公开(公告)号：CN118298925A

公开(公告)日：2024-07-05

申请号：CN202410490998.1

申请日：2024-04-23

Applicant: 东北林业大学

Inventor： 孙善文 ,  乔白雪 ,  解雪莹 ,  李丹阳 ,  邹权 ,  汪国华 ,  张庆祝 ,  王江 ,  解莉楠

IPC: G16B40/00 ,  G16B10/00 ,  G16B20/00 ,  G16B30/00 ,  G06N3/0442 ,  G06N3/045 ,  G06N3/0464 ,  G06N3/048 ,  G06N3/096

Abstract: 基于迁移学习的植物NLR‑无毒蛋白Avr对应关系识别方法，涉及蛋白质互作识别领域。本发明是为了解决由于现有NLR和无毒蛋白对应关系识别方法还存在识别成本高、单位时间内识别效率低导致NLR在抗性育种中应用受限的问题。本发明包括：利用已知对应关系的NLR‑Avr蛋白质序列对构建蛋白质序列对数据集，并将蛋白质序列对数据集划分为训练集和验证集；利用训练集训练Avr‑BAN模型，获得训练好的Avr‑BAN模型，利用验证集对训练好的Avr‑BAN模型验证，获得植物NLR‑待测无毒蛋白预测模型；将待测植物NLR和待测无毒蛋白输入到植物NLR‑待测无毒蛋白预测模型中，获得待测植物NLR和待测无毒蛋白的对应关系概率；本发明用于预测植物NLR和无毒蛋白Avr的对应关系。