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公开(公告)号：CN119943139A
公开(公告)日：2025-05-06
申请号：CN202510028577.1
申请日：2025-01-08
Applicant: 东北林业大学
Abstract: 本发明提出了一种基于DNA甲基化异质性指标构建的表观遗传时钟计算模型及构建方法，属于生物信息学技术领域。本发明基于粪便中DNA甲基化异质性指标构建了一种表观遗传时钟计算模型，DNA甲基化异质性指标包括甲基化熵指标、表观多态性指标、不一致读取对比例指标和不一致读取对的定量比例指标，解决了现有技术中对野生动物或大型动物年龄估算方法存在材料获取困难、CpG位点检测困难和年龄估算方法较为复杂等问题。本发明提供的表观遗传时钟计算模型准确性更高、简便快捷。
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公开(公告)号：CN119446276A
公开(公告)日：2025-02-14
申请号：CN202411473531.2
申请日：2024-10-22
Applicant: 东北林业大学
Abstract: 本发明提出了一种表观遗传时钟计算模型及构建方法，属于生物信息学技术领域。本发明通过以东北虎为例，以其粪便为材料搭建DNA甲基化与年龄(月龄)的数学关系，提供了一种表观遗传时钟的计算模型剂构建方法，解决了现有技术中对大型动物(包括野生动物)计算年龄所需材料不易获取的问题。本发明的表观遗传时钟的计算模型应用于计算大型动物或野生动物的年龄，本发明所选取材料为粪便是非损伤、易获得的材料，并且本发明计算年龄的准确性高于传统方法中利用血液的计算方法。
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公开(公告)号：CN117721219A
公开(公告)日：2024-03-19
申请号：CN202311778967.8
申请日：2023-12-22
Applicant: 东北林业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/12 , C12N15/53 , C12Q1/686 , C12Q1/6869 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及野生动物物种鉴定领域，尤其涉及指基于线粒体DNA多区段扩增子高通量测序的通用性鉴定鸟类物种的分子标记、引物及其应用通用性鉴定鸟类物种的分子标记、引物及其应用，并评估该方法在单一鸟类样本和混合鸟类样本中的灵敏度和适用性；本发明在线粒体多个DNA条形码标记上设计引物，这些引物在鸟类中具有普遍适用性，并有助于在降解样本中识别鸟类，相较于现有的鉴定方法，该方法不仅可以对单一鸟类样本进行物种鉴定，并且可解决鸟类混合样本鉴定的问题，实现了高灵敏度、高通量、节省试剂和珍贵样本等特点。
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公开(公告)号：CN117144021A
公开(公告)日：2023-12-01
申请号：CN202311187311.9
申请日：2023-09-14
Applicant: 东北林业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供了一种鉴别环颈雉来源的方法，其包括如下步骤：提取野生环颈雉和圈养环颈雉不同骨骼肌差异显著的基因位点；针对所述基因位点进行甲基化敏感性高分辨率熔解检测，并验证甲基化位点；设计相应的引物进行PCR扩增；构建不同引物的甲基化率标准曲线，以及样本甲基化Tm值得到差异甲基化位点，获得各位点的单点判别力和联合判别力；通过野生和圈养之间的差异达到鉴别环颈雉的来源；本发明提供一种利用甲基化敏感性高分辨率熔解技术定量检测环颈雉不同骨骼肌差异基因位点的甲基化率，通过在野生和圈养两组之间的差异达到鉴别环颈雉来源的方法，可应用于更多动物甲基化差异位点的筛选。
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公开(公告)号：CN113186185B
公开(公告)日：2023-05-26
申请号：CN202010037073.3
申请日：2020-01-14
Applicant: 东北林业大学 , 深圳华大生命科学研究院
IPC: C12N15/10
Abstract: 一种从哺乳动物粪便中高效富集宿主DNA的方法，属于分子生物学技术领域。针对目前哺乳动物粪便样本提取DNA时，宿主DNA富集效率低、对陈旧粪便提取效果差、大量细菌DNA的残留严重干扰后续反应，而且成本居高不下等问题，本发明提供了一种从粪便中高效富集宿主DNA的方法，在提取前，对粪便样本进行SDS预处理：将粪便样本与10mmol/L磷酸缓冲液PBS溶液混合后，加入SDS溶液至终浓度为0.01％～5％(质量)混匀，在室温下静置1min～30min；然后离心取上清，从上清液中提取DNA。本发明成本低廉，不受样本数量的限制，拓展了粪便样本在动物研究和保护监测中的应用。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN101792816B
