公开(公告)号：CN115295081A

公开(公告)日：2022-11-04

申请号：CN202211085757.6

申请日：2022-09-06

Applicant: 东北林业大学

Inventor： 王泽钰 ,  孙善文 ,  汪国华 ,  庞韶姿 ,  史婷婷 ,  孙家翔 ,  赵依萱

IPC: G16B30/00 ,  G16B40/00 ,  G06N5/00

Abstract: 一种植物抗盐碱基因的识别方法及系统，具体涉及一种基于机器学习的植物抗盐碱基因的识别方法及系统，为解决抗盐碱基因识别方法依赖植物同源基因的识别，识别结果假阳性率和假阴性率都很高，导致植物抗盐碱功能基因识别准确率低的问题，它包括获取若干条已知是否为抗盐碱基因的植物蛋白序列；获取植物蛋白序列的特征向量；构建C4.5算法模型，用特征向量对C4.5算法模型进行训练，输出基因是否为抗盐碱基因，得到训练好的C4.5算法模型；对待识别的植物蛋白序列执行S2，得到特征向量，将特征向量输入训练好的C4.5算法模型，得到待识别的植物蛋白序列是否含有抗盐碱基因。所述系统执行如所述方法的任一步骤。属于基因识别领域。

公开(公告)号：CN116259363A

公开(公告)日：2023-06-13

申请号：CN202310255871.7

申请日：2023-03-16

Applicant: 东北林业大学

Inventor： 刘轩睿 ,  乔白雪 ,  孙善文 ,  汪国华 ,  邹权 ,  史婷婷 ,  解莉楠 ,  张庆祝 ,  王江 ,  李易奇 ,  谷家世 ,  幸家弘

IPC: G16B30/00 ,  G16B40/20 ,  G06N3/0442 ,  G06N3/047 ,  G06N3/08 ,  G06N3/084

Abstract: 一种基于深度学习的植物抗旱基因的识别方法，为了解决现有的植物抗旱基因识别方法耗时长，成本大或过度依赖序列同源性，导致预测结果准确率低的问题。它包括以下步骤：首先获取不同植物的氨基酸序列及其对应的样本标签，样本标签为是否具有抗旱基因；将每条氨基酸序列分为多个长度为2的kmer，根据kmer提取每条氨基酸序列的特征；构建的BiLSTM‑Attention模型依次包括输入层、词嵌入层、特征提取层、注意力层和输出层，将每条氨基酸序列的特征输入BiLSTM‑Attention模型中进行训练，输出所述氨基酸序列是否具有抗旱基因。属于基因识别领域。