肿瘤坏死因子-α转化酶的多肽抑制剂的筛选方法及其应用

    公开(公告)号:CN103940982A

    公开(公告)日:2014-07-23

    申请号:CN201410134532.4

    申请日:2014-04-03

    Applicant: 三峡大学

    Abstract: 一种肿瘤坏死因子-α转化酶的多肽抑制剂的筛选方法及其应用,属于生物医学领域。所述方法先建立合理的TACE与多肽底物的复合物模型,用以指导多肽抑制剂的设计,然后通过检测一系列指标,如结合能力、抑制能力等,筛选出可作为多肽抑制剂的候选多肽;所选出的多肽特异性高,活性强,可进一步用于设计以肿瘤坏死因子-α转化酶为靶标的多肽药物。

    小分子共价抑制剂计算机筛选方法及其在筛选S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶共价抑制剂的应用

    公开(公告)号:CN106407739B

    公开(公告)日:2019-02-22

    申请号:CN201610257410.3

    申请日:2016-04-22

    Applicant: 三峡大学

    Inventor: 刘森

    Abstract: 本发明属于生物医学领域,尤其是涉及小分子共价抑制剂的计算机筛选方法及其在筛选S‑腺苷甲硫氨酸脱羧酶的共价抑制剂的应用。所述方法为在计算机辅助筛选和设计共价抑制剂的过程中,首先减弱或消除蛋白受体的空间位阻,再将其用于共价抑制剂或共价结合分子的筛选、设计和改造。所述方法在筛选S‑腺苷甲硫氨酸脱羧酶的共价抑制剂的应用为将S‑腺苷甲硫氨酸脱羧酶晶体结构中的丙酮酰68残基删除,并在Rosetta软件中优化,得到优化后的蛋白晶体结构;再与小分子进行对接计算,得到对接计算结果;对计算结果进行筛选,得到小分子共价抑制剂。本发明可广泛利用已经发展完善的众多非共价抑制剂的对接计算方法,因此可以大大加速共价抑制剂的筛选、优化和发现。

    小分子共价抑制剂在制备抑制S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶的药物上的应用及筛选方法

    公开(公告)号:CN106389403B

    公开(公告)日:2019-02-19

    申请号:CN201610257321.9

    申请日:2016-04-22

    Applicant: 三峡大学

    Abstract: 本发明属于生物医学领域,尤其是涉及小分子共价抑制剂在制备抑制S‑腺苷甲硫氨酸脱羧酶的药物上的应用及筛选方法。一种小分子共价抑制剂,其结构式为:其中R1可以为苯基或苯胺或苯甲酰胺或其取代苯基基团、甲基或乙基、呋喃及其取代基团、吡咯及其取代基团、吡啶及其取代基团等;该抑制剂还包括含有通式I所示的化学结构的药学上可接受的盐。筛选S‑腺苷甲硫氨酸脱羧酶的小分子共价抑制剂的方法,为将S‑腺苷甲硫氨酸脱羧酶晶体结构中的丙酮酰68残基删除,并在Rosetta软件中优化,得到优化后的蛋白晶体结构;与搜索得到的小分子结构利用AutoDockVina软件进行对接计算,对计算结果进行筛选,根据打分排序,筛选得到小分子共价抑制剂。

    一种小分子抑制剂及在抑制S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶上的应用

    公开(公告)号:CN104324031B

    公开(公告)日:2017-01-11

    申请号:CN201410534410.4

    申请日:2014-10-10

    Applicant: 三峡大学

    Abstract: 本发明提供一种小分子抑制剂,其结构式为: 所述的R1为氢、甲基、乙基、硝基、亚硝基、磺酸基、羧基、氨基或偶氮;R2为氢、甲基、乙基、硝基、亚硝基、磺酸基、羧基、氨基或偶氮;X为氢、氟、氯、溴或碘;该抑制剂还包括含有通式I所示的化学结构的药学上可接受的盐。利用AutoDockVina软件,通过将上述骨架和取代基组成的小分子对接到确定的AdoMetDC口袋中,通过AutoDockVina软件给出的打分进行评价,最低打分低于-7.0的小分子用于实验验证。并将上述小分子抑制剂应用于抑制S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶活性上。

    小分子抑制剂及在抑制S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶上的应用

    公开(公告)号:CN104367573B

    公开(公告)日:2016-06-01

    申请号:CN201410532418.7

    申请日:2014-10-10

    Applicant: 三峡大学

    Abstract: 本发明提供一种小分子抑制剂,其结构式为:所述的R1为亚氨基、羰基、呋喃或噻吩;R2为氢、羟基、甲基、乙基、苯基或苄基;R3为氢、硝基、氨基或羟基;该抑制剂还包括含有通式I所示的化学结构的药学上可接受的盐。利用AutoDockVina软件,通过将上述骨架和取代基组成的小分子对接到确定的AdoMetDC口袋中,通过AutoDockVina软件给出的打分进行评价,最低打分低于-7.0的小分子用于实验验证。并将上述小分子抑制剂应用于抑制S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶活性上。

    一种小分子抑制剂及在抑制S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶上的应用

    公开(公告)号:CN104784183A

    公开(公告)日:2015-07-22

    申请号:CN201510057907.6

    申请日:2015-02-04

    Applicant: 三峡大学

    Abstract: 一种小分子抑制剂,该小分子抑制剂的结构式为该抑制剂还包括含有通式I所示的化学结构的药学上可接受的盐,其中,R2包括=O,-NH2,-CH2(NH2),-C(NH2)3,-CO(NH2),-CH2-CHO中的任意一种。本发明将该小分子抑制剂在抑制S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶上的应用。本发明利用AutoDockVina软件,通过将上述骨架和取代基组成的小分子对接到确定的AdoMetDC口袋中,通过AutoDockVina软件给出的打分进行评价,最低打分低于-7.0的小分子用于实验验证。

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