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公开(公告)号:CN117079060B
公开(公告)日:2024-03-12
申请号:CN202311325300.2
申请日:2023-10-13
Applicant: 之江实验室 , 中国科学院东北地理与农业生态研究所
IPC: G06V10/764 , G06V10/774 , G06V10/25 , G06V20/40 , G06V10/82 , G06N3/0442 , G06N3/0464 , G06N3/045
Abstract: 一种基于光合信号的叶片智能分类方法和系统,其方法包含:叶片光合信号提取、叶片光合信号分类。叶片光合信号提取通过叶片检测模型提取出视频中的叶片,使用分割算法对提取出的叶片进行分割,从而分割出叶片区块,然后以叶片区块内的像素均值记为当前帧的光合信号值,视频的多帧连续光合信号值即组成此叶片的光合信号。叶片光合信号分类使用神经网络对采集到的叶片光合信号进行特征提取训练,来实现叶片的分类。本发明提出一种基于植物叶片的光合信号,确定其提取方法,并针对植物叶片的光合信号变化,采用深度学习训练的方式,提取出植物叶片与其光合信号变化的相关性,从而大大提高叶片分类的精度。
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公开(公告)号:CN116992919B
公开(公告)日:2023-12-19
申请号:CN202311269915.8
申请日:2023-09-28
Applicant: 之江实验室 , 中国科学院东北地理与农业生态研究所
IPC: G06N3/042 , G06N3/0464 , G06N3/0499 , G06N3/084 , G16B40/00 , G06F18/213 , G06F18/22
Abstract: 本发明公开了一种基于多组学的植物表型预测方法和装置,该方法基于图卷积神经网络,将多组学如基因组、转录组、代谢组的数据作为图节点,不同组学之间的关联程度作为图的边来构建每个植株的图结构数据,将构建的图结构数据输入图卷积神经网络中,提取节点特征,通过Transformer网络更新节点特征,节点特征拼接后输入全连接层,输出表型预测值,利用整个图结构融合多组学特征实现表型的预测。本发明创新性的利用图卷积神经网络结合Transformer网络实现基因到表型的预测,并利用多组学构建图结构融合多组学数据实现精准表型预测,在一定程度上解决只用单一组学表型预测不准的问题,
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公开(公告)号:CN116797904A
公开(公告)日:2023-09-22
申请号:CN202310444502.2
申请日:2023-04-24
Applicant: 之江实验室 , 中国科学院东北地理与农业生态研究所
IPC: G06V10/82 , G06V10/774 , G06N3/08 , G06N3/0464 , G06V10/74 , G06V10/764 , G06N5/02
Abstract: 本发明公开一种图像识别不确定性知识蒸馏方法与系统,收集有标签训练图像样本;选定第一神经网络模型,使用训练图像样本进行训练,得到训练好的第一神经网络模型,输入训练样本图像得到第一神经网络模型中间层样本特征表达及输出的软标签信息;选定第二神经网络模型,对训练图像样本进行处理,得到中间层样本特征表达,与第一神经网络模型的中间层样本特征表达进行不确定性建模,得到第一损失函数;使用第一神经网络模型输出的软标签信息及训练图像样本,联合第一损失函数,更新第二神经网络模型的参数,得到训练好的第二神经网络模型,同时利用本发明第二神经网络模型对待处理图像进行图像识别处理,提高图像识别的准确度。
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公开(公告)号:CN113736792A
公开(公告)日:2021-12-03
申请号:CN202110764142.5
申请日:2021-07-06
Applicant: 中国科学院东北地理与农业生态研究所
IPC: C12N15/29 , C12N15/82 , C07K14/415 , A01H5/00 , A01H6/54
Abstract: 本发明涉及基因工程技术领域,尤其涉及大豆GmTic110基因的突变体及其应用。本发明研究表明,大豆编码叶绿体膜蛋白的GmTic110基因突变,导致突变体叶绿素合成下降,叶绿体发育异常,影响了植株的光合作用。利用CRISPR/Cas9系统对野生型进行GmTic110基因的敲除,获得稳定的敲除转基因株系表现叶色黄化,与突变体表型一致。本发明为大豆叶绿体工程研究提供基因资源,可通过GmTIC110蛋白定向改造大豆叶绿体发育,提高大豆的光合作用,为高光效大豆品种培育提供种质资源,具有广阔的应用前景。
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公开(公告)号:CN110713528B
公开(公告)日:2021-06-11
申请号:CN201911044883.5
申请日:2019-10-30
Applicant: 中国科学院东北地理与农业生态研究所
IPC: C07K14/415 , C12N15/29 , A01H5/00 , A01H6/82
Abstract: 本发明涉及植物基因工程技术领域,具体涉及大豆抗疫霉病相关基因GmLMM1的应用。本发明在大豆中克隆了参与大豆细胞死亡、免疫反应和疫霉病抗性调控的GmLMM1基因。GmLMM1基因能够负调控植物PTI免疫反应和疫霉病抗性,通过降低GmLMM1基因的表达量,能够有效增强植物PTI免疫反应,提高植物的疫霉病抗性。GmLMM1基因的克隆和功能发现为抗疫霉病相关机制研究提供了重要的基因基础及理论支持,为推进植物防御系统的研究和应用以及培育高抗病的大豆新品种提供宝贵的基因资源,在大豆抗病基因工程育种中具有重要的应用价值。
