公开(公告)号：CN112111562A

公开(公告)日：2020-12-22

申请号：CN202011031593.X

申请日：2020-09-27

Applicant: 中国科学院上海微系统与信息技术研究所

Inventor： 陈世兴 ,  宋世平 ,  李铁 ,  王跃林

IPC: C12Q1/6806 ,  C12N15/10 ,  C40B50/06

Abstract: 本发明公开了一种表观遗传修饰核酸文库的构建方法及其应用，所述方法包括以下步骤：提供模板核酸，对所述模板核酸进行PCR扩增，得到含有磷酸修饰的PCR扩增产物；采用核酸外切酶对所述PCR扩增产物进行切割，消化掉含有磷酸修饰的一条链，得到无修饰的单链DNA；对所述单链DNA进行互补配对，然后在预设位点修饰表观修饰分子，得到修饰产物；将所述修饰产物中的短链延伸补齐，得到表观修饰核酸链。本发明可以实现在目标序列的任意位点产生单个或者多个表观修饰分子修饰，从而能够为研究表观修饰核苷酸在核酸链中的位置和丰度等相关技术或方法提供标准样本。

公开(公告)号：CN112029834A

公开(公告)日：2020-12-04

申请号：CN202011031587.4

申请日：2020-09-27

Applicant: 中国科学院上海微系统与信息技术研究所

Inventor： 陈世兴 ,  宋世平 ,  赵之涵 ,  李铁 ,  王跃林

IPC: C12Q1/6858 ,  C12Q1/6827

Abstract: 本发明公开了一种核酸羟甲基化修饰的检测方法及其应用，所述方法包括以下步骤：将核酸样品分为两份，分别为第一样品和第二样品；所述第一样品依次经过氧化反应、亚硫酸盐处理和PCR扩增，得到氧化硫化扩增物；所述第二样品依次经过亚硫酸盐处理和PCR扩增，得到硫化扩增物；将所述氧化硫化扩增物与所述硫化扩增物杂交产生错配，形成杂交结构；酶切割所述杂交结构，得到目标样品；采用生化传感器对所述目标样品进行定量检测。本发明利用错配切割酶识别由于氧化反应在羟甲基胞嘧啶位点产生的错配，借助电化学平台产生差别信号，能够检测基因中任意位点的羟甲基胞嘧啶变化情况，从而可以成为细胞分化、肿瘤发生及药物疗效等评估的关键技术和手段。