一种哺乳动物微小核糖核酸基因预测的方法

    公开(公告)号:CN102485904B

    公开(公告)日:2015-05-06

    申请号:CN201010572052.8

    申请日:2010-12-03

    Abstract: 本发明根据哺乳动物微小核糖核酸(microRNA)前体序列具有高度跨物种保守性的特点,从已知的微小核糖核酸序列出发,找到了一种可行的基于同源预测的微小核糖核酸基因鉴定的生物信息学方法,可直接针对微小核糖核酸基因进行锁定,以便于进一步的生物学实验验证。本发明主要包括如下流程:步骤1:获取已知哺乳动物的微小核糖核酸前体发卡环序列;步骤2:获得未知物种的基因组序列;步骤3:利用局部比对,从基因组内寻找微小核糖核酸的同源序列;步骤4:根据一定的标准筛选潜在的前体序列;步骤5:利用核糖核酸(RNA)二级结构折叠软件生成二级结构;步骤6:计算二级结构自由能,筛选合格微小核糖核酸前体;步骤7:预测微小核糖核酸成熟体。最终,对于感兴趣的微小核糖核酸,可以直接进行实验验证。

    一种基于自然语言处理系统的microRNA靶基因的筛选方法

    公开(公告)号:CN102375840A

    公开(公告)日:2012-03-14

    申请号:CN201010258148.7

    申请日:2010-08-19

    Inventor: 陈喆 吴剑丙 刘培

    Abstract: 本发明利用计算机自然语言处理系统,找到了一种可以从已有文献中筛选微小RNA(microRNA)靶基因的生物信息学方法,可以免除中间实验的繁烦步骤,直接针对目标基因进行锁定,以便于进一步的实验验证。本发明主要包括如下流程:步骤1:选定特定的研究对象和microRNA。步骤2:引入文献挖掘技术,搜索相关基因。步骤3:对microRNA进行靶基因预测,整理成列表。步骤4:整合步骤三与步骤四的基因列表,并构建基因相互作用关系网络。步骤5:分析步骤四中基因的连接度,寻找节点基因,筛选出microRNA的关键靶基因。步骤6:实验验证。

    丹参二萜醌有效部位及其逆流色谱制备方法和癌症治疗应用

    公开(公告)号:CN103479723A

    公开(公告)日:2014-01-01

    申请号:CN201310366663.0

    申请日:2013-08-21

    Abstract: 本发明属于中医药技术领域,涉及一种丹参二萜醌有效部位及其逆流色谱制备方法和癌症治疗应用。它解决了现有技术提取难度较大,品质难以控制,有效部位提取率不高等技术问题。制备方法包括:A、提取:以丹参为原料,采用超临界流体萃取法或溶剂提取法对丹参提取,得到丹参总二萜醌;B、分离:将上述丹参总二萜醌进行高速逆流色谱半制备分离,收集富含隐丹参酮的流分,减压回收逆流色谱溶剂,干燥,得到丹参二萜醌有效部位。其优点在于:丹参二萜醌有效部位生理活性强,含有多个在生物医药领域具有广阔应用前景的迈克尔反应受体分子。有效部位,多个成分之间具有“多组分、多靶点”的协同作用,能够一定程度上代表丹参药材的功效。

Patent Agency Ranking