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公开(公告)号：CN106202969B
公开(公告)日：2018-10-23
申请号：CN201610616774.6
申请日：2016-08-01
Applicant: 东北大学
Abstract: 一种肿瘤分子分型预测系统，包括：基因表达数据提取模块：获取肿瘤基因表达数据；缺失值预处理器：对获取肿瘤基因表达数据进行缺失值填充；重要基因提取模块：提取肿瘤基因表达数据中决定生存时间的肿瘤重要基因；US‑ELM分子分型模块：利用US‑ELM对肿瘤重要基因数据进行肿瘤分子分型预测。本发明的肿瘤分子分型预测系统，克服了以往的针对肿瘤分子分型技术方法速度慢、泛化性能差、分类准确率低的缺陷，实现了快速且分类准确率高的肿瘤分子分型预测，并且能够对多个类别的肿瘤进行无监督机器学习。利用本发明系统进行肿瘤分子分型预测，能更好的判断肿瘤生物学行为，本发明的直接目的不是得到诊断结果，而是为制定个性化治疗方案提供参考依据。
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公开(公告)号：CN107368707B
公开(公告)日：2020-07-10
申请号：CN201710596384.1
申请日：2017-07-20
Applicant: 东北大学
Abstract: 本发明的基于US‑ELM的基因芯片表达数据分析系统及方法包括，基因预处理单元，用于对基因芯片进行预处理以获得适用于实验的数据格式；差异基因筛选单元，基于基因表达数据矩阵寻找在基因芯片中不同个体或者是不同组织中表达发生明显变化的差异基因，获得差异表达基因矩阵；聚类单元，用于对差异表达基因矩阵进行聚类分析，得到共表达基因序列；富集分析单元，用于对共表达基因序列进行富集分析，得到关于基因所参与的多条通路，得出在数据上共表达基因序列的生物学功能解释。本发明的分析系统及方法整体上提高了数据分析的准确性，差异基因处理过程筛选出更有效的明显表达差异基因，聚类处理中得出的类别在生物学解释上具有更多的相似性。
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公开(公告)号：CN106202969A
公开(公告)日：2016-12-07
申请号：CN201610616774.6
申请日：2016-08-01
Applicant: 东北大学
IPC: G06F19/00
CPC classification number: G16H50/20
Abstract: 一种肿瘤分子分型预测系统，包括：基因表达数据提取模块：获取肿瘤基因表达数据；缺失值预处理器：对获取肿瘤基因表达数据进行缺失值填充；重要基因提取模块：提取肿瘤基因表达数据中决定生存时间的肿瘤重要基因；US-ELM分子分型模块：利用US-ELM对肿瘤重要基因数据进行肿瘤分子分型预测。本发明的肿瘤分子分型预测系统，克服了以往的针对肿瘤分子分型技术方法速度慢、泛化性能差、分类准确率低的缺陷，实现了快速且分类准确率高的肿瘤分子分型预测，并且能够对多个类别的肿瘤进行无监督机器学习。利用本发明系统进行肿瘤分子分型预测，能更好的判断肿瘤生物学行为，本发明的直接目的不是得到诊断结果，而是为制定个性化治疗方案提供参考依据。
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公开(公告)号：CN107368707A
公开(公告)日：2017-11-21
申请号：CN201710596384.1
申请日：2017-07-20
Applicant: 东北大学
Abstract: 本发明的基于US-ELM的基因芯片表达数据分析系统及方法包括，基因预处理单元，用于对基因芯片进行预处理以获得适用于实验的数据格式；差异基因筛选单元，基于基因表达数据矩阵寻找在基因芯片中不同个体或者是不同组织中表达发生明显变化的差异基因，获得差异表达基因矩阵；聚类单元，用于对差异表达基因矩阵进行聚类分析，得到共表达基因序列；富集分析单元，用于对共表达基因序列进行富集分析，得到关于基因所参与的多条通路，得出在数据上共表达基因序列的生物学功能解释。本发明的分析系统及方法整体上提高了数据分析的准确性，差异基因处理过程筛选出更有效的明显表达差异基因，聚类处理中得出的类别在生物学解释上具有更多的相似性。
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