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公开(公告)号:CN108531597A
公开(公告)日:2018-09-14
申请号:CN201810416417.4
申请日:2018-05-03
Applicant: 上海交通大学医学院附属第九人民医院
IPC: C12Q1/6886
Abstract: 本发明涉及基因检测技术领域,公开了一种用于口腔鳞癌早期诊断的检测试剂盒,包括11种基因:MMP1、PLAU、SPP1、KRT15、NUM、IL1RN、HOPX、TGM3、KRT13、MAL、EMP1的mRNA序列的上、下游引物序列。本发明还公开了一种筛选用于口腔鳞癌早期诊断的基因或基因组合方法。本发明是首次提出的用于口腔鳞癌早期诊断的检测试剂盒,能客观、及早、准确、灵敏地确诊口腔鳞癌,从而有助于提高口腔鳞癌患者生存率。
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公开(公告)号:CN114693692B
公开(公告)日:2025-01-10
申请号:CN202210330890.7
申请日:2022-03-30
Applicant: 上海交通大学医学院附属第九人民医院
IPC: G06T7/10 , G06V10/764 , G06V10/82 , G06N3/0464 , G06N3/08
Abstract: 本申请提供的一种病理图像分割分级方法、装置和设备,通分将包含特异性病理染色标志物的原始病理图像进行经过HE‑Norm处理,分别得到H通道图像和E通道图像,并分别进行数据增强处理与标准化处理;输入卷积神经网络模型中以进行病变区域自动分割得到分割结果;将图像与分割结果输入分类器以得到病变程度的分级结果;根据分割结果和分级结果生成对应不同病变等级的分割图像。本申请能提高病理诊断的效率和准确性,对转移判断、预后预测、用药指导等进行支持,提高临床科室产能的同时为患者带来福音。
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公开(公告)号:CN113113150A
公开(公告)日:2021-07-13
申请号:CN202110406089.1
申请日:2021-04-15
Applicant: 上海交通大学医学院附属第九人民医院
Abstract: 本申请提供的一种淋巴结转移预测模型构建与训练方法、装置、设备和介质,本申请通分别获取多个转录组样本测序数据或多个miRNA样本测序数据,并从中筛选出m个转录组标记物或n个miRNA标记物;根据留一交叉验证法将样本测序数据分为训练集与测试集;判断是否发生淋巴结转移以计算二值化的转移值,并进行去均值的归一化处理,进行偏最小二乘回归模型和逻辑回归模型的建立,将测试集score值作为预测结果,得到测试集的逻辑回归预测值;循环M次以完成淋巴结转移预测模型的训练。本申请通过将标记物的表达矩阵带入机器学习模型,可实现对淋巴结转移的判断,利用转录组和miRNA两个层面数据,可将AUC提高到了90%以上,极大提高了诊断效率。
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公开(公告)号:CN108546761A
公开(公告)日:2018-09-18
申请号:CN201810415762.6
申请日:2018-05-03
Applicant: 上海交通大学医学院附属第九人民医院
IPC: C12Q1/6886
CPC classification number: C12Q1/6886 , C12Q2600/118 , C12Q2600/158
Abstract: 本发明涉及基因检测技术领域,公开了一种用于口腔鳞癌淋巴结转移预测的检测试剂盒,包括7种基因:PDGFRA、PLAU、SOX9、SPP1、CDKN2A、CASP1、MAL的上、下游引物序列。本发明还公开了一种筛选用于口腔鳞癌淋巴结转移预测的基因或基因组合的方法。本发明的检测试剂盒,能客观、准确、灵敏地预测口腔鳞癌淋巴结转移情况,从而有助于提高口腔鳞癌患者生存率。
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公开(公告)号:CN114693692A
公开(公告)日:2022-07-01
申请号:CN202210330890.7
申请日:2022-03-30
Applicant: 上海交通大学医学院附属第九人民医院
Abstract: 本申请提供的一种病理图像分割分级方法、装置和设备,通分将包含特异性病理染色标志物的原始病理图像进行经过HE‑Norm处理,分别得到H通道图像和E通道图像,并分别进行数据增强处理与标准化处理;输入卷积神经网络模型中以进行病变区域自动分割得到分割结果;将图像与分割结果输入分类器以得到病变程度的分级结果;根据分割结果和分级结果生成对应不同病变等级的分割图像。本申请能提高病理诊断的效率和准确性,对转移判断、预后预测、用药指导等进行支持,提高临床科室产能的同时为患者带来福音。
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公开(公告)号:CN108546761B
公开(公告)日:2019-08-13
申请号:CN201810415762.6
申请日:2018-05-03
Applicant: 上海交通大学医学院附属第九人民医院
IPC: C12Q1/6886
Abstract: 本发明涉及基因检测技术领域,公开了一种用于口腔鳞癌淋巴结转移预测的检测试剂盒,包括7种基因:PDGFRA、PLAU、SOX9、SPP1、CDKN2A、CASP1、MAL的上、下游引物序列。本发明还公开了一种筛选用于口腔鳞癌淋巴结转移预测的基因或基因组合的方法。本发明的检测试剂盒,能客观、准确、灵敏地预测口腔鳞癌淋巴结转移情况,从而有助于提高口腔鳞癌患者生存率。
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