公开(公告)号：CN110093345B

公开(公告)日：2020-11-10

申请号：CN201910384190.4

申请日：2019-05-09

Applicant: 江苏省农业科学院

Inventor： 孟珊 ,  沈新莲 ,  徐珍珍 ,  郭琪 ,  徐鹏 ,  张香桂

IPC: C12N15/11 ,  C12Q1/6895

Abstract: 本发明公开了与棉花纤维强度和马克隆值相关的SSR分子标记及应用。本发明提供了一个来自于异常棉的染色体片段，为位于异常棉11号染色体上至少含有自SSR分子标记NAU2152起至SSR分子标记JAAS4769止的片段；所述SSR分子标记NAU2152的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示；所述SSR分子标记JAAS4769的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示。本发明所提供的染色体片段在优质棉纤维棉花育种中具有重要应用价值，同时本发明开发的SSR分子标记为培育能应用于生产的优质棉纤维棉花品种提供分子基础。

公开(公告)号：CN103824000A

公开(公告)日：2014-05-28

申请号：CN201410062207.1

申请日：2014-02-24

Applicant: 江苏省农业科学院

Inventor： 杜建厂 ,  刘静 ,  徐珍珍 ,  倪万潮

IPC: G06F19/18 ,  G06F19/28

Abstract: 本发明公开了一种批量检测植物基因组LTR-反转座子的方法。本发明所提供的检测植物基因组LTR-反转座子的方法综合运用了基于结构特征从头寻找的LTR_STRUC程序，基于同源搜索的CROSS_MATCH程序，基于序列相似性的CLUSTALW比对程序，以及结合Perl脚本语言编程等方法。实验证明，本发明所提供的批量检测LTR-反转座子的方法比较系统，检测植物基因组LTR-反转座子插入位点正向重复的效果好，速度快，易实现流程化。本发明将常用的检测LTR-反转座子的软件与Perl脚本语言编程相结合，一定程度上弥补了这些常用软件的一些不足。本方法将在基因组注释和批量检测植物基因组LTR-反转座子中发挥着重要的作用。