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公开(公告)号:CN115985392A
公开(公告)日:2023-04-18
申请号:CN202310051198.5
申请日:2023-02-02
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 一种高密度样品基因测序方法,通过分别采集按二维点阵排列的高密度测序样品的A、C、T、G四通道荧光采集图像各一次并确定每个荧光信号的衍射斑中心位置,从而计算得到样品点阵的整体空间位置分布并确定每一个样品点在成像时单独存在信号情况下的荧光信号计算图像,再根据该荧光信号图像对耦合图像进行解耦,得到每个样品点的信号强度,通过对每一样品点在每一次成像时不同波长通道的信号强度分析,确定每一样品点中核酸的碱基排布顺序。本发明在现有测序仪器的基础上,最小可以将样品分布间距减小到成像系统分辨率的0.45倍,且保持读取错误率为万分之一。缩小样品间距到成像系统分辨率的0.36倍,保持错误率为千分之一。
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公开(公告)号:CN106199075B
公开(公告)日:2019-01-22
申请号:CN201610482237.7
申请日:2016-06-27
Applicant: 上海交通大学
IPC: G01Q30/20
Abstract: 本发明提出一种用于原子力显微镜表征的样品制备方法,包括下列步骤:步骤一:将大环分子样品溶解于第一溶剂中,形成均匀分散的大环分子单体溶液;步骤二:将基底放入第二溶剂饱和蒸汽环境,在基底表面加入一定量步骤一所配置大环分子单体溶液;步骤三:将带有上述溶液的基底在第二溶剂饱和蒸汽环境放置孵育一定时间,使大环分子在基底表面自组装形成紧密排列的纳米管单层;步骤四:将上述步骤三所得纳米管样品放置于真空中,使基底表面第一溶剂与第二溶剂充分挥发,使表面大环分子停止动态自组装过程。本发明提出的用于原子力显微镜表征的样品制备方法,具有可获得基底表面紧密排列纳米管单层,更加适用于原子力显微镜高分辨结构表征研究的特点。
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公开(公告)号:CN106199078B
公开(公告)日:2019-01-18
申请号:CN201610482141.0
申请日:2016-06-27
Applicant: 上海交通大学
IPC: G01Q60/24
Abstract: 本发明提出一种活体细胞原子力显微镜快速精确表征方法,包括如下步骤:步骤一:使用原子力显微镜获取细胞表面弹性值基本稳定的作用力范围,及其对应杨氏模量值;步骤二:使用原子力显微镜获得活体细胞在设定成像力下的来回扫描高度图像;步骤三:对探针与细胞间相互作用进行受力分析,将两者间相互作用分解为竖直成像力与水平侧向力;步骤四:根据成像力大小、在此力下细胞表面形貌、细胞表面弹性系数计算获得细胞在未受作用力时细胞表面形貌。本发明提出的活体细胞原子力显微镜快速精确表征方法,具有较高精度,较高时间分辨率等特点。
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公开(公告)号:CN106199078A
公开(公告)日:2016-12-07
申请号:CN201610482141.0
申请日:2016-06-27
Applicant: 上海交通大学
IPC: G01Q60/24
CPC classification number: G01Q60/24
Abstract: 本发明提出一种活体细胞原子力显微镜快速精确表征方法,包括如下步骤:步骤一:使用原子力显微镜获取细胞表面弹性值基本稳定的作用力范围,及其对应杨氏模量值;步骤二:使用原子力显微镜获得活体细胞在设定成像力下的来回扫描高度图像;步骤三:对探针与细胞间相互作用进行受力分析,将两者间相互作用分解为竖直成像力与水平侧向力;步骤四:根据成像力大小、在此力下细胞表面形貌、细胞表面弹性系数计算获得细胞在未受作用力时细胞表面形貌。本发明提出的活体细胞原子力显微镜快速精确表征方法,具有较高精度,较高时间分辨率等特点。
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公开(公告)号:CN102749480A
公开(公告)日:2012-10-24
申请号:CN201210238366.3
申请日:2012-07-10
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明提出一种施加直流偏压提高静电力驱动原子力显微镜(AFM)探针悬臂振动幅度的方法。AFM探针悬臂背面的金属镀层和导电玻璃作为两个电极,在这两个电极间施加交流信号从而产生静电力来驱动悬臂振动,由于作用力直接施加于悬臂,避免了悬臂振动频谱图中除共振峰以外其它杂峰的出现;而进一步叠加直流信号来提高悬臂振动幅度,从而振动信号的信噪比增加,有利于锁定真正的悬臂共振频率,进而提高了仪器的分辨率。
