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公开(公告)号:CN110964804A
公开(公告)日:2020-04-07
申请号:CN201911350221.0
申请日:2019-12-24
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6883 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种评估抗结核药物治疗所致肝损伤风险的诊断试剂盒;所述试剂盒应用与抗结核药物治疗所致肝损伤风险相关的DNA甲基化生物标志物进行抗结核治疗肝损伤风险预测;所述标志物为位于NCX2基因上的CpG位点的甲基化水平,该CpG位点绝对位置为chr19:47447537-47447538(GRCh38)。本发明提供了一种针对chr19:4744753-47447538CpG位点DNA甲基化水平进行检测的核酸引物、检测方法及试剂盒;本发明提供的试剂盒能够有效评估抗结核药物治疗所致肝损伤的发病风险,促进抗结核精准用药的实现。
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公开(公告)号:CN109536600A
公开(公告)日:2019-03-29
申请号:CN201811545165.1
申请日:2018-12-17
Applicant: 上海市疾病预防控制中心 , 上海交通大学
IPC: C12Q1/6883 , C12N15/11
Abstract: 本发明所公开的一种基于UBXN11基因的多态性位点基因型预测A(H7N9)易感人群的用途,其特征在于,所述的UBXN11基因多态性位点为rs189256251,其中,所述的UBXN11基因rs189256251多态性位点有两种基因型,分别为CT和CC,当rs189256251多态性位点基因型为CT时,预测该样本为A(H7N9)易感人群,当rs189256251多态性位点基因型为CC时,预测该样本为A(H7N9)非易感人群。本发明还公开了一种基于UBXN11基因的多态性位点基因型预测A(H7N9)易感人群的试剂盒及基于UBXN11基因的多态性位点基因型预测A(H7N9)易感人群的分析方法。通过本发明所提供的预测A(H7N9)易感人群的方法快速、简便、有效、准确度高,为预测A(H7N9)易感人群后续靶向药的研制和进一步发病机理的研究提供了新的思路和方向。
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公开(公告)号:CN106434677A
公开(公告)日:2017-02-22
申请号:CN201610739062.3
申请日:2016-08-26
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明在中国人群MagR基因中分离出一种编码MagR突变体的核酸,该核酸包含MagR基因新的点突变位点(SNP位点),此SNP位点(+8333G>A)位于第二外显子前一个核苷酸,处于外显子和内含子交界的高度保守区域,提示此新的SNP位点参与了基因的可变剪接,改变了基因的结构,从而影响着MagR基因的功能。因此,针对中国人群的此位点检测具有重要的意义,因为MagR基因调节着生物体感知磁场方向的能力,而此新位点完全可以影响MagR基因调节着生物体感知磁场方向的能力。
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公开(公告)号:CN104411824A
公开(公告)日:2015-03-11
申请号:CN201280074086.1
申请日:2012-06-18
Applicant: 山东大学 , 山东山大附属生殖医院有限公司 , 上海交通大学
CPC classification number: C12Q1/6883 , C12Q2600/156 , C12Q2600/16
Abstract: 本发明提供与PCOS相关的SNP标记、用于检测所述SNP标记的探针、芯片、引物、试剂盒和方法。另外,本发明还提供所述探针、芯片和引物在预测和诊断PCOS风险中的应用。
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公开(公告)号:CN103512972A
公开(公告)日:2014-01-15
申请号:CN201310323000.0
申请日:2013-07-29
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一组可用于诊断精神分裂症的生物标志物,所述标志物可用于制备诊断精神分裂症的检测试剂或检测试剂盒。基于该标志物,本发明还提供了用于诊断精神分裂症的检测试剂盒、检测试剂和芯片或阵列,以及利用该标志物诊断精神分裂症的方法。本发明的方法简便易行,诊断结果可靠并且兼顾了灵敏度和特异度。
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公开(公告)号:CN102559872B
公开(公告)日:2014-01-15
