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公开(公告)号:CN116064870A
公开(公告)日:2023-05-05
申请号:CN202211361948.0
申请日:2022-11-02
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州优思达生物技术有限公司
Abstract: 本发明公开了碳青霉烯耐药基因及4种病原体核酸检测的引物组、试剂盒与方法,引物组包括用于检测碳青霉烯耐药基因及4种病原体核酸的引物对与探针,分别如SEQ IDNO.1‑SEQ ID NO.27所示。本发明的检测方法直接从直肠拭子样本中检测碳青霉烯耐药基因及4种病原体核酸,无需核酸提取步骤,具有耗时短、操作简便、覆盖率广、特异性好、防污染等优点。
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公开(公告)号:CN113817708A
公开(公告)日:2021-12-21
申请号:CN202111395841.3
申请日:2021-11-23
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州优思达生物技术有限公司
Abstract: 本发明公开了一种重组DNA聚合酶及其制备方法和应用,基于野生型DNA聚合酶I进行定点突变,通过逐步筛选,最终获得扩增效率较高的突变型DNA聚合酶。本发明的重组DNA聚合酶的方法是将含突变型DNA聚合酶编码基因的表达载体转化到大肠杆菌中,表达并纯化得到重组DNA聚合酶。通过该技术获得的重组DNA聚合酶相较于现有聚合酶在适用温度、扩增效率、DNA结合能力以及对干扰物的耐受能力均体现明显优势,并可应用于恒温扩增方法中检测核酸,具有广泛的应用前景。
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公开(公告)号:CN113817707A
公开(公告)日:2021-12-21
申请号:CN202111394888.8
申请日:2021-11-23
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州优思达生物技术有限公司
Abstract: 本发明公开了一种突变重组逆转录酶及其制备方法和应用,具体突变位点为:将野生型逆转录酶M‑MLV的第67位氨基酸从S突变为T,第303位氨基酸从F突变为R,第312位氨基酸从L突变为S,第432位氨基酸从L突变为G,第479位氨基酸从N突变为F,第524位氨基酸从D突变为Q。该酶是通过人工合成表达载体,利用优选的宿主细胞,经IPTG诱导表达获得。经改造后的一种重组突变型逆转录酶的活性温度为37‑65℃,逆转录效率是野生型逆转录酶的41.9倍,对常见干扰物的耐受能力明显提高。其性能明显优于野生型M‑MLV,并在与市场化M‑MLV的性能比较中显示出优势。
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公开(公告)号:CN113817707B
公开(公告)日:2022-02-22
申请号:CN202111394888.8
申请日:2021-11-23
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州优思达生物技术有限公司
Abstract: 本发明公开了一种突变重组逆转录酶及其制备方法和应用,具体突变位点为:将野生型逆转录酶M‑MLV的第67位氨基酸从S突变为T,第303位氨基酸从F突变为R,第312位氨基酸从L突变为S,第432位氨基酸从L突变为G,第479位氨基酸从N突变为F,第524位氨基酸从D突变为Q。该酶是通过人工合成表达载体,利用优选的宿主细胞,经IPTG诱导表达获得。经改造后的一种重组突变型逆转录酶的活性温度为37‑65℃,逆转录效率是野生型逆转录酶的41.9倍,对常见干扰物的耐受能力明显提高。其性能明显优于野生型M‑MLV,并在与市场化M‑MLV的性能比较中显示出优势。
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公开(公告)号:CN113817708B
公开(公告)日:2022-02-18
申请号:CN202111395841.3
申请日:2021-11-23
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州优思达生物技术有限公司
Abstract: 本发明公开了一种重组DNA聚合酶及其制备方法和应用,基于野生型DNA聚合酶I进行定点突变,通过逐步筛选,最终获得扩增效率较高的突变型DNA聚合酶。本发明的重组DNA聚合酶的方法是将含突变型DNA聚合酶编码基因的表达载体转化到大肠杆菌中,表达并纯化得到重组DNA聚合酶。通过该技术获得的重组DNA聚合酶相较于现有聚合酶在适用温度、扩增效率、DNA结合能力以及对干扰物的耐受能力均体现明显优势,并可应用于恒温扩增方法中检测核酸,具有广泛的应用前景。
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公开(公告)号:CN119753187A
公开(公告)日:2025-04-04
申请号:CN202510022446.2
申请日:2025-01-07
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 北京京东方知微生物科技有限公司
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6851 , C12N15/11 , C12R1/325 , C12R1/32
