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公开(公告)号：CN111627492B
公开(公告)日：2023-04-28
申请号：CN202010447104.2
申请日：2020-05-25
Applicant: 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院
Abstract: 本申请实施例提供了一种癌症基因组Hi‑C数据仿真方法、装置和电子设备，涉及基因组学技术领域。该方法可通过指定的变异方式，模拟癌症基因组的染色体结构变异，以交互频率矩阵和参考酶切片段的基因信息作为模板，结合所述染色体结构变异特征得到所述癌症基因组的仿真Hi‑C数据，支持模拟染色体多种变异情况，可反映癌症基因组不同位置的互作特征，从而提高了对癌症基因组Hi‑C数据进行仿真的准确性。
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公开(公告)号：CN112992267A
公开(公告)日：2021-06-18
申请号：CN202110392600.7
申请日：2021-04-13
Applicant: 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院
Abstract: 本申请提供了一种单细胞的转录因子调控网络预测方法及装置，其中，所述方法包括：获取scATAC‑seq数据，其中，scATAC‑seq数据包括峰值区域‑细胞矩阵；对峰值区域‑细胞矩阵进行初始化处理，分别得到表征转录因子之间的调控关系的初始邻接矩阵，以及表征每个转录因子的特征信息的初始特征矩阵；将初始邻接矩阵和初始特征矩阵输入至转录因子调控网络预测模型中，得到与初始邻接矩阵相对应的邻接矩阵预测结果。这样一来，仅通过采用scATAC‑seq数据即可解决单细胞的转录因子调控网络预测问题，规避了scRNA‑seq数据在预测调控关系时的诸多弊端，使得转录因子调控网络预测的准确率较高。
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公开(公告)号：CN111627492A
公开(公告)日：2020-09-04
申请号：CN202010447104.2
申请日：2020-05-25
Applicant: 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院
Abstract: 本申请实施例提供了一种癌症基因组Hi-C数据仿真方法、装置和电子设备，涉及基因组学技术领域。该方法可通过指定的变异方式，模拟癌症基因组的染色体结构变异，以交互频率矩阵和参考酶切片段的基因信息作为模板，结合所述染色体结构变异特征得到所述癌症基因组的仿真Hi-C数据，支持模拟染色体多种变异情况，可反映癌症基因组不同位置的互作特征，从而提高了对癌症基因组Hi-C数据进行仿真的准确性。
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公开(公告)号：CN109411019B
公开(公告)日：2020-05-05
申请号：CN201811516862.4
申请日：2018-12-12
Applicant: 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院
Abstract: 本申请提供了一种药物预测方法，该方法包括：从数据库中获取药物扰动后的基因组表达谱数据，并对基因组表达谱数据进行预处理；将预处理后的基因组表达谱数据转换成药物扰动下的差异表达秩序列；从数据库中获取病原体感染表达谱数据，并对病原体感染表达谱数据进行预处理；根据预处理后的病原体感染表达谱数据构建病原体感染印记基因集；通过基因集富集分析算法将药物扰动下的差异表达秩序列和病原体感染印记基因集进行比对，得到富集分数，并判断富集分数是否为负；若是，则通过富集分数构建病原体和药物的关联网络，获取富集分数靠前的关联关系；对富集分数靠前的关联关系以及病原体和药物的聚类结果进行分析，获得未知病原体的防治药物。
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公开(公告)号：CN109207593A
公开(公告)日：2019-01-15
申请号：CN201811145989.X
申请日：2018-09-28
Applicant: 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院
IPC: C12Q1/6886
CPC classification number: C12Q1/6886 , C12Q2600/136 , C12Q2600/158
Abstract: 本发明涉及抗肿瘤药物筛选领域，具体而言，提供了一种抗肿瘤药物的筛选方法。通过将待评定药物的有效下调表达基因组与目标类型肿瘤的候选癌症基因组进行比对，得到两组基因组的重叠基因，即为重叠基因组，重叠基因组中的基因数量为候选癌症基因组中基因数量的30％以上时，该药物可以评定为目标类型肿瘤的抗肿瘤药物。该方法是从生命的本质属性出发，也就是基因的必需性，通过对全基因组的评价分析来筛选抗肿瘤药物，是一种系统、全面、有效的筛选方法。该方法可以筛选得到具有普适性广的抗肿瘤药物，该抗肿瘤药物对所有的目标类型肿瘤均具有治疗效果。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN108676871A
公开(公告)日：2018-10-19
申请号：CN201810744848.3
申请日：2018-07-09
