公开(公告)号：CN119229982B

公开(公告)日：2025-02-25

申请号：CN202411719296.2

申请日：2024-11-28

Applicant: 三亚中国农业科学院国家南繁研究院 ,  中国农业科学院农业信息研究所

Inventor： 张建华 ,  牟强 ,  和玉兵 ,  虞国平 ,  周国民

IPC: G16B40/20 ,  G16B30/10 ,  G06N3/0442 ,  G06N3/0455 ,  G06F18/213 ,  G06F18/241 ,  G06F18/25

Abstract: 本发明提供了一种基于ESM‑2和双路径神经网络的DNA结合蛋白和RNA结合蛋白分类方法，具体表现为将ESM‑2与双路径神经网络相结合的分阶段分类方法，称为DRBP‑EDP；在第一阶段训练中，将蛋白质序列分类为核酸结合蛋白或非核酸结合蛋白；在第二阶段训练中，进一步将核酸结合蛋白分类为DNA结合蛋白或RNA结合蛋白；同时，本发明还构建了精细的数据集构建方法，从而创建了高质量的蛋白质分类数据集，通过这种方法，DRBP‑EDP模型取得了很好的性能，第一阶段对核酸结合蛋白和非核酸结合蛋白的分类准确率为90.03%，第二阶段对DNA结合蛋白和RNA结合蛋白的分类准确率为89.56%，不仅为蛋白质分类提出了新的见解和方法，还为研究蛋白质功能提供了创新工具，从而为生命科学的发展提供了新的机遇。

公开(公告)号：CN119229982A

公开(公告)日：2024-12-31

申请号：CN202411719296.2

申请日：2024-11-28

Applicant: 三亚中国农业科学院国家南繁研究院 ,  中国农业科学院农业信息研究所

Inventor： 张建华 ,  牟强 ,  和玉兵 ,  虞国平 ,  周国民

IPC: G16B40/20 ,  G16B30/10 ,  G06N3/0442 ,  G06N3/0455 ,  G06F18/213 ,  G06F18/241 ,  G06F18/25

Abstract: 本发明提供了一种基于ESM‑2和双路径神经网络的DNA结合蛋白和RNA结合蛋白分类方法，具体表现为将ESM‑2与双路径神经网络相结合的分阶段分类方法，称为DRBP‑EDP；在第一阶段训练中，将蛋白质序列分类为核酸结合蛋白或非核酸结合蛋白；在第二阶段训练中，进一步将核酸结合蛋白分类为DNA结合蛋白或RNA结合蛋白；同时，本发明还构建了精细的数据集构建方法，从而创建了高质量的蛋白质分类数据集，通过这种方法，DRBP‑EDP模型取得了很好的性能，第一阶段对核酸结合蛋白和非核酸结合蛋白的分类准确率为90.03%，第二阶段对DNA结合蛋白和RNA结合蛋白的分类准确率为89.56%，不仅为蛋白质分类提出了新的见解和方法，还为研究蛋白质功能提供了创新工具，从而为生命科学的发展提供了新的机遇。