Abstract: 本发明提供了一种鉴定分枝杆菌菌种的引物探针组合、试剂盒及其鉴定方法和应用,属于生物技术领域。本发明的引物探针组合至少包括1对引物和1条探针用于鉴定鸟分枝杆菌和胞内分枝杆菌,6对引物和6条探针分别用于鉴定脓肿分枝杆菌、堪萨斯分枝杆菌、偶然分枝杆菌、海分枝杆菌/溃疡分枝杆菌、戈登分枝杆菌和瘰疬分枝杆菌,2对引物和2条探针用于鉴定结核分枝杆菌复合群,1对引物和1条探针用于鉴定内标。本发明可实现1个样本同步检测多个指标(最多9个指标),同时鉴定结核分枝杆菌复合群和多种非结核分枝杆菌;且检测灵敏度高,结核分枝杆菌复合群最低检出限为50CFU/mL,非结核分枝杆菌最低检出限为500CFU/mL。
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公开(公告)号:CN117708569A
公开(公告)日:2024-03-15
申请号:CN202410160852.0
申请日:2024-02-05
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州杰毅生物技术有限公司
IPC: G06F18/213 , G06F18/10 , G06F18/214 , G06F18/24 , G06N3/04 , G06N3/08
Abstract: 本发明涉及物种识别与数据处理技术领域,提供一种病原微生物信息的识别方法、装置、终端及存储介质,该方法包括:获取检测报告;对检测报告进行特征提取,获得初始特征数据;对初始特征数据进行处理,生成标准化特征向量;将标准化特征向量作为输入,利用训练好的识别模型进行识别,获得物种信息识别结果;识别模型包括至少一个泛化识别模型和至少一个高危识别模型,高危识别模型基于第一训练集训练得到,泛化识别模型基于第二训练集得到,第一训练集中的训练数据为第二训练集中经泛化识别模型识别后输出结果为指定类别的训练数据,本发明能够提高病原微生物信息的识别效率。
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公开(公告)号:CN115992267B
公开(公告)日:2023-11-03
申请号:CN202210832657.9
申请日:2022-07-15
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 北京金匙医学检验实验室有限公司
IPC: C12Q1/689 , C12N15/11 , C12Q1/6869 , C12R1/01 , C12R1/185 , C12R1/22 , C12R1/32 , C12R1/38 , C12R1/44 , C12R1/46 , C12R1/445
Abstract: 本发明“一种高通量高精度检出多种病原微生物的引物组合”属于分子生物学领域。所述一种高通量高精度检出多种病原微生物的引物组合,其特征在于,包括:引物池1、引物池2、引物池3;所述引物池1由引物对1、引物对2、引物对3、引物对4、引物组5组成;所述引物池2由引物对6、引物对7、引物对8、引物对9组成;所述引物池3由引物对10、引物组11、引物对12、引物对13、引物对14、引物对15、引物对16组成。基于本发明的引物组合构建的引物池可同时检测高达20种以上的微生物,且对无论人源样本还是微生物样本或质粒样本都能达到较高的灵敏度和精确度。
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公开(公告)号:CN116536436A
公开(公告)日:2023-08-04
申请号:CN202310538072.0
申请日:2023-05-12
Applicant: 予果生物科技(北京)有限公司 , 中国医学科学院北京协和医院
IPC: C12Q1/689 , C12N15/11 , C12Q1/6895 , C12Q1/6806 , C12R1/19 , C12R1/22 , C12R1/385 , C12R1/37 , C12R1/01 , C12R1/42 , C12R1/46 , C12R1/445 , C12R1/725
Abstract: 本发明属于生物检测技术领域,涉及一种用于血流感染多靶标检测的引物组及试剂盒,本发明提供的引物组提供了多个靶标,可高灵敏度地检测临床常见和高发微生物造成的侵袭性感染。本发明还提供了一种试剂盒,包含引物组和PCR缓冲液,两者组合能进一步提高检出限,并减少了后续测序检测微生物时样本DNA的损失,提高了样本DNA的得率。
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公开(公告)号:CN115938478B
公开(公告)日:2023-06-02
申请号:CN202310065146.3
申请日:2023-02-06
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州杰毅生物技术有限公司
Abstract: 本发明一种预测克雷伯氏菌属对阿米卡星敏感性的系统及方法属于生物信息技术领域。所述系统包括:计算单元;计算单元包括:计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序;所述计算机程序被处理器执行时实现一种Exp(‑k)幂值计算方法;所述Exp(‑k)幂值计算方法按下述计算步骤计算:S1:按下述公式I计算k值:公式I:;S2:求取以自然常数e为底数、以‑k为指数的Exp(‑k)幂值;C1‑C5分别为arr‑2、acrB、armA、oqxB、rmtB基因在待预测的克雷伯氏菌属菌株中的拷贝数。采用本发明的预测方法和预测系统进行克雷伯氏菌属对阿米卡星敏感性的预测的准确率约98.8%。
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