公开(公告)号：CN110415764A

公开(公告)日：2019-11-05

申请号：CN201910675977.6

申请日：2019-07-25

Applicant: 东南大学

Inventor： 陈瑞 ,  恽俊 ,  李晓波 ,  高娜

IPC: G16B20/00 ,  G16B25/00 ,  G16B50/30

Abstract: 本发明公开了一种多数据平台发现长链非编码RNA分子标志物运用ceRNA机制的方法及系统和应用。基于TANRIC公共数据资源的直肠癌LncRNA测序数据，运用多样的生物信息学分析手段，对LncRNA表达数据进行分析处理，识别与直肠癌相关的LncRNA，对LncRNA相关ceRNA机制探究，最终形成LncRNA-miRNA-mRNA-疾病互作图。本发明采用丰富多样的生物信息学手段，整合数据资源，建立一套完整的分析流程，可有效发现直肠癌相关LncRNA分子通过ceRNA机制发挥其生物效应，在此过程中利用了公共数据库高通量数据，降低科研成本，提高分析效率。本发明可发现多个风险LncRNA，对复杂疾病的生物靶向治疗、基因功能预测、ceRNA机制探究及基因生物效应与预后评估都有重要意义，可广泛应用于生物学研究工作中，也可用于临床相关应用。