一种地方鸡中低密度10K全基因组SNP液相芯片及其应用

    公开(公告)号:CN117187410A

    公开(公告)日:2023-12-08

    申请号:CN202311218053.6

    申请日:2023-09-20

    Abstract: 本发明涉及一种地方鸡中低密度10K全基因组SNP液相芯片及其应用。本发明通过全基因组重测序技术获得地方鸡58个品种的955个个体的全基因组遗传信息,通过严格筛选获得45669个SNP分子标记组成的基础数据集,再进一步遴选出10046个SNP分子标记,并以遴选的SNP分子标记为检测靶点构建SNP液相芯片。本发明的SNP液相芯片具有目标区域数据覆盖度和均一性好、基因分型检出率高的优势,极大地降低了基因组分型成本。同时,计算其与高密度40K全基因组SNP液相芯片亲缘系数矩阵,平均相关系数达到95.18%,证明在采用基因组选择技术进行分子育种时,可以代替40K SNP的液相芯片,实现快速低成本。

    与鸡血清碱性磷酸酶水平相关的分子标记、检测引物、试剂盒及应用

    公开(公告)号:CN113151509B

    公开(公告)日:2023-09-05

    申请号:CN202110624414.1

    申请日:2021-06-04

    Abstract: 本发明涉及与鸡血清碱性磷酸酶水平相关的分子标记、检测引物、试剂盒及应用。本发明通过研究发现鸡ST3GAL4基因存在与鸡血清碱性磷酸酶水平相关的分子标记,所述分子标记包括SNP位点1‑4(475471G>A、475533C>T、475621A>G、475647C>A)四个完全连锁的多态性位点,构成G‑C‑A‑C和A‑T‑G‑A两种单倍型,基因分型后关联分析发现与ALP高度相关。对本发明提供的分子标记或其中的至少一个SNP位点进行基因型检测,能够用于评价鸡血清ALP水平和鸡分子辅助选择育种,为鸡种质资源改良奠定了基础。试验证明,以SNP位点1(475471G>A)作为标签SNP分子标记,对SNP位点1的基因型进行检测能准确评价鸡血清ALP水平:当待测鸡的基因型为GG时,待测鸡为低水平血清ALP个体,当待测鸡的基因型为AA时,待测鸡为高水平血清ALP个体。

    一种决定鸭白羽性状的转座子多态分子标记LTR/Gypsy及鉴定方法

    公开(公告)号:CN115820874A

    公开(公告)日:2023-03-21

    申请号:CN202211272204.1

    申请日:2022-10-18

    Abstract: 本发明提供了一种决定鸭白羽性状的转座子多态分子标记LTR/Gypsy及其在鉴定鸭白羽性状或选育白羽鸭中的应用,所述分子标记位于鸭MITF基因的内含子区域,为插入型多态分子标记,核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。本发明还提供了检测鸭MITF基因中转座子多态分子标记LTR/Gypsy的物质在鉴定鸭白羽性状或选育白羽鸭中的应用,所述检测物质为扩增所述转座子多态分子标记的等位基因特异性引物,所述引物序列分别包含SEQ IDNO.2、3、4所示的DNA分子。本发明的优势在于:提供的转座子多态分子标记LTR/Gypsy多态性高、基因组分布广泛,采用等位基因特异性引物进行扩增,然后进行电泳检测分析,只需基因组模板,无需特殊设备,带型清晰,能够简单、快速、低成本、精确地检测其插入多态性,可在早期筛选出具有白羽性状的肉鸭,对于我国肉鸭养殖业具有重要意义。

    用于降解黄曲霉毒素B1的枯草芽孢杆菌及其应用

    公开(公告)号:CN107201322B

    公开(公告)日:2019-06-28

    申请号:CN201710077742.8

    申请日:2017-02-13

    Abstract: 本发明公开了一种用于降解黄曲霉毒素B1的枯草芽孢杆菌及其应用,属于生物技术领域。本发明以香豆素为唯一碳源和能源进行初筛,以菌株对AFB1的降解率为复筛指标,筛选得到一株能够高效降解AFB1的枯草芽孢杆菌S1(CCTCC NO:M 2016390)。该菌株发酵液对AFB1的降解率达61.36%;以10%接种量培养后,降解率可达80.26%;发酵上清液浓缩8倍后,降解率达85.65%。研究表明,枯草芽孢杆菌S1分泌的胞外酶能够降解黄曲霉毒素B1,因此该菌株发酵液或者从菌株发酵液中分离得到的活性蛋白可用于降解黄曲霉毒素B1或者制备降解黄曲霉毒素B1的生物添加剂。

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