从环境样本中同时提纯核酸和蛋白质的方法

    公开(公告)号:CN118006596A

    公开(公告)日:2024-05-10

    申请号:CN202410095914.4

    申请日:2024-01-23

    Inventor: 肖湘 刘亮霆

    Abstract: 本发明公开了一种同时从环境微生物群中共提取核酸和蛋白质的方法,包括如下步骤:S1、样本裂解;将样本采用破碎微生物细胞体系进行破碎,离心,上层为有机相,下层为水相;S2、取上层有机相,利用沉淀法从有机相中提取蛋白;S3、取下层水相,离心,取上清液,提取核酸溶液;S4、取部分核酸溶液提取DNA;取剩余部分核酸溶液提取RNA。可以从土壤、沉积物、水体、污泥、粪便等环境样品提取宏基因,宏转录组及宏蛋白组,从而避免了样品异质性导致的多组学间的不匹配,有利于系统性地解析环境中微生物的功能。

    抽液取样式主动保压原位海水取样器及其取样方法

    公开(公告)号:CN111855305A

    公开(公告)日:2020-10-30

    申请号:CN202010675799.X

    申请日:2020-07-14

    Inventor: 张宇 肖湘

    Abstract: 本发明公开了一种抽液取样式主动保压原位海水取样器,其包括:取样器本体,其内设有隔离活塞,隔离活塞将取样器本体内部空间分隔为取样腔室以及非取样腔室,取样腔室具有取样进口以及排液出口;主动控压系统,其与取样器本体连接,主动控压系统包括压力检测件、控制器以及调节装置,压力检测件检测取样腔室内的压力,当取样腔室内的压力低于预设值后,控制器控制调节装置向非取样腔室内充入或抽取液体介质,以维持取样腔室内的压力不变。此外,本发明还公开了一种海水取样方法,其采用上述的抽液取样式主动保压原位海水取样器进行取样。该抽液取样式主动保压原位海水取样器可以实现对待取样原位海水进行主动保压,并且其保压精度高、安全性能好。

    深海热液模拟及高温高压微生物培养系统

    公开(公告)号:CN103540522A

    公开(公告)日:2014-01-29

    申请号:CN201310462266.3

    申请日:2013-09-30

    Inventor: 张宇 肖湘

    CPC classification number: C12M27/02 C12M29/14 C12M41/22 C12M41/34 C12M41/40

    Abstract: 本发明涉及环境模拟及微生物培养技术领域,特别是指深海热液模拟及高温高压微生物培养系统,包括用于传送气体、液体的管道,还包括:高压底物配料单元,用于均匀混合高压气体和高压海水,获取溶解有高浓度气体的高压海水培养基;高温高压培养单元,用于从高压底物配料单元获取高压海水培养基培养微生物;气体供应单元,用于为高压底物配料单元和高温高压培养单元提供高压气体;流动控制单元,用于控制高压底物配料单元和高温高压培养单元内的压强,以及连续培养过程中的流速;气体监测控制单元,用于检测环境中可燃气体的浓度,判断底物配料单元和高温高压培养单元中可燃气体是否泄漏,并根据判断结果及时报警或自动切断气体供应单元供气。

    深海冷泉模拟及低温高压微生物培养系统

    公开(公告)号:CN103540521A

    公开(公告)日:2014-01-29

    申请号:CN201310462258.9

    申请日:2013-09-30

    Inventor: 张宇 肖湘

    CPC classification number: C12M27/02 C12M29/14 C12M41/22 C12M41/34 C12M41/40

    Abstract: 本发明涉及环境模拟及微生物培养技术领域,特别是指深海冷泉模拟及低温高压微生物培养系统,包括用于传送气体、液体的管道,还包括:高压底物配料单元,用于均匀混合高压气体和高压海水,获取溶解有高浓度气体的高压海水培养基;低温高压培养单元,用于在低于50℃适合于中温和低温微生物生长的温度且高压条件下培养微生物;气体供应单元,用于为高压底物配料单元和低温高压培养单元提供高压气体;流动控制单元,用于控制高压底物配料单元和低温高压培养单元内的压强,以及连续培养过程中的流速;气体监测控制单元,用于检测环境中可燃气体的浓度,判断底物配料单元和低温高压培养单元中可燃气体是否泄漏,并根据判断结果及时报警或自动切断气体供应单元供气。

    空舱压缩式主动保压原位海水取样器及其取样方法

    公开(公告)号:CN111855308B

    公开(公告)日:2023-10-20

    申请号:CN202010676959.2

    申请日:2020-07-14

    Inventor: 张宇 肖湘

    Abstract: 本发明提供了一种空舱压缩式主动保压原位海水取样器,包括耐压液舱内设置有取样腔室、加压腔室、隔离元件和密封装置,取样腔室和加压腔室分布在隔离元件轴向上的两侧;密封装置设置在加压腔室的一端,隔离元件隔绝加压腔室和取样腔室内的介质不会发生混合。主动控压系统包括主动压力泵、控制器和压力测量单元,控制器与主动压力泵、压力测量单元和开关阀进行电连接。主动控压系统检测取样腔室和/或加压腔室内的压力,当取样腔室和/或加压腔室内的压力达到设定值后,主动控压系统控制向加压腔室内加压。通过主动控压单元对耐压液舱压力主动控制的结构,解决了现有高压气体被动补偿技术压力变化的精度差问题,提高了保压精度。

