基于多目标分解优化策略的蛋白质结构优化方法

    公开(公告)号:CN113035268A

    公开(公告)日:2021-06-25

    申请号:CN202110380246.6

    申请日:2021-04-09

    Inventor: 周成鹏 沈红斌

    Abstract: 一种基于多目标分解优化策略的蛋白质结构优化方法,首先将待优化的结构通过随机扰动生成不同的构象作为目标粒子,即每一个粒子都对应一个构象,并为每一个粒子分配一个独有的权重向量,然后利用粒子群算法根据每个粒子独有的权重向量更新其位置和速度,每次更新时筛选出非支配粒子放入解集中,当达到最大迭代次数后得到的非支配粒子集合即为最终解集,最后使用边际效用方法对最终解集中的结构进行排序并将边际效用值最小的构象作为优化后的蛋白质结构。本发明采用多种能量函数缓解单个能量函数带来的偏差,并运用粒子群算法在蛋白质结构空间中进行搜索,采用分解策略将多目标问题分解为一系列单目标子问题,避免了搜索过程中粒子因优化方向不明确所引起的振荡问题,使得优化效果更加稳定。

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