一种基于整合分析的生物标志物选择方法及系统

    公开(公告)号:CN110246544B

    公开(公告)日:2021-03-19

    申请号:CN201910409758.3

    申请日:2019-05-17

    Applicant: 暨南大学

    Abstract: 本发明公开了一种基于整合分析的生物标志物选择方法及系统,该方法包括下述步骤:选取原始测序数据;原始测序数据采用FANSe算法,进行mapping分析,得到基因定量信息,设定基因原始分组;采用GWGS算法计算基因在原始分组中的重要性排序,再采用GWRS算法将每组基因的重要性整合,得到整合后的基因重要性排列列表,将基因按照重要性从高到低排序;采用基于SVM的Wrapper Feature Selection模型进行数据挖掘,区分数据样本类型,从重要性高的基因中筛选出生物标志物。本发明根据测序数据特点,有机整合多中心的原始测序数据,并解决平台、样本、实验设计上的系统差异,采用稳健性高的整合分析算法进行深度数据挖掘,挖掘到共同、特异、关键的生物大分子。

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