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公开(公告)号：CN113674797B
公开(公告)日：2024-05-14
申请号：CN202010414708.7
申请日：2020-05-15
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明公开了一种基于蛋白质组的数据检测系统、方法、设备及存储介质，所述数据检测系统包括：接收模块及执行模块；所述接收模块用于接收待检测信息，所述待检测信息包括蛋白质组信息；所述执行模块用于将所述待检测信息输入至检测模型以获取检测结果。本发明通过对机体功能的执行者蛋白质的检测，可以克服现有技术中全基因组测序、外显子测序或对基因表达产物mRNA检测而对机体所患疾病预测有偏差的缺陷，通过将蛋白质组信息输入至检测模型可以自动获取对用户的检测结果，从而避免了人工检测程序的繁琐性及高时长性，能够准确反映待检测用户的生理机能状态。
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公开(公告)号：CN113674798B
公开(公告)日：2024-04-26
申请号：CN202010415362.2
申请日：2020-05-15
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明公开了一种蛋白质组学数据的分析方法及系统，分析方法包括：获取项目中每个实验对应的元数据以及蛋白质组学数据；根据元数据对实验进行分类处理；在网页端构建目标分析任务；通过网页端将目标分析任务发送至服务器端，并根据目标分析任务对应的目标分析工具以及目标分析工具的执行顺序对目标分析任务进行分析处理以获取分析结果；通过服务器端将分析结果发送至网页端。本发明中构建了一站式、可定制、流程化的蛋白质组学数据的分析系统，在基于网页端和服务器端实现云服务的同时，使得涵盖分析任务的整个分析流程，实现对蛋白质组学数据的自动化分析的同时，也提高了分析效率，提升了数据分析的通用性，满足了更高的用户分析需求。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN114974418A
公开(公告)日：2022-08-30
申请号：CN202210578954.5
申请日：2022-05-16
Applicant: 复旦大学附属华山医院
Abstract: 本发明提供了用于垂体腺瘤治疗效果及预后预测的试剂盒、方法及系统，包括分子标志物检测试剂和/或分子生物学特征参数检测试剂；分子标志物包括GNAS、CDK6、DRD2、EGFR、MGMT、PDL1、SNAI1、SNAI2、TWIST1、TWIST2、VEGFA、VEGFR2、SSTR2/5和ZEB2中的一种或多种；分子生物学特征参数包括GNAS基因拷贝数变异、GNAS基因突变、USP8基因突变、上皮间质化特征、基质细胞百分比、免疫耗竭、EGFR配体激活、EGFR T693位点磷酸化和缺氧性血管新生中的一种或多种。本发明基于大规模样本分析和验证提出了新的与垂体腺瘤的疗效及预后相关的分子标志物和/或分子生物学特征参数，可将垂体腺瘤整合为7个具有预后指导意义的亚型，对垂体腺瘤治疗方案选择和垂体腺瘤药物靶点筛选提供了新的方案和选择。
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公开(公告)号：CN114242163A
公开(公告)日：2022-03-25
申请号：CN202010939999.1
申请日：2020-09-09
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明公开了一种蛋白质组学的质谱数据的处理系统，包括客户端、服务端和NAS；服务端包括数据上传模块、数据管理模块、数据计算模块、数据库和若干服务器；数据上传模块用于接收用户经对应的客户端上传的质谱数据文件，并将质谱数据文件传输至数据管理模块；数据管理模块用于将质谱数据文件存储至NAS；数据计算模块用于根据实验的计算参数信息提交质谱数据计算任务，将质谱数据计算任务发布到不同优先等级的消息队列中，抓取消息队列中的任务信息，将质谱数据计算任务分配到若干服务器上执行；质谱数据计算任务用于将质谱数据文件经计算得到对应的蛋白质组表达数据。本发明能够一站式解决质谱数据的管理、存储和计算，用户使用方便，操作简单。
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公开(公告)号：CN113774074A
公开(公告)日：2021-12-10
申请号：CN202010507012.9
申请日：2020-06-05
Abstract: 本发明公开了一种基于肽段的靶向蛋白质组精确定量方法，设计了一系列包含亲和标签且具有相似理化性质的相同氨基酸长度的多肽序列，包括亲和标签序列、标记蛋白的特征氨基酸序列、蛋白酶的酶切位点。将编码这些序列的核苷酸序列添加到不同基因的开放阅读框的5’端或3’端表达后作为质谱检测的优化肽段进行蛋白定量。由于每个序列都包含同样的亲和标签，因此可以用相同的抗体对这些肽段进行富集，避免因抗体富集效率的差异造成的信号差异，并可以实现低浓度肽段的检测，从而在靶向蛋白质组学中实现蛋白的精确定量。
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公开(公告)号：CN113674798A
公开(公告)日：2021-11-19
申请号：CN202010415362.2
申请日：2020-05-15
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明公开了一种蛋白质组学数据的分析方法及系统，分析方法包括：获取项目中每个实验对应的元数据以及蛋白质组学数据；根据元数据对实验进行分类处理；在网页端构建目标分析任务；通过网页端将目标分析任务发送至服务器端，并根据目标分析任务对应的目标分析工具以及目标分析工具的执行顺序对目标分析任务进行分析处理以获取分析结果；通过服务器端将分析结果发送至网页端。本发明中构建了一站式、可定制、流程化的蛋白质组学数据的分析系统，在基于网页端和服务器端实现云服务的同时，使得涵盖分析任务的整个分析流程，实现对蛋白质组学数据的自动化分析的同时，也提高了分析效率，提升了数据分析的通用性，满足了更高的用户分析需求。
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公开(公告)号：CN113674797A
公开(公告)日：2021-11-19
申请号：CN202010414708.7
申请日：2020-05-15
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明公开了一种基于蛋白质组的数据检测系统、方法、设备及存储介质，所述数据检测系统包括：接收模块及执行模块；所述接收模块用于接收待检测信息，所述待检测信息包括蛋白质组信息；所述执行模块用于将所述待检测信息输入至检测模型以获取检测结果。本发明通过对机体功能的执行者蛋白质的检测，可以克服现有技术中全基因组测序、外显子测序或对基因表达产物mRNA检测而对机体所患疾病预测有偏差的缺陷，通过将蛋白质组信息输入至检测模型可以自动获取对用户的检测结果，从而避免了人工检测程序的繁琐性及高时长性，能够准确反映待检测用户的生理机能状态。
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