    主动保压原位海水取样器及其取样方法

    公开(公告)号:CN111855303B

    公开(公告)日:2023-10-17

    申请号:CN202010675787.7

    申请日:2020-07-14

    Inventor: 张宇 肖湘

    Abstract: 本发明公开了一种主动保压原位海水取样器,其包括:取样器本体,取样器本体内设有隔离元件,隔离元件将取样器本体内部空间分隔为取样腔室以及非取样腔室,取样腔室具有液体进出口;以及主动控压系统,其与取样器本体连接,主动控压系统检测取样腔室和/或非取样腔室内的压力,当取样腔室和/或非取样腔室内的压力低于设定值后,主动控压系统向非取样腔室内加压。此外,本发明还公开了一种海水取样方法,其采用上述的主动保压原位海水取样器进行取样。该主动保压原位海水取样器采用设置主动控压系统的结构,从而可以通过主动控压系统向非取样腔室加压,由此解决了现有高压气体被动补偿技术压力变化的精度差问题,提高了保压精度。

    主动保压原位海水取样器及其取样方法

    公开(公告)号:CN111855303A

    公开(公告)日:2020-10-30

    申请号:CN202010675787.7

    申请日:2020-07-14

    Inventor: 张宇 肖湘

    Abstract: 本发明公开了一种主动保压原位海水取样器,其包括:取样器本体,取样器本体内设有隔离元件,隔离元件将取样器本体内部空间分隔为取样腔室以及非取样腔室,取样腔室具有液体进出口;以及主动控压系统,其与取样器本体连接,主动控压系统检测取样腔室和/或非取样腔室内的压力,当取样腔室和/或非取样腔室内的压力低于设定值后,主动控压系统向非取样腔室内加压。此外,本发明还公开了一种海水取样方法,其采用上述的主动保压原位海水取样器进行取样。该主动保压原位海水取样器采用设置主动控压系统的结构,从而可以通过主动控压系统向非取样腔室加压,由此解决了现有高压气体被动补偿技术压力变化的精度差问题,提高了保压精度。

    以基因组岛为基础的整合载体pLMO033及其制备方法和应用

    公开(公告)号:CN105400811A

    公开(公告)日:2016-03-16

    申请号:CN201510981736.6

    申请日:2015-12-23

    Inventor: 徐俊 李臻 肖湘

    Abstract: 本发明公开了一种以基因组岛为基础的整合载体pLMO033及其制备方法和应用;所述整合载体pLMO033携带有int/att元件;所述制备方法包括构建中间过渡型质粒pLMO032的步骤和改造所得中间过渡型质粒pLMO032获得整合载体pLMO033的步骤;所述应用具体指在超嗜热古菌中进行基因单拷贝回补或外源基因表达的应用。本发明提供的整合载体能够在大肠杆菌内复制,在超嗜热古菌P.yayanosii A1菌株中高效的进行位点特异性整合并能稳定遗传,该载体可作为超嗜热古菌的基因回补载体应用于基因功能鉴定研究。

    静置式电控高温高压微生物培养装置

    公开(公告)号:CN104195041A

    公开(公告)日:2014-12-10

    申请号:CN201410328136.5

    申请日:2014-07-10

    Inventor: 肖湘 王风平 徐俊

    CPC classification number: C12M23/38 C12M41/12 C12M41/22 C12M41/40

    Abstract: 本发明提供了一种静置式电控高温高压微生物培养装置,包括:压力控制单元,用于显示和控制微生物培养压力;温度控制单元,用于显示和控制微生物培养温度;高温高压培养单元,用于在高于室温和高于大气压的条件下培养微生物;集成固定单元,用于上述压力控制单元、温度控制单元、高温高压培养单元的机械固定和控制元件集成。本发明应用在高温高压条件下静置式微生物培养,满足多组并行实验的要求,保证实验的可重复性,并且产生大量的生物代谢产物;通过内置不同大小的注射器灵活调整培养体积;操作安全简便,适合没有经过专业训练的学生日常使用。

    以噬菌体为基础的穿梭质粒pSW2及其制备方法和应用

    公开(公告)号:CN103333908A

    公开(公告)日:2013-10-02

    申请号:CN201310257439.8

    申请日:2013-06-25

    Abstract: 本发明涉及一种以噬菌体为基础的穿梭质粒pSW2及其制备方法和应用,所述穿梭质粒的碱基序列如SEQ ID NO.1所示,所述衍生质粒是以绿色荧光蛋白作为报告基因的启动子筛选载体。所述制备方法包括以下步骤:敲除噬菌体中质粒复制表达非必需的基因,融合氯霉素基因、克隆复制起始位点、克隆结合转移元件、多克隆位点插入到所述噬菌体基因区域,获得pSW2表达载体;同时将绿色荧光蛋白插入多克隆位点,筛选不同强度的启动子序列,构建生成启动子筛选载体。本发明提供的穿梭质粒能够在大肠杆菌内和不同的希瓦氏菌中复制表达,同时可作为基因回补载体应用于希瓦氏菌基因的功能鉴定,也可以在低温下高效表达外源基因。

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