一种H&E染色显微图像驱动的质谱成像超分辨重构方法

    公开(公告)号:CN115272069A

    公开(公告)日:2022-11-01

    申请号:CN202210729711.7

    申请日:2022-06-24

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 一种H&E染色显微图像驱动的质谱成像超分辨重构方法,涉及图像处理。将MSI原始数据进行谱峰对齐、谱峰提取、归一化、基线校正和压缩降维等预处理,得到MSI的离子图像数据和降维数据;基于深度神经网络构建超分辨重构模型;将高分辨H&E显微图像和MSI降维数据作为输入,让模型自动配准和自监督学习,实现MSI降维数据的超分辨重构;利用迁移学习实现MSI离子图像的超分辨重构。利用MSI降维数据的超分辨图像对H&E图像进行迭代配准,避免由于单离子图像信息量少、信噪比低和空间分辨率低等因素造成H&E图像的矫正误差;将H&E染色显微图像替换为其它模态的高分辨医学图像,可实现其它模态驱动的质谱成像超分辨重构。

    一种基于非负矩阵分解的质谱数据缺失值填补方法及系统

    公开(公告)号:CN111859275B

    公开(公告)日:2022-08-12

    申请号:CN202010701528.7

    申请日:2020-07-20

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 本发明涉及一种基于非负矩阵分解的质谱数据缺失值填补方法及系统,包括:对数据集矩阵进行缺失值的预填补,得到无缺失的初始数据矩阵;对无缺失的初始数据矩阵中所有元素进行对数变换;取一组非负矩阵分解的维度参数,分别进行非负矩阵分解,得到对应的一组重构矩阵;对重构矩阵的元素值做指数变换;计算所有指数变换后的重构矩阵与无缺失的初始数据矩阵之间的重构误差;根据重构误差计算得到不同重构矩阵下各自对应的权重;对重构矩阵进行加权平均,得到加权重构矩阵;将加权重构矩阵中对应位置的元素值填补到数据集矩阵中的缺失位置;基于无缺失的最终数据矩阵进行特征代谢物识别及通路分析。本发明的上述方法能够提高数据填补精度。

    一种用于质谱成像数据的交互式空间分割方法

    公开(公告)号:CN114494175A

    公开(公告)日:2022-05-13

    申请号:CN202210072775.4

    申请日:2022-01-21

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 一种用于质谱成像数据的交互式空间分割方法,涉及质谱成像数据分析技术领域。包括:将原始数据经过谱峰对其、谱峰提取和谱峰合并等预处理得到质谱成像数据;对质谱成像数据进行无监督降维得到嵌入图像;构建无监督分割模型对嵌入图像进行预分割;将用户的先验知识表示为涂鸦信息对分割模型进行正则化约束;在预分割结果不合理的区域进行交互式微调,得到更合理的分割结果。可以充分利用用户不完整的、不精确的先验知识,提高质谱成像数据分割结果的合理性;避免由于无监督分割模型产生的结果不稳定、或与研究问题不相关等问题,提高质谱成像数据后续分析的可靠性和准确性。

    一种基于代谢物关联网络的受扰动通路分析方法

    公开(公告)号:CN114038509A

    公开(公告)日:2022-02-11

    申请号:CN202111301560.7

    申请日:2021-11-04

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 一种基于代谢物关联网络的受扰动通路分析方法,属于分析技术领域。包括步骤:1)对生物样品中的代谢物组进行分析,数据预处理后得到代谢组学数据矩阵;2)构造代谢物‑代谢通路二部图;3)将代谢组学数据矩阵进行代谢物关联网络建模,得到实验组和对照组之间的差异网络;4)计算差异网络在二部图上的富集度;5)基于两组样本间的差异代谢物网络,结合通路数据库的信息,对通路按重要性进行排序,识别潜在扰动通路;6)对潜在扰动通路进行显著性检验,获得显著扰动的代谢通路。利用差异网络的相关理论分析生物机体不同生理状态之间的差异,所筛选出与实验组相关的受扰动代谢通路更为可靠,为理解生物机体背后的发生机制提供新的研究思路。

    一种基于圆弧切线模型的核磁共振波谱基线校正方法

    公开(公告)号:CN112731234A

    公开(公告)日:2021-04-30

    申请号:CN202011594412.4

    申请日:2020-12-29

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 一种基于圆弧切线模型的核磁共振波谱基线校正方法,涉及核磁共振波谱基线校正。1)将所采集到的fid数据末尾补零至2的整次幂个数据点,进行快速傅里叶变换、相位校正,得到样品的核磁共振波谱数据,并进行数据预处理;2)对样品核磁共振波谱进行谱峰识别,计算每个谱峰的半高宽,设置圆弧半径R为谱峰半高宽的中值,构建圆弧方程;3)滑动圆弧的圆心位置,计算样品核磁共振波谱与圆弧的切线点,得到圆弧滑动轨迹,根据圆弧滑动轨迹计算得到波谱基线点;4)对样品核磁共振波谱基线点进行平滑和尺度逆变换,得到波谱基线,实现样品核磁共振波谱的基线校正。可以校正基线失真较大的波谱。避免校正后出现负峰,可推广至二维波谱的基线校正。

    一种通过纯化学位移NMR谱鉴别茶叶产地差异的方法

    公开(公告)号:CN108931548A

    公开(公告)日:2018-12-04

    申请号:CN201810575448.4

    申请日:2018-06-06

    Applicant: 厦门大学

    CPC classification number: G01N24/08 G01N1/286

    Abstract: 本发明涉及一种通过纯化学位移NMR谱鉴别茶叶产地差异的方法,将PSYCHE纯化学位移谱方法与多变量统计分析方法相结合,并应用于低浓度天然食品茶叶的组成分析中。通过对获得的纯化学位移谱进行主成分分析法和正交偏最小二乘法分析,实现了对茶叶产地的鉴别,同时找到了不同产地茶叶的差异物质。本发明所采用的PSYCHE纯化学位移谱方法法能够去除宽带同核1H-1H偶合,仅保留了化学位移信息,应用于低浓度样品获得了质量较高的纯化学位移氢谱,提高了谱图分辨率。PSYCHE脉冲序列简单,易于操作,常规谱仪条件即可满足实验要求。与现有茶叶产地鉴别方法相比较,本发明提出的NMR方法具有可重复性、非侵入性及谱图分辨率高等优点。

    一种大功率LED照明净化模块灯

    公开(公告)号:CN208442588U

    公开(公告)日:2019-01-29

    申请号:CN201820817117.2

    申请日:2018-05-29

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 本实用新型提供一种大功率LED照明净化模块灯,同时具有无线充电和空气净化作用的多功能便携式移动照明暨净化装置。其模块化部件包含头灯、扩展灯、连接型空气净化器、扩展型空气净化器、万向轮、灯杆、扩展杆、固座、底盘等可拆卸分体式部件组合结构。根据部件数量和组合方式的不同,可以灵活安全快捷地实现台灯、落地灯、壁灯、吊灯、露营灯、便携式电源、移动式空气净化器等多用途、多功能的照明暨空气净化装置组合。重量轻便、体积小巧、携带方便、使用安全、散热高效、光亮均匀、光斑舒适、无频闪无蓝屏无幻光无重影无色差、无电磁辐射、呵护视力、寿命更长、性价比高、实用性强、用途广泛和耐用可靠。

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