公开(公告)号：CN117385047B

公开(公告)日：2024-05-17

申请号：CN202310965929.7

申请日：2023-08-02

Applicant: 湖北省农业科学院畜牧兽医研究所

Inventor： 上官爱哨 ,  熊琪 ,  邓钊 ,  陶虎 ,  张年 ,  张凤 ,  索效军 ,  杨前平 ,  李晓锋

IPC: C12Q1/6888 ,  G16B20/30 ,  G16B20/40 ,  G16B20/50 ,  G16B20/20 ,  C12Q1/6869 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明属于生物技术领域，特别是涉及一种与山羊生长性状相关的SNP分子标记rs642525408的应用。所述的山羊SNP分子标记位点如SEQ ID NO.1所示，位于该序列片段的第51位碱基位点处存在一个G/A的碱基突变。本发明通过优选该SNP的优势等位基因，能够逐代增加优势等位基因频率，提高山羊12月龄体重，加快山羊遗传改良进展从而有效提高山羊育种的经济效益。

公开(公告)号：CN117230207B

公开(公告)日：2024-05-10

申请号：CN202311131319.3

申请日：2023-09-04

Applicant: 湖北省农业科学院畜牧兽医研究所

Inventor： 陶虎 ,  熊琪 ,  邓钊 ,  陈明新 ,  张年 ,  李晓锋 ,  索效军 ,  杨前平 ,  张凤 ,  上官爱哨 ,  杨娟 ,  赵华 ,  帅艺

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/6869 ,  C12N15/12 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明属于生物技术领域，特别是涉及一种山羊8号染色体上与繁殖性状相关的SNP分子标记及应用。所述的山羊SNP分子标记位点如SEQ ID NO.1所示，位于该序列片段的第51位碱基位点处存在一个C/A的碱基突变。本发明通过优选该SNP分子标记的优势等位基因型，能够提高山羊后代平均经产产羔数，加快山羊遗传改良进展从而有效提高山羊育种的经济效益。

公开(公告)号：CN117385048A

公开(公告)日：2024-01-12

申请号：CN202310966028.X

申请日：2023-08-02

Applicant: 湖北省农业科学院畜牧兽医研究所

Inventor： 熊琪 ,  上官爱哨 ,  邓钊 ,  陶虎 ,  张年 ,  张凤 ,  索效军 ,  杨前平 ,  李晓锋

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/6869 ,  C12N15/11 ,  G16B20/30 ,  G16B20/40 ,  G16B20/50 ,  G16B20/20

Abstract: 本发明属于生物技术领域，特别是涉及一种与山羊生长性状相关的SNP分子标记rs645505906的应用。所述的山羊SNP分子标记位点如SEQ ID NO.1所示，位于该序列片段的第51位碱基位点处存在一个C/A的碱基突变。本发明通过优选该SNP的优势等位基因，能够逐代增加优势等位基因频率，提高山羊12月龄体重，加快山羊遗传改良进展从而有效提高山羊育种的经济效益。

公开(公告)号：CN117385046A

公开(公告)日：2024-01-12

申请号：CN202310965805.9

申请日：2023-08-02

Applicant: 湖北省农业科学院畜牧兽医研究所

Inventor： 上官爱哨 ,  熊琪 ,  邓钊 ,  陶虎 ,  张年 ,  张凤 ,  索效军 ,  杨前平 ,  李晓锋

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/6869 ,  C12N15/11 ,  G16B20/30 ,  G16B20/40 ,  G16B20/50 ,  G16B20/20

Abstract: 本发明属于生物技术领域，特别是涉及一种与山羊生长性状相关的SNP分子标记rs669481944的应用。所述的山羊SNP分子标记位点如SEQ ID NO.1所示，位于该序列片段的第51位碱基位点处存在一个T/C的碱基突变。本发明通过优选该SNP分子标记的优势等位基因型，能够提高山羊后代12月龄体重，用于种羊的遗传改良，有效地提高肉羊养殖业的经济效益。