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公开(公告)号:CN110619297B
公开(公告)日:2024-05-14
申请号:CN201910855071.2
申请日:2019-09-10
Applicant: 中国科学院东北地理与农业生态研究所 , 山东大学
Abstract: 本发明涉及一种豆类植物子实图像批量采集识别方法及装置,包括图像采集单元、二维码识别单元、二维码分析单元、大图像识别单元、大图像处理单元、种子图像识别单元、种子图像筛选单元、种子图像命名单元、图像过滤单元、及图像输出单元。可实现批量化图像采集及图像分割,以及分割后单个图像命名和输出的功能。使得实现后期自动化获取种子的表型数据,为计算机的深度学习提供有效基础数据。本发明给出一个面向计算机视觉(CV)处理需求的机械装置,实现对豆科植物子实的批量标准化图像采集,一张照片可以拍摄多粒子实,方便该图像CV处理和归一化处理,实现了快速、无损检测,提高图像采集效率,加速子实图像处理速度,实现子实表型数据的统一标准化获取。
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公开(公告)号:CN116994154A
公开(公告)日:2023-11-03
申请号:CN202311092395.8
申请日:2023-08-29
Applicant: 之江实验室 , 中国科学院东北地理与农业生态研究所
Abstract: 本发明涉及无人机应用技术领域,具体公开了一种基于无人机的大豆苗期特征获取方法及系统,所述方法包括向地图服务发送卫星图获取请求,获取大豆种植区的卫星图;对所述卫星图进行识别,确定区域分隔线,根据所述区域分隔线建立检测路径;将检测路径向无人机组合发送,实时获取无人机组合的运动参数,根据运动参数确定大豆苗期特征;其中,所述无人机组合在检测路径上运动时,实时获取种植区图像,对种植区图像进行识别,根据识别结果实时调节运动参数。本发明将数据识别过程内置于无人机,通过定位器获取无人机的运动参数即可快速判定期苗特征,此外,还可以通过参数差定位可能存在缺陷的点,处理的源数据仅为位置信息,识别效率较高。
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公开(公告)号:CN116884481A
公开(公告)日:2023-10-13
申请号:CN202310697601.1
申请日:2023-06-13
Applicant: 之江实验室 , 中国科学院东北地理与农业生态研究所
IPC: G16B20/30 , G06N3/0464 , G06N3/0895 , G16B20/00
Abstract: 一种基于图卷积神经网络与自监督重构学习的基因到表型预测方法和系统,该方法基于图卷积神经网络的方法,将每个品种的大豆作为图节点,大豆的基因序列为节点的特征,利用每个品种大豆之间的亲缘关系作为图的边,将构建的图输入图卷积神经网络与自监督重构网络中,更新节点特征,实现大豆基因到表型的预测。本发明创新性的利用图卷积神经网络实现基因到表型的预测,利用自监督学习降低基因维度,并将品种之间的亲缘关系作为先验关联不同品种指导基因到表型挖掘,提高表型预测的效果。
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公开(公告)号:CN112746121B
公开(公告)日:2023-08-18
申请号:CN202011632698.0
申请日:2020-12-31
Applicant: 中国科学院东北地理与农业生态研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种与大豆农艺性状相关的SNP位点组合、基因芯片及应用,与大豆农艺性状相关的SNP位点组合,包括2193个SNP位点,每个SNP位点包含两个不同碱基变异位点,用于检测该位点的等位基因变化,所述2193个SNP位点的物理位置是基于大豆品种Williams82的全基因组序列比对确定的,所述大豆品种Williams82的全基因组序列的版本号为Glycine max Wm82.a2.v1,所述2193个SNP位点的变异信息如SS0001‑2193所示。本发明所采用的2193个SNP位点与大豆的重要农艺性状相关,可通过测定大豆植株DNA中这2193个SNP位点的基因型来评估大豆植株的农艺性状,将其应用于大豆的分子辅助育种或全基因组育种时,加快了育种进程。
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公开(公告)号:CN113736792B
公开(公告)日:2023-07-25
申请号:CN202110764142.5
申请日:2021-07-06
Applicant: 中国科学院东北地理与农业生态研究所
IPC: C12N15/29 , C12N15/82 , C07K14/415 , A01H5/00 , A01H6/54
Abstract: 本发明涉及基因工程技术领域,尤其涉及大豆GmTic110基因的突变体及其应用。本发明研究表明,大豆编码叶绿体膜蛋白的GmTic110基因突变,导致突变体叶绿素合成下降,叶绿体发育异常,影响了植株的光合作用。利用CRISPR/Cas9系统对野生型进行GmTic110基因的敲除,获得稳定的敲除转基因株系表现叶色黄化,与突变体表型一致。本发明为大豆叶绿体工程研究提供基因资源,可通过GmTIC110蛋白定向改造大豆叶绿体发育,提高大豆的光合作用,为高光效大豆品种培育提供种质资源,具有广阔的应用前景。
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