公开(公告)号：CN105631244A

公开(公告)日：2016-06-01

申请号：CN201511024251.4

申请日：2015-12-30

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 宋月红 ,  黄涛 ,  蔡雷 ,  陈文忠 ,  贺林

IPC: G06F19/18

CPC classification number: G06F19/18

Abstract: 本发明提供了一种预测两种疾病共同致病基因的方法，包括以下步骤：分别收集已知的两种疾病的致病基因，及获取该两种疾病的蛋白作用网络；寻找上述两种疾病的致病基因对应的蛋白在蛋白网络中的位置；基于位置进行基因扩展后从扩展基因中的重叠基因中寻找得到两种疾病的共同致病基因。该方法通过在两种疾病的基因对应的蛋白作用网络图中进行基因扩展，并在扩展基因中的共同基因中选取两种疾病的共同致病基因，并在预测过程中应用了随机游走方法、基因集富集分析法及超几何检验法，使得共同致病基因的选取更加准确。本发明方法能够预测可能影响到两种疾病的关键驱动基因，可实现精准医疗。

公开(公告)号：CN105631244B

公开(公告)日：2018-05-29

申请号：CN201511024251.4

申请日：2015-12-30

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 宋月红 ,  黄涛 ,  蔡雷 ,  陈文忠 ,  贺林

IPC: G06F19/18

Abstract: 本发明提供了一种预测两种疾病共同致病基因的方法，包括以下步骤：分别收集已知的两种疾病的致病基因，及获取该两种疾病的蛋白作用网络；寻找上述两种疾病的致病基因对应的蛋白在蛋白网络中的位置；基于位置进行基因扩展后从扩展基因中的重叠基因中寻找得到两种疾病的共同致病基因。该方法通过在两种疾病的基因对应的蛋白作用网络图中进行基因扩展，并在扩展基因中的共同基因中选取两种疾病的共同致病基因，并在预测过程中应用了随机游走方法、基因集富集分析法及超几何检验法，使得共同致病基因的选取更加准确。本发明方法能够预测可能影响到两种疾病的关键驱动基因，可实现精准医疗。

公开(公告)号：CN106434677A

公开(公告)日：2017-02-22

申请号：CN201610739062.3

申请日：2016-08-26

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 琚明亮 ,  蔡雷 ,  宋月红 ,  陈文忠 ,  贺林

IPC: C12N15/12 ,  C12Q1/68

Abstract: 本发明在中国人群MagR基因中分离出一种编码MagR突变体的核酸，该核酸包含MagR基因新的点突变位点(SNP位点)，此SNP位点(+8333G>A)位于第二外显子前一个核苷酸，处于外显子和内含子交界的高度保守区域，提示此新的SNP位点参与了基因的可变剪接，改变了基因的结构，从而影响着MagR基因的功能。因此，针对中国人群的此位点检测具有重要的意义，因为MagR基因调节着生物体感知磁场方向的能力，而此新位点完全可以影响MagR基因调节着生物体感知磁场方向的能力。