公开(公告)号：CN118389685A

公开(公告)日：2024-07-26

申请号：CN202410557083.8

申请日：2024-05-07

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 宋萍 ,  赵海培 ,  沈虹雨

IPC: C12Q1/6886 ,  C12Q1/6851 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明提供一种甲基化和基因突变同时放大检测的方法，所述方法包括以下步骤：S1：对待测核酸样本进行酶处理，使所述待测核酸样本中发生甲基化的胞嘧啶转化为尿嘧啶；S2：设置反应体系，以步骤S1处理后的核酸样本为模板，加入特异性检测甲基化和基因突变的引物和协同信号放大的抑制探针；S3：进行qPCR反应，通过探针放大策略将突变模板、甲基化模板、或突变和甲基化模板扩增信号放大，实现甲基化和基因突变的同时放大检测。根据本发明方法，实现了在同一个体系中同模板以及不同模板上甲基化和基因突变的同时检测，通过探针放大策略实现了低丰度甲基化和基因突变的同时检测，具有提高的检测灵敏度，有效提高了基因检测的效率。

公开(公告)号：CN116497100A

公开(公告)日：2023-07-28

申请号：CN202310383077.0

申请日：2023-04-11

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 宋萍 ,  赵海培 ,  樊春海

IPC: C12Q1/686

Abstract: 本发明提供一种用于增强超短cfDNA转化率的方法，所述方法包括：1)缩短引物长度至10～20bp，2)给所述引物加上TAG平衡缩短引物对扩增效率的影响，给所述引物加上TAG后使引物的吉布斯自由能变化量在‑12至‑4.6kcal/mol之间，3)Tag联合抑制探针，4)降低qPCR退火温度，从而实现超短cfDNA的高转化率检测。根据本发明提供的一种用于增强超短cfDNA转化率的方法，不仅提高了血浆样本中超短cfDNA检测的转化率，而且提高了cfDNA对疾病检测的灵敏度，根据本发明提供的方法还有望应用于高灵敏癌症筛查试剂盒或分析方法的开发。