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公开(公告)号：CN106480208B
公开(公告)日：2019-09-10
申请号：CN201611019129.2
申请日：2016-11-18
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了一种基于信号谱差异的混合样本单核苷酸多态性的检测方法，该方法首先利用一种两核苷酸实时合成测序技术对野生型样本和混合样本分别进行三轮独立测序，获得三组信号谱；然后根据三轮测序实验获得的野生型样本与混合样本的信号谱，计算野生型样本与混合样本的信号谱之间的差异，并采用枚举方法推断混合样本中可能存在的单核苷酸多态性位点；最后综合分析三轮测序实验所检测出的可能的单核苷酸多态性位点，进行一致性判断，如果混合样本中含有单核苷酸多态性位点，则归纳出其位置、突变核苷酸及其比例。本发明相比于现有技术，具有更高的准确度；两核苷酸的循环添加顺序不需要经过复杂的实验设计，实验更容易操作，成本低廉。
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公开(公告)号：CN104894246A
公开(公告)日：2015-09-09
申请号：CN201510262137.9
申请日：2015-05-21
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种两核苷酸合成测序分析多模板PCR产物的方法。该方法对同一PCR产物均匀分成至少两份，进行两核苷酸合成测序，每个测序反应得到包括两核苷酸种类及其核苷酸合成数目的测序编码信息，选择三组中至少两组不同两核苷酸合成循环测序分别得到的至少两组编码信息进行解码，最后通过关联分析确定PCR产物的不同DNA模板含量。本发明拓宽了单核苷酸合成测序的分析范围，适合多模板PCR产物、以及混合样本PCR产物的序列分析，可以直接测定样本中各个DNA模板的比例，也可以用于从大规模样本中寻找、筛选核酸标志物。
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公开(公告)号：CN104894246B
公开(公告)日：2018-03-20
申请号：CN201510262137.9
申请日：2015-05-21
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/686
Abstract: 本发明公开了一种两核苷酸合成测序分析多模板PCR产物的方法。该方法对同一PCR产物均匀分成至少两份，进行两核苷酸合成测序，每个测序反应得到包括两核苷酸种类及其核苷酸合成数目的测序编码信息，选择三组中至少两组不同两核苷酸合成循环测序分别得到的至少两组编码信息进行解码，最后通过关联分析确定PCR产物的不同DNA模板含量。本发明拓宽了单核苷酸合成测序的分析范围，适合多模板PCR产物、以及混合样本PCR产物的序列分析，可以直接测定样本中各个DNA模板的比例，也可以用于从大规模样本中寻找、筛选核酸标志物。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN106480208A
公开(公告)日：2017-03-08
申请号：CN201611019129.2
申请日：2016-11-18
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种基于信号谱差异的混合样本单核苷酸多态性的检测方法，该方法首先利用一种两核苷酸实时合成测序技术对野生型样本和混合样本分别进行三轮独立测序，获得三组信号谱；然后根据三轮测序实验获得的野生型样本与混合样本的信号谱，计算野生型样本与混合样本的信号谱之间的差异，并采用枚举方法推断混合样本中可能存在的单核苷酸多态性位点；最后综合分析三轮测序实验所检测出的可能的单核苷酸多态性位点，进行一致性判断，如果混合样本中含有单核苷酸多态性位点，则归纳出其位置、突变核苷酸及其比例。本发明相比于现有技术，具有更高的准确度；两核苷酸的循环添加顺序不需要经过复杂的实验设计，实验更容易操作，成本低廉。
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公开(公告)号：CN104313168A
公开(公告)日：2015-01-28
申请号：CN201410605987.X
申请日：2014-10-30
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6869 , C12Q2535/101 , C12Q2565/301
Abstract: 本发明采用一种引物选择合成测序分析PCR产物单体型的方法对两个或者两个以上位点变化（如SNP，突变等）的PCR产物（多个DNA模板）进行单体型分析，PCR产物被特定测序引物杂交后分成两份，各自加入一种3’端封闭的单体试剂，测序引物在DNA模板指导下延伸位点发生变化的一个碱基后，该测序引物3’端被封闭而不能继续延伸，然后对未封闭的引物继续合成测序，得到特定DNA模板的序列信息,从而确定PCR产物的单体型。
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公开(公告)号：CN104762406A
公开(公告)日：2015-07-08
申请号：CN201510198271.7
申请日：2015-04-23
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种两核苷酸不同步合成测序分析PCR产物单体型的方法。通过两核苷酸实时合成测序，每个测序反应同时代加入两个不同的核苷酸，且PCR产物中不同DNA模板的合成测序不同步，使得相邻两个SNP位点上不同碱基的信息是由不同测序反应所提供。根据这些不同步合成测序反应所得到的不同SNP位点上的测序信息进行关联分析，确定PCR产物单体型。本发明拓广了分析范围，操作简单、可以降低分析成本；适合多个混合样本的单体型分析，可以直接测定混合样本中各个单体型的比例，可以用于从大规模样本中寻找、筛选核酸标志物。
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公开(公告)号：CN104762406B
公开(公告)日：2017-08-25
申请号：CN201510198271.7
申请日：2015-04-23
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种两核苷酸不同步合成测序分析PCR产物单体型的方法。通过两核苷酸实时合成测序，每个测序反应同时代加入两个不同的核苷酸，且PCR产物中不同DNA模板的合成测序不同步，使得相邻两个SNP位点上不同碱基的信息是由不同测序反应所提供。根据这些不同步合成测序反应所得到的不同SNP位点上的测序信息进行关联分析，确定PCR产物单体型。本发明拓广了分析范围，操作简单、可以降低分析成本；适合多个混合样本的单体型分析，可以直接测定混合样本中各个单体型的比例，可以用于从大规模样本中寻找、筛选核酸标志物。
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公开(公告)号：CN104313168B
公开(公告)日：2016-11-30
申请号：CN201410605987.X
申请日：2014-10-30
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明采用一种引物选择合成测序分析PCR产物单体型的方法对两个或者两个以上位点变化（如SNP，突变等）的PCR产物（多个DNA模板）进行单体型分析，PCR产物被特定测序引物杂交后分成两份，各自加入一种3’端封闭的单体试剂，测序引物在DNA模板指导下延伸位点发生变化的一个碱基后，该测序引物3’端被封闭而不能继续延伸，然后对未封闭的引物继续合成测序，得到特定DNA模板的序列信息,从而确定PCR产物的单体型。
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