申请号:CN201110410178.X
申请日:2011-12-09
Applicant: 上海交通大学 , 复旦大学附属妇产科医院
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明涉及一种检测Angelman综合征的基因芯片及使用方法、试剂盒,所述基因芯片包括固相载体和固定在该固相载体上的探针,所述寡核苷酸探针为SEQ ID NO.1-50所示的核苷酸序列;所述使用方法包括如下步骤:(a)制备样品DNA片段;(b)荧光标记上述DNA片段;(c)洗脱上述标记产物;(d)将标记产物与所述基因芯片杂交;(e)扫描检测基因芯片的杂交信号,获得结果;本发明还涉及包含前述基因芯片的试剂盒。本发明的基因芯片操作步骤简单,检测特异性高,稳定性好,从样本抽提到得到扫描结果可在一个工作日内完成,成本低,适用于临床患者基因突变检测、产前诊断和正常人杂合子携带者检测。
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公开(公告)号:CN103014027A
公开(公告)日:2013-04-03
申请号:CN201210489352.9
申请日:2012-11-26
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种优化大肠杆菌脂肪酸合成途径的方法,在构建大肠杆菌脂肪酸代谢途径关键蛋白FabG、FabZ、FabI、TesA’的步骤中,将不同数量的大肠杆菌稀有密码子AGG分别插入所述大肠杆菌脂肪酸代谢途径关键基因FabG、FabZ、FabI和TesA’中。本发明的方法可以在生物体内对基因表达进行精确地调控,进而优化相应代谢途径,采用本发明方法构建的大肠杆菌生产脂肪酸系统可以高效地生产胞外脂肪酸,其脂肪酸产量约为无稀有密码子AGG的非调控系统的两倍。
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公开(公告)号:CN102918158A
公开(公告)日:2013-02-06
申请号:CN201080067164.6
申请日:2010-05-31
Applicant: 山东大学 , 山东山大附属生殖医院有限公司 , 上海交通大学
CPC classification number: C12Q1/6886 , C12Q1/6883 , C12Q2600/156 , C12Q2600/172
Abstract: 本发明提供了与多囊卵巢综合征(PCOS)相关的SNP,这些SNP在数以千计的中国PCOS病例中被发现。本发明还提供了具有所述SNP的探针和包括一个或多个这些探针的芯片。所述探针和芯片可以用于筛选、预测或诊断PCOS。
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公开(公告)号:CN102191329A
公开(公告)日:2011-09-21
申请号:CN201110109934.5
申请日:2011-04-29
Applicant: 上海交通大学 , 上海佰真生物科技有限公司
IPC: C12Q1/68
Abstract: 一种分子生物技术领域的检测重度抑郁关联基因的试剂盒及其制备方法。试剂盒PCR试剂组和LDR试剂组,其中:PCR试剂组包括:缓冲液,dNTP混合液,Taq DNA聚合酶,纯水,四对PCR专用扩增引物;LDR试剂组包括:缓冲液,dNTP混合液,Taq DNA连接酶,纯水,四组LDR专用探针。制备方法包括:PCR引物的设计及合成:PCR引物采用引物设计软件PRIMER3进行引物设计,TM值选择60度左右;LDR探针的设计及合成:LDR探针每个位点包括三条,两条5’端探针和一条3’端探针;Taq DNA聚合酶和Taq DNA连接酶采用TAKARA的产品或New England Biolabs的产品。本发明可以实现对重度抑郁关联基因内特定SNP位点的快速、高效、准确的分型。
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公开(公告)号:CN102146481A
公开(公告)日:2011-08-10
申请号:CN201110110282.7
申请日:2011-04-29
Applicant: 上海交通大学 , 上海佰真生物科技有限公司
Abstract: 本发明涉及一种CYP2E1基因第七号外显子的单核苷酸多态性的检测方法,同时涉及一种分离核酸、一种等位基因特异性的核酸引物。方法包括:确定在人CYP2E1基因第七号外显子的SEQ ID NO.1所示序列的第1009位的核苷酸;检测在所述位置是否存在单核苷酸多态性;一种分离核酸,具有SEQ ID NO.1所示的序列,且第1009位为T;一种等位基因特异性的核酸引物,其长度为15-50bp,且特异性地杂交并扩增出含人CYP2E1基因的第七号外显子的SEQ ID NO.1所示序列的第1009位的单核苷酸多态性的扩增产物。本发明可用于研究我国人群中CYP2E1基因多态性与临床用药安全的关系,为新药研发提供指导依据。
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