Applicant: 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院
IPC: C12Q1/6883
Abstract: 本发明公开了肠道微生物B.coprocola菌株的EDU99824.1基因可作为二型糖尿病诊断的分子标志物。本发明利用PCR和Sanger测序的方法发现EDU99824.1基因第879位点和第880位点的基因型在健康人和未用药的二型糖尿病病人肠道B.coprocola菌株中存在差异，即可以通过检测粪便基因组中EDU99824.1基因的上述两个SNP位点来判断受试者是否患有二型糖尿病。本发明的诊断试剂盒可用于二型糖尿病的诊断，在临床上具有广泛的应用前景。
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公开(公告)号：CN119889504A
公开(公告)日：2025-04-25
申请号：CN202411657039.0
申请日：2024-11-19
Applicant: 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院
Abstract: 本申请提供了一种化合物器官毒性预测方法、装置及电子设备，方法包括：获取待预测化合物；提取待预测化合物对应的第一化合物特征；将第一化合物特征输入至预先训练好的器官毒性预测模型中，输出待预测化合物对应的器官毒性预测结果；其中，器官毒性预测模型是通过化合物器官毒性训练集对目标神经网络进行训练后得到的；目标神经网络是基于多种特定器官毒性分别对应的不良结局事件信息构成的有向无环图形成的。本申请是一种基于不良结局通路的化合物器官毒性预测方式，能够有效解决现有技术中存在的复杂非线性关系建模能力低、可靠性差的技术障碍，从而实现更准确可靠的化合物器官毒性预测。
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公开(公告)号：CN117017987A
公开(公告)日：2023-11-10
申请号：CN202211676191.4
申请日：2022-12-26
Applicant: 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院
IPC: A61K31/444 , A61K45/06 , A61P35/00 , A61K31/40
Abstract: 本发明涉及一种防治肺癌的药物组合物，组合物由MDM2抑制剂和CDK9抑制剂按照摩尔比为(1‑10):1组成，其中，所述MDM2抑制剂选自Idasanutlin、Nutlin‑3、Nutlin‑3a、Nutlin‑3b、MX69、NVP‑CGM097、MI‑773(SAR405838)、RG‑7112、HDM201(Siremadlin)、YH239‑EE、NSC207895、Serdemetan(JNJ‑26854165)中的任一种或其组合，所述CDK9抑制剂选自NVP‑2、AZD‑4573、P276‑00、CDKI‑73、LY2857785、BS‑194、PHA767491、roscovitine、CYC065、CR8的任一种或其组合。本发明科学组配并协同利用不同作用机制的抗癌药物，选择性地引发肿瘤细胞DNA损伤，诱导肿瘤细胞凋亡，安全有效地抑制肿瘤细胞生长。
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公开(公告)号：CN116246712A
公开(公告)日：2023-06-09
申请号：CN202310104611.X
申请日：2023-02-13
Applicant: 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院
Abstract: 本发明提出了一种带组稀疏约束多模态矩阵联合分解的数据亚型分类方法，能够实现对任意模态间共享‑特异数据结构的挖掘。针对现实数据存在任意模态间数据结构共享的情况，本发明引入组稀疏约束，组稀疏约束是特殊的稀疏约束方法，一般以l1,2范数或l1,∞范数实现，其约束同一组的样本依赖相同的特征，而不同组的样本依赖更为不同的特征。通过将组转换为数据模态，应用组稀疏约束的方法，结合矩阵联合分解中共享‑模态特异的概念，可以实现对任意模态间共享‑特异数据结构的挖掘，在此基础上得到更为合理的聚类效果，其效果在模拟数据和真实乳腺癌数据上得到了验证。
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公开(公告)号：CN113192557B
公开(公告)日：2022-01-25
申请号：CN202110620219.1
申请日：2021-06-03
Applicant: 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院
Abstract: 本申请提供了一种染色体变异检测方法、装置、电子设备及介质，该方法包括：获取待检测染色体的初始测序数据；根据所述初始测序数据的分辨率，构造所述初始测序数据的特征谱；根据所述初始测序数据的特征谱，统计各个待检测染色体的第一离群量和第一特征向量；从所述待检测染色体中，选择第一离群量大于第一预设阈值的染色体，并确定为发生变异染色体；根据所述发生变异染色体对应的第一特征向量，确定所述发生变异染色体的变异位置；本申请使用的仅仅是初始测序数据的全局信息和背景信息区分异常点，能更准确去除数据噪声和其他生物学信号的影响，假阳性低；使用简便，无需大量标注良好的训练数据集。
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