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公开(公告)号：CN104237530B
公开(公告)日：2016-01-06
申请号：CN201410377168.4
申请日：2014-08-01
Applicant: 上海交通大学医学院附属瑞金医院
IPC: G01N33/68
Abstract: 本发明公开准确快速实现表型筛选所获得活性化合物药物靶点鉴定的方法，利用化学蛋白质组学驱动的秀丽线虫feeding RNAi技术建立化合物表型筛选和靶点鉴定的无缝对接，所述活性化合物是指线虫中有相应表型的活性化合物，所述表型包括但不限于脂质代谢障碍、细胞凋亡、自吞噬、衰老、神经退行性病变，抗感染。本发明不仅解决了目前困扰单纯运用蛋白质组学手段分析药物互作蛋白容易产生的假阳性和假阴性问题，能够实现去伪存真，并且操作简便，筛选快速、精确，为实现大通量的药物互作蛋白的分析提供了可行方案，形成了更完善的化学蛋白质组学技术体系，为突破表型筛选蛋白质靶点鉴定的瓶颈提供了可能。
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公开(公告)号：CN101135664A
公开(公告)日：2008-03-05
申请号：CN200710046707.6
申请日：2007-09-29
Applicant: 上海交通大学医学院附属瑞金医院
IPC: G01N27/447 , G01N33/68 , G01N33/561 , G06F17/12
Abstract: 本发明提供了一组用于区分I、II期和III、IV期结直肠癌的蛋白标志物，包括SerpinB1、PCNA和PPIase B三种蛋白，还提供了一种利用上述蛋白标志物区分I、II期和III、IV期结直肠癌的方法，包括步骤：用二维电泳技术对样品全蛋白进行定量蛋白质组学分析，获得蛋白凝胶图像，从而获得上述蛋白的灰度值，代入下列判别方程：F1＝0.032×Serpin B1+0.012×PCNA+0.001×PPIase B－12.186，F2＝0.008×Serpin B1+0.004×PCNA+0.003×PPIase B－6.033，如果F1＞F2，则可以判断样品属于I期或II期结直肠癌；如果F1＜F2，则可以判断样品属于III期或IV期结直肠癌，本发明的该组蛋白标志物可以准确区分I、II期和III、IV期结直肠癌，由此将降低I、II期结直肠癌患者的术前机体负担和经济负担，提高III、IV期结直肠癌患者的手术根治效果和生存率。
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公开(公告)号：CN103776909B
公开(公告)日：2015-03-18
申请号：CN201210398526.0
申请日：2012-10-18
Applicant: 上海交通大学医学院附属瑞金医院
Abstract: 本发明涉及一种蛋白质类泛素化修饰位点鉴定方法，该特异性富集标记鉴定方法首先是对纯化后的类泛素化修饰蛋白质进行酶解，通过特异性类泛素化抗体富集类泛素化修饰的酶切肽段，随后利用化学标记对所富集肽段中的非修饰化的赖氨酸氨基残基进行保护，并经去泛素化酶催化反应以裸露出底物肽段序列上被修饰的赖氨酸，经液相色谱串联质谱联用仪分析肽段序列，通过蛋白质质谱数据分析软件匹配得到被化学修饰的肽段序列，其序列中含有游离氨基的赖氨酸位点即为类泛素化修饰位点。与目前常用的基因突变方法获得位点方式比较，本发明的优点是无需繁琐的基因突变技术手段即可快速、高效、准确地得到蛋白质类泛素化修饰位点信息。
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公开(公告)号：CN104237530A
公开(公告)日：2014-12-24
申请号：CN201410377168.4
申请日：2014-08-01
Applicant: 上海交通大学医学院附属瑞金医院
IPC: G01N33/68
CPC classification number: G01N33/68
Abstract: 本发明公开准确快速实现表型筛选所获得活性化合物药物靶点鉴定的方法，利用化学蛋白质组学驱动的秀丽线虫feeding RNAi技术建立化合物表型筛选和靶点鉴定的无缝对接，所述活性化合物是指线虫中有相应表型的活性化合物，所述表型包括但不限于脂质代谢障碍、细胞凋亡、自吞噬、衰老、神经退行性病变，抗感染。本发明不仅解决了目前困扰单纯运用蛋白质组学手段分析药物互作蛋白容易产生的假阳性和假阴性问题，能够实现去伪存真，并且操作简便，筛选快速、精确，为实现大通量的药物互作蛋白的分析提供了可行方案，形成了更完善的化学蛋白质组学技术体系，为突破表型筛选蛋白质靶点鉴定的瓶颈提供了可能。
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公开(公告)号：CN104116733A
公开(公告)日：2014-10-29
申请号：CN201310143100.5
申请日：2013-04-23
Applicant: 上海交通大学医学院附属瑞金医院
IPC: A61K31/365 , A61K31/4525 , A61P3/00 , A61P3/06 , A23L1/30
Abstract: 本发明公开了番荔枝内酯聚醚类似物AA005及其结构类似物在制药中的应用，尤其在制备预防或治疗脂质代谢异常疾病药物中的应用。本发明首次发现AA005能够抑制前脂肪细胞3T3-L1中甘油三酯的累积，抑制线虫体内脂肪的累积，并且凋亡诱导因子AIF能与AA005特异性相互作用，参与了AA005影响脂肪代谢的过程。AA005作为以线粒体为靶向的小分子化合物很可能提供了一种选择性靶向脂肪细胞的治疗方法，在制备预防或治疗脂质代谢异常药物中具有良好的药用前景。本发明的活性物质AA005及其结构类似物安全低毒，药理作用强，具有容易吸收、稳定性好等特点，更加适合作为新型药物、食物、保健品和／或膳食添加剂进行开发。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN105388294B
