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公开(公告)号：CN107430644B
公开(公告)日：2021-11-19
申请号：CN201680018149.X
申请日：2016-03-24
申请人： 遗传分析股份有限公司
IPC分类号： G16H50/20
摘要： 本发明提供一种用于测定个体的胃肠道菌群失调的可能性的方法，所述方法包含提供测试数据集，其中所述测试数据集包含至少一个微生物群分布，所述微生物群分布为来自所述个体的胃肠道的样品中的多种微生物或微生物群组的相对水平的分布且其中每一微生物或微生物群组的每一水平为所述测试数据集的分布元素，向所述测试数据集应用由来自多个正常个体的对应胃肠道样品中的所述多种微生物或微生物群组的水平分布内的潜在变量测定的至少一个负荷矢量，从而产生第一投影数据集，向所述第一投影数据集应用所述至少一个负荷矢量的转置版本，从而产生第二投影数据集，将所述测试数据集与所述第二投影数据集进行比较且组合第二投影数据集与所述测试数据集的对应分布元素之间的差值，且将组合差值与由来自多个正常个体和/或菌群失调个体的对应胃肠道样品中的所述多种微生物或微生物群组的对应分析测定的菌群正常到菌群失调阈值进行比较，向所述第一投影数据集应用至少一个本征值，所述本征值由所述至少一个负荷矢量测定，且组合每一分布元素的所得值且将组合值与由来自多个正常个体和/或菌群失调个体的对应胃肠道样品中的所述多种微生物或微生物群组的对应分析测定的菌群正常到菌群失调阈值进行比较，其中具有超过所述各别菌群正常到菌群失调阈值的所述组合差值或所述组合所得值的微生物群分布说明菌群失调的可能性。
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公开(公告)号：CN110114471A
公开(公告)日：2019-08-09
申请号：CN201780063672.9
申请日：2017-10-13
申请人： 遗传分析股份有限公司
IPC分类号： C12Q1/04 , C12Q1/10 , C12Q1/689 , G01N33/569
摘要： 本发明提供了一种诊断方法，该方法可用于确定患有肠易激综合征(IBS)的受试者对利用IBS干预饮食或粪便微生物群移植(FMT)治疗有反应的可能性。特别地，该方法可用于预测或确定IBS患者对利用IBS干预饮食或FMT治疗有阳性反应的可能性，尤其是用于确定饮食干预或FMT对受试者的胃肠道、特别是胃肠道微生物群、或IBS的其它症状或并发症可能具有阳性(即有益)作用的可能性(例如降低其严重性)。本发明的方法基于分析胃肠道样品中某些细菌的丰度，例如通过核酸分析进行。
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公开(公告)号：CN107430644A
公开(公告)日：2017-12-01
申请号：CN201680018149.X
申请日：2016-03-24
申请人： 遗传分析股份有限公司
IPC分类号： G06F19/00
摘要： 本发明提供一种用于测定个体的胃肠道菌群失调的可能性的方法，所述方法包含提供测试数据集，其中所述测试数据集包含至少一个微生物群分布，所述微生物群分布为来自所述个体的胃肠道的样品中的多种微生物或微生物群组的相对水平的分布且其中每一微生物或微生物群组的每一水平为所述测试数据集的分布元素，向所述测试数据集应用由来自多个正常个体的对应胃肠道样品中的所述多种微生物或微生物群组的水平分布内的潜在变量测定的至少一个负荷矢量，从而产生第一投影数据集，向所述第一投影数据集应用所述至少一个负荷矢量的转置版本，从而产生第二投影数据集，将所述测试数据集与所述第二投影数据集进行比较且组合第二投影数据集与所述测试数据集的对应分布元素之间的差值，且将组合差值与由来自多个正常个体和/或菌群失调个体的对应胃肠道样品中的所述多种微生物或微生物群组的对应分析测定的菌群正常到菌群失调阈值进行比较，向所述第一投影数据集应用至少一个本征值，所述本征值由所述至少一个负荷矢量测定，且组合每一分布元素的所得值且将组合值与由来自多个正常个体和/或菌群失调个体的对应胃肠道样品中的所述多种微生物或微生物群组的对应分析测定的菌群正常到菌群失调阈值进行比较，其中具有超过所述各别菌群正常到菌群失调阈值的所述组合差值或所述组合所得值的微生物群分布说明菌群失调的可能性。
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