公开(公告)号：CN112226520A

公开(公告)日：2021-01-15

申请号：CN202011222071.8

申请日：2020-11-05

Applicant: 湖北省农业科学院畜牧兽医研究所

Inventor： 陶虎 ,  陈明新 ,  刘洋 ,  张年 ,  杨娟 ,  熊琪 ,  杨前平 ,  李晓锋 ,  索效军 ,  张凤 ,  田宏 ,  张鹤山 ,  熊军波

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/6858 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明提供了一种检测山羊环状RNA中分子标记的方法及其应用，所述分子标记位于山羊环状RNA circ_ZCCHC24的DNA序列中，其核苷酸序列如序列表SEQ ID NO.1所示，该序列长度为2045bp，在该序列中第651bp处存在一处G>A碱基突变(命名为g.651G>A)、在第1082bp处存在一处G>T碱基突变(命名为g.1082G>T)、在第1310bp处存在一处A>G碱基突变(命名为g.1310A>G)。本发明还提供了检测山羊环状RNA中与产羔数或/和生长性状关联的分子标记的检测试剂盒，包括：如SEQ ID NO.4～7所示的引物对；如SEQ ID NO.8～10所示的SNaPshot单碱基延伸引物。本发明发掘了新的分子标记，同时与山羊产羔数或/和生长性状相关联，实现了对山羊产羔数或/和生长性状进行早期选择，检测方法快速、准确，且不受养殖环境条件因素影响。

公开(公告)号：CN110923333A

公开(公告)日：2020-03-27

申请号：CN201911266436.4

申请日：2019-12-11

Applicant: 湖北省农业科学院畜牧兽医研究所

Inventor： 陶虎 ,  陈明新 ,  张年 ,  杨娟 ,  熊琪 ,  李晓锋 ,  索效军 ,  杨前平 ,  刘洋 ,  田宏 ,  张鹤山 ,  熊军波 ,  张凤

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明提供了山羊ZBP1基因第一内含子内与产羔数关联的单倍型标记，位于山羊ZBP1基因的第一内含子中，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，在该序列的第249bp处存在一处C>T碱基突变、在第852bp处存在一个C>T碱基突变、在第1777bp处存在一个G>A碱基突变、在第2463bp处存在一个C>T碱基突变；本发明还提供了山羊ZBP1基因与产羔数性状关联的SNP检测试剂盒，包括如SEQ ID NO.6～13所示的引物对；如SEQ ID NO.14～17所示的SNaPshot单碱基延伸引物。本发明为山羊产羔数性状的分子标记辅助育种提供了由4个SNP位点组成的新的单倍型分子育种标记。

公开(公告)号：CN108396074B

公开(公告)日：2019-04-02

申请号：CN201810444072.3

申请日：2018-05-10

Applicant: 湖北省农业科学院畜牧兽医研究所

Inventor： 张鹤山 ,  刘洋 ,  段金秀 ,  田宏 ,  熊军波 ,  陈明新 ,  熊琪 ,  陶虎 ,  索效军 ,  李晓锋 ,  张年 ,  张凤 ,  杨前平

IPC: C12Q1/6895 ,  C12N15/11 ,  G16B40/00

Abstract: 本发明提供了基于白三叶转录组序列开发的EST‑SSR引物组及其应用，属于SSR分子标记技术领域。本发明提供了基于白三叶转录组序列开发的EST‑SSR引物组，所述的48对EST‑SSR引物来自白三叶转录组序列，具有数量大、多态性丰富、扩增稳定、重复性好、便于统计等优点，可丰富白三叶可利用SSR引物数量，有效用于白三叶种质遗传多样性分析。