公开(公告)日：2012-01-11
申请号：CN201010151089.3
申请日：2010-04-20
Applicant: 东北林业大学
Abstract: 扩增貂属物种细胞色素b基因的引物及鉴别紫貂、松貂的方法，它涉及一种引物及物种鉴别方法。本发明解决了现有的紫貂、松貂形态学鉴别方法容易误判的问题。引物由上游引物和下游引物组成；方法：一、提取DNA，然后进行PCR扩增；二、酶切；三、电泳检测。取动物的皮、骨骼、肌肉和爪作为生物检材，然后用本发明的鉴别方法进行检测，其检测结果准确率达100%。本发明的方法不仅可以用于野生动物执法，还可以应用在商检中。
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公开(公告)号：CN101792816A
公开(公告)日：2010-08-04
申请号：CN201010151089.3
申请日：2010-04-20
Applicant: 东北林业大学
Abstract: 扩增貂属物种细胞色素b基因的引物及鉴别紫貂、松貂的方法，它涉及一种引物及物种鉴别方法。本发明解决了现有的紫貂、松貂形态学鉴别方法容易误判的问题。引物由上游引物和下游引物组成；方法：一、提取DNA，然后进行PCR扩增；二、酶切；三、电泳检测。取动物的皮、骨骼、肌肉和爪作为生物检材，然后用本发明的鉴别方法进行检测，其检测结果准确率达100%。本发明的方法不仅可以用于野生动物执法，还可以应用在商检中。
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公开(公告)号：CN119943137A
公开(公告)日：2025-05-06
申请号：CN202510034870.9
申请日：2025-01-09
Applicant: 东北林业大学
Abstract: 本发明提出了一种基于粪便mtDNA异质性指标计算年龄的模型及构建方法，属于生物信息学技术领域。本发明通过构建一种基于粪便中DNA的mtDNA异质性指标与年龄相关的计算模型，mtDNA异质性指标包括，mtDNA异质性位点不一致读数比率、mtDNA异质性位点碱基突变多样性和mtDNA异质性位点的不一致读对比率的定量，解决了现有技术中所需材料不宜获得及成本较高的问题。本发明计算年龄的模型与现有技术相比，所需材料不会对动物造成损伤并且比较容易获得，检测成本低且准确性高，可为更多动物的年龄鉴定方法提供借鉴。
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公开(公告)号：CN119776537A
公开(公告)日：2025-04-08
申请号：CN202411900829.7
申请日：2024-12-23
Applicant: 东北林业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6869 , G16B20/20 , G16B30/10
Abstract: 本发明提出了一种遗传标记及其在华南虎个体识别中的应用，属于分子鉴定技术领域。本发明提供了一种遗传标记包括解决了300个SNP分子标记，其可应用华南虎个体识别中，并提供了个体识别的方法。本发明解决了传统RFID芯片在个体身份识别上的不足的问题。同时，也解决了现有分子鉴定主要依赖STR和SNP位点扩增、前期需设计大量特异性引物并反复优化、过程繁琐且费时的问题。建立了一个便捷、可靠且成本低的华南虎个体身份识别方法，为遗传管理和种群保护提供了强有力的技术支持。
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公开(公告)号：CN119020463A
公开(公告)日：2024-11-26
申请号：CN202411437639.6
申请日：2024-10-15
Applicant: 东北林业大学
IPC: C12Q1/6806 , C40B50/06
Abstract: 一种动物毛发样本基因组DNA文库的构建方法，属于基因测序技术领域。本发明为解决现有技术中缺少针对于不同类型、不同储存时间及鞣制程度的动物毛发基因组DNA文库构建方法，提供了一种动物毛发样本基因组DNA文库的构建方法，通过对动物毛发样本DNA进行末端修复与加A尾处理，以及加接头处理，纯化和质检处理，获得DNA测序文库。本发明提供的动物毛发样本基因组DNA文库的构建方法，适合所有类型的毛发组织，提高了有效文库的比例，减少了基因组DNA测序的成本，为毛发的基因组DNA在动物的遗传与进化的研究中得到广泛应用提供了理论依据。
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