公开(公告)日：2017-01-25
申请号：CN201510657842.9
申请日：2014-08-01
Applicant: 上海交通大学医学院附属瑞金医院
IPC: G01N33/68
Abstract: 本发明公开线粒体三功能酶α亚基在制备AA005抑制脂质累积的药物靶标的应用，本发明利用化学蛋白质组学驱动的秀丽线虫feeding RNAi技术表型筛选和靶点鉴定的一种可行可靠的新思路，并且应用该思路成功阐明了番荔枝内酯聚醚类似物AA005能够在无毒性的情况下特异性抑制线虫及前脂肪细胞3T3-L1中脂质累积的效应是通过作用于其靶蛋白线粒体三功能酶α亚基而实现的。通过本发明我们首次确定AA005通过作用于其靶蛋白线粒体三功能酶α亚基(HADHA)影响脂质合成通路从而抑制脂质的累积，很可能提供了一种选择性靶向脂肪合成通路的治疗方法，为制备预防或治疗脂质代谢异常药
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公开(公告)号：CN103784465A
公开(公告)日：2014-05-14
申请号：CN201210432295.0
申请日：2012-11-02
Applicant: 上海交通大学医学院附属瑞金医院
IPC: A61K31/704 , A61K45/00 , A61P35/00
Abstract: 本发明公开了乙醛脱氢酶2作为蒽环类化疗药物处理肿瘤细胞时药物靶标的应用，通过药物筛选发现蒽环类化疗药可以特异性的杀死VHL缺失或突变的肾透明细胞癌细胞，对正常细胞毒性甚小，为肾癌的化疗治疗提供了一个有效选择，克服了目前临床中肾癌基本只依赖手术治疗的缺陷。进一步研究我们发现乙醛脱氢酶2介导蒽环类化疗药对肿瘤细胞的敏感性，提示乙醛脱氢酶2作为蒽环类化疗药物处理肿瘤细胞时药物靶标的应用，又由于40%的亚洲人群中都存在着乙醛脱氢酶2的缺失或突变，故使得本发明拥有更广泛的应用前景，而对于乙醛脱氢酶2不发生缺失或突变的患者，可以通过蒽环类化疗药与乙醛脱氢酶2的抑制剂联合使用，明显增加对肿瘤细胞的杀伤作用。
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公开(公告)号：CN103776909A
公开(公告)日：2014-05-07
申请号：CN201210398526.0
申请日：2012-10-18
Applicant: 上海交通大学医学院附属瑞金医院
Abstract: 本发明涉及一种蛋白质类泛素化修饰位点鉴定方法，该特异性富集标记鉴定方法首先是对纯化后的类泛素化修饰蛋白质进行酶解，通过特异性类泛素化抗体富集类泛素化修饰的酶切肽段，随后利用化学标记对所富集肽段中的非修饰化的赖氨酸氨基残基进行保护，并经去泛素化酶催化反应以裸露出底物肽段序列上被修饰的赖氨酸，经液相色谱串联质谱联用仪分析肽段序列，通过蛋白质质谱数据分析软件匹配得到被化学修饰的肽段序列，其序列中含有游离氨基的赖氨酸位点即为类泛素化修饰位点。与目前常用的基因突变方法获得位点方式比较，本发明的优点是无需繁琐的基因突变技术手段即可快速、高效、准确地得到蛋白质类泛素化修饰位点信息。
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公开(公告)号：CN104116733B
公开(公告)日：2017-02-15
申请号：CN201310143100.5
申请日：2013-04-23
Applicant: 上海交通大学医学院附属瑞金医院
IPC: A61K31/365 , A61K31/4525 , A61P3/00 , A61P3/06 , A23L33/10
Abstract: 本发明公开了番荔枝内酯聚醚类似物AA005及其结构类似物在制药中的应用，尤其在制备预防或治疗脂质代谢异常疾病药物中的应用。本发明首次发现AA005能够抑制前脂肪细胞3T3-L1中甘油三酯的累积，抑制线虫体内脂肪的累积，并且凋亡诱导因子AIF能与AA005特异性相互作用，参与了AA005影响脂肪代谢的过程。AA005作为以线粒体为靶向的小分子化合物很可能提供了一种选择性靶向脂肪细胞的治疗方法，在制备预防或治疗脂质代谢异常药物中具有良好的药用前景。本发明的活性物质AA005及其结构类似物安全低毒，药理作用强，具有容易吸收、稳定性好等特点，更加适合作为新型药物、食物、保健品和／或膳食添加剂进行开发。
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公开(公告)号：CN105388294A
公开(公告)日：2016-03-09
申请号：CN201510657842.9
申请日：2014-08-01
Applicant: 上海交通大学医学院附属瑞金医院
IPC: G01N33/68
CPC classification number: G01N33/68
Abstract: 本发明公开线粒体三功能酶α亚基在制备AA005抑制脂质累积的药物靶标的应用，本发明利用化学蛋白质组学驱动的秀丽线虫feeding RNAi技术表型筛选和靶点鉴定的一种可行可靠的新思路，并且应用该思路成功阐明了番荔枝内酯聚醚类似物AA005能够在无毒性的情况下特异性抑制线虫及前脂肪细胞3T3-L1中脂质累积的效应是通过作用于其靶蛋白线粒体三功能酶α亚基而实现的。通过本发明我们首次确定AA005通过作用于其靶蛋白线粒体三功能酶α亚基(HADHA)影响脂质合成通路从而抑制脂质的累积，很可能提供了一种选择性靶向脂肪合成通路的治疗方法，为制备预防或治疗脂质代谢异常药物的开发提供重要线索。
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