选等位基因的后验概率,推断最有可能的等位基因。该STR分型方法的检出率和分型准确率更高,分型速度更快,可用于全基因组测序数据和高覆盖度靶向测序数据或扩增子测序数据。

    一种用于族源推断的SNP位点组合、检测引物对和应用

    公开(公告)号:CN118932076A

    公开(公告)日:2024-11-12

    申请号:CN202411109326.8

    申请日:2024-08-13

    Abstract: 本发明属于司法鉴定分子遗传学和人类学应用研究领域,具体涉及一种用于壮侗、苗瑶和阿尔泰语系群体进行族源推断的SNP位点组合、检测引物对及应用。该组合包括62个SNP位点,所选的位点在群体中均符合Hardy‑Weinberg平衡(经过Bonferroni校正),各位点不连锁,并处于连锁平衡状态;选择位点时使用来自三个不同语系群体(即壮侗,苗瑶和阿尔泰语系群体)的385个个体的参考人群集和每个个体70万SNP位点的芯片数据集,同时参考相关文献和法医学中广泛使用的分析手段进行验证,证实具有优秀的法医学推断效能;有利于进行未知生物检材个体族源和地理推断等法医学应用。

    一种用于亲子鉴定的SNP位点组合、及其检测引物对和应用

    公开(公告)号:CN117487932B

    公开(公告)日:2024-09-03

    申请号:CN202311567533.3

    申请日:2023-11-22

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属于司法鉴定分子遗传学应用研究领域,具体涉及一种用于亲子鉴定的SNP位点组合、及其检测引物对和应用。该SNP位点组合包括520个SNP位点,基于该SNP位点组合,所选的位点在群体中均符合Hardy‑Weinberg平衡(经过Bonferroni校正),各位点不连锁,并处于连锁平衡状态;选择位点时参考了不同数据库、相关文献并结合法医学中广泛使用的遗传标记,可获得更多的遗传信息及更高的法医学效能;有利于进行疑难生物检材个体识别与孕妇外周血产前亲子鉴定等法医学应用。

    一种用于亲子鉴定的SNP位点组合、及其检测引物对和应用

    公开(公告)号:CN117487932A

    公开(公告)日:2024-02-02

    申请号:CN202311567533.3

    申请日:2023-11-22

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属于司法鉴定分子遗传学应用研究领域,具体涉及一种用于亲子鉴定的SNP位点组合、及其检测引物对和应用。该SNP位点组合包括520个SNP位点,基于该SNP位点组合,所选的位点在群体中均符合Hardy‑Weinberg平衡(经过Bonferroni校正),各位点不连锁,并处于连锁平衡状态;选择位点时参考了不同数据库、相关文献并结合法医学中广泛使用的遗传标记,可获得更多的遗传信息及更高的法医学效能;有利于进行疑难生物检材个体识别与孕妇外周血产前亲子鉴定等法医学应用。

    一种MH标记组合及其检测引物对和应用

    公开(公告)号:CN117904326A

    公开(公告)日:2024-04-19

    申请号:CN202410265202.2

    申请日:2024-03-08

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明公开了一种MH标记组合及其检测引物对和应用,属于分子生物技术与遗传学技术领域,包括42个位于常染色体上的MH标记组合,本发明提供的MH多态性较SNP高,检测片段较STR遗传标记短,更适用于法医学检材的检测;可以利用二代测序技术完成测定,测序结果简单,数据易于解读,可溯源待测样本的身源信息;本发明提供的检测引物对可实现42个MH的并行检测,且灵敏度高、重复性好和抗干扰性高。

    一种现场精斑中精子自动染色识别设备

    公开(公告)号:CN118603702A

    公开(公告)日:2024-09-06

    申请号:CN202410975590.3

    申请日:2024-07-19

    Abstract: 本发明公开了一种现场精斑中精子自动染色识别设备,具体涉及法庭科学技术领域,包括操作台,操作台上表面固定连接有离心管架,离心管架内部设置有离心管,操作台一侧固定连接有精子自动染色机构;精子自动染色机构包括支撑柱,支撑柱顶部固定连接有转盘,转盘顶部活动连接有第一负压泵,第一负压泵两侧固定连接有固定架,第一负压泵输出端与输入端均连通有吸管,吸管一端固定连接有进样针;操作台上表面固定连接有第一固定环。本发明通过设置精子自动染色机构,使可疑精子悬浮液与精子染色液在混合筒的内部可以进行充分混合,使精子可以得到充分的染色,提高对精子染色的效率,减少操作人员的重复操作,提高使用便捷性。

Patent Agency Ranking