公开(公告)号：CN115927705A

公开(公告)日：2023-04-07

申请号：CN202210895408.4

申请日：2022-07-27

Applicant: 上海交通大学医学院附属仁济医院

Inventor： 曹泽晖 ,  莫小辉 ,  宋佳 ,  谭蔚泓 ,  鞠强 ,  孙迪 ,  田瑞

IPC: C12Q1/6895 ,  C12N15/11 ,  C12R1/645

Abstract: 本发明公开了用于快速鉴定多种皮肤癣菌的引物组。基于k‑mer比对计数策略的序列设计新工具，设计筛选获得针对常见的皮肤癣菌红色毛癣菌，须癣毛癣菌，以及犬小孢子菌的扩增引物及探针序列，最终获得了一组能够特异性扩增多种皮肤癣菌的引物，建立了多重荧光定量PCR反应体系，并优化获得了合适的扩增条件。本发明因此建立了一套能够快速鉴定常见皮肤癣菌的检测体系，可以实现对多种真菌的同时快速鉴定，2小时左右即可获得检测结果，大大优于常规的真菌培养，显微检测的方法，且最低检测限能够达到0.025pg/μL，通过对实际临床样本的检测对比，与镜检方法的结果一致，具有极高的灵敏度、特异性和准确性。

公开(公告)号：CN118291643A

公开(公告)日：2024-07-05

申请号：CN202410531406.6

申请日：2024-04-29

Applicant: 上海交通大学医学院附属仁济医院

Inventor： 鞠强 ,  曹泽晖 ,  莫小辉 ,  李思彤

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/6851 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明涉及一种生物医药检测领域，具体涉及一种蠕形螨定量检测的方法及其反应体系，其检测方法包括以下步骤：筛选蠕形螨的特异序列设计出特异引物与探针；选择人类内参序列设计出特异引物和探针；采集皮肤样品并提取皮肤样品DNA；将皮肤样品DNA作为模板，使用蠕形螨和人类内参基因的特异引物与探针，在扩增反应体系中同时进行扩增和检测；通过对多个扩增曲线分析，得到相应的Ct值计算单位面积皮肤样本中蠕形螨DNA相对于内参DNA的相对值(T/R)。本发明克服传统镜检的缺陷，可以同时检测大量样品并区分不同种类的蠕形螨，具有优异的灵敏度、特异性和精确度。

公开(公告)号：CN115960889A

公开(公告)日：2023-04-14

申请号：CN202310062917.3

申请日：2023-01-17

Applicant: 上海交通大学医学院附属仁济医院

Inventor： 曹泽晖 ,  谭蔚泓 ,  钱金晶

IPC: C12N15/10

Abstract: 本发明记载了一种核酸提取系统和方法及应用，所述核酸提取系统包括中和系统及裂解液系统，所述裂解液系统包括a)缓冲液或纯水，b)SDS，c)还原剂；所述中和系统包含中和试剂，用于中和所述裂解液系统中的SDS。本发明的核酸提取系统及方法可使整个核酸提取过程在单管、室温、短时间内及低成本下完成，既可以自成一体，也很容易接入现有核酸分析系统，非常适合高通量、自动化以及大范围推广，达到了更为安全、适用范围广、简单高效、提取成本低、成功率高等技术目的。

公开(公告)号：CN115044654A

公开(公告)日：2022-09-13

申请号：CN202210682993.X

申请日：2022-06-16

Applicant: 上海交通大学医学院附属仁济医院

Inventor： 曹泽晖 ,  扶琼 ,  谭蔚泓 ,  吕良敬 ,  钱金晶

IPC: C12Q1/6851 ,  C12Q1/6883 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了多型干扰素通路活化的检测的基因组及其对应的引物组，包括：扩增IFI44、MX1、IRF1以及GBP1基因的引物。将检测引物组结合内参基因HPRT1，开发了多重检测方法，可对病人样品中的基因同时进行精准定量分析，从而实现用一个反应就对I/II型干扰素通路进行分型，并具有较高的特异性和灵敏度。本发明开发的检测方法同时检测四个目标基因，经临床验证，其定量结果与四个基因分开来单独检测的结果高度吻合，在保证定量结果可靠性的同时大大提高检测效率。结合筛选到的基因的特异性和四重定量检测的可靠性，本发明能够精确的鉴别引发自身免疫性疾病的分子机制和评估病情的发展，为临床诊断和精准治疗提供有效的指导。