公开(公告)号：CN108018301A

公开(公告)日：2018-05-11

申请号：CN201711315224.1

申请日：2017-12-12

Applicant: 湖北省农业科学院畜牧兽医研究所

Inventor： 陶虎 ,  陈明新 ,  熊琪 ,  张凤 ,  李晓锋 ,  索效军 ,  张年 ,  杨前平 ,  刘洋 ,  张鹤山 ,  田宏 ,  熊军波

IPC: C12N15/66 ,  C12N15/70 ,  C12N15/85 ,  C12Q1/66 ,  G01N21/64

Abstract: 本发明提供确定miR‑27a基因的核心启动子的方法，从小鼠血液基因组DNA中扩增8条miR‑27a启动子缺失片段，构建重组双荧光素酶表达载体pGL3‑D1到pGL3‑D8，转入CHO细胞后检测8个缺失片段的荧光素酶活性，获得核心启动子区；该方法鉴定了miR‑27a的核心区，为基因工程和分子育种提供了新的启动子资源；本发明还提供确定miR‑27a基因核心启动子内转录因子Myod结合位点的方法，通过超表达转录因子Myod和定点突变核心启动子区内的转录因子结合位点，构建突变型荧光表达载体，检测荧光素酶活性，确定转录因子结合位点；为miR‑27a的表达调控运用于家畜高繁殖力分子调控机制的研究提供依据。

公开(公告)号：CN118979111B

公开(公告)日：2025-04-29

申请号：CN202411257810.5

申请日：2024-09-09

Applicant: 湖北省农业科学院畜牧兽医研究所

Inventor： 熊琪 ,  马开宇 ,  徐培尧 ,  柴进 ,  张年 ,  陶虎 ,  张凤 ,  上官爱哨 ,  徐天

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明属于山羊分子标记辅助选择技术领域，具体涉及山羊CYP19A1基因g.44057663G>A位点在山羊生长性状中的应用。所述分子标记是位于为山羊基因组Capra hircusARS1.2中第10号染色体的g.44057663G>A，所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，突变位点在该序列中的第125位碱基处。本发明的SNP位点突变可显著影响山羊生长性状，为山羊生长性状检测或分子标记辅助育种提供一种新的分子标记。本发明还提供了用于检测山羊SNP位点单核苷酸多态性的物质，以及在山羊遗传育种中的应用，本发明的方案可以提高后代山羊的生长性状。

公开(公告)号：CN119061161A

公开(公告)日：2024-12-03

申请号：CN202411469135.2

申请日：2024-10-21

Applicant: 湖北省农业科学院畜牧兽医研究所

Inventor： 张凤 ,  熊琪 ,  杨铭 ,  汪稳 ,  赫海龙 ,  张国庆 ,  索效军 ,  杨前平 ,  上官爱哨 ,  王成梅 ,  杨娟 ,  陶虎 ,  张年 ,  华再东 ,  李晓锋 ,  徐天

IPC: C12Q1/6888

Abstract: 本发明属于肉牛分子标记辅助选择技术领域，特别是涉及一种与肉牛生长性状相关的分子标记及其应用。所述分子标记位于参考基因组(GCF_002263795.1_ARS‑UCD1.2_genomic.fna)中ACOX1基因第三内含子中，所述SNP分子标记位点为g.55675384C>T、g.55676112A>G、g.55680392G>A、g.55681592A>G和g.55683268C>G。分子标记位点g.55675384在SEQ ID NO.1所示序列中的第81bp处存在C>T碱基突变、g.55676112在SEQ ID NO.2所示序列中的第66bp处存在A>G碱基突变、g.55680392在SEQ ID NO.3所示序列中的第90bp处存在G>A碱基突变、g.55681592在SEQ ID NO.4所示序列中的第85bp处存在A>G碱基突变、g.55683268在SEQ ID NO.5所示序列中的第101bp处存在C>G碱基突变。本发明的5处SNP位点突变可显著影响肉牛生长和背膘厚性状，为肉牛生长性状检测或分子标记辅助育种提供一种新的分子标记。