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公开(公告)号:CN102507724A
公开(公告)日:2012-06-20
申请号:CN201110301093.8
申请日:2011-09-28
Applicant: 上海交通大学
IPC: G01N27/72
Abstract: 本发明提出一种基于磁场力的平行大通量单分子力谱方法,将单个分子连接于磁珠之上,放置于线圈中。通过直流升压电路对电容充电获得高电压,然后使电容对电磁线圈放电,线圈电流上升至一定水平后,直流稳压电源开始稳定对线圈供电,从而在短时间内迅速在线圈外部产生一个稳定磁场,对多个磁珠产生基本相同作用力。通过显微镜观察磁珠衍射斑的变化,判断磁珠相对基底之间的移动距离,使用相机间隔设定时间成像,从而可以同时得到多个分子进行单分子力谱测量。
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公开(公告)号:CN1814802A
公开(公告)日:2006-08-09
申请号:CN200510110434.8
申请日:2005-11-17
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 一种DNA芯片技术领域的实物芯片与图文的直接拷贝复制方法,步骤如下:1)在各种水溶性材料配成水溶液后,向其中加入由聚乙烯醇600、乙烯醇苯醚、聚乙二醇200、甘油、聚乙烯吡咯烷酮k-30溶液等体积混合而成的添加剂混合液,添加剂混合液加入溶液的量占溶液体积的0.1~3%;2)将步骤1)配制的溶液作为原料在乳胶橡胶膜表面构建母体模板;3)将母体模板至于通风干燥处放置,使溶液进一步浓缩;4)以母体模板为模板,使母体模板分布有材料的一面与另一空白的乳胶膜表面接触,以胶辊辗压使母体模板上的内容转移到空白乳胶膜表面;5)重复上面第4)步的复印操作,得到多个拷贝复制品。本发明操作简单,成本低廉,应用范围广,可以多次复制。
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公开(公告)号:CN111518959A
公开(公告)日:2020-08-11
申请号:CN202010504396.9
申请日:2020-06-05
Applicant: 上海市计量测试技术研究院 , 上海交通大学 , 中国科学院上海高等研究院
IPC: C12Q1/70 , C12Q1/6851 , C12N15/11 , C12R1/93
Abstract: 本发明提供了新型冠状病毒的数字PCR检测方法及试剂盒,具体地本发明针对新型冠状病毒ORF1ab基因和E基因设计了双重数字PCR检测体系,实验结果表明本发明的双重数字PCR检测体系具有极高的灵敏度和准确性。
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公开(公告)号:CN110887825A
公开(公告)日:2020-03-17
申请号:CN201911260222.6
申请日:2019-12-10
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明提供了一种基于可控磁场的生物力学参数测量方法,包括下列步骤:磁性物体与生物样品接触;通过磁场对多个磁性物体同时产生作用力,磁性物体受到磁场作用,对作为生物样品产生作用力;检测记录磁性物体的运动轨迹;通过分析磁性物体所受磁场力与其运动轨迹的关系,获得作为测量对象的生物样品有关的力学参数的表征。在本发明提供的基于可控磁场的生物力学参数测量方法中,磁场源产生磁场对磁性物体产生作用力,磁性物质受力对生物样品产生形变,通过测试磁性物体的运动轨迹,从而获得生物样品的形变,最终获得生物样品的受力的力学参数。
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公开(公告)号:CN107727732A
公开(公告)日:2018-02-23
申请号:CN201711139298.4
申请日:2017-11-16
Applicant: 上海交通大学
IPC: G01N27/72
CPC classification number: G01N27/72
Abstract: 本发明公开了一种用于蛋白相互作用组单分子力谱方法,用于高效测量多种不同生物分子间单分子相互作用。该方法通过磁场对待测生物分子微阵列表面所有磁性物质产生作用力,使磁性物质对连接在其与基底间的生物分子或生物分子对产生作用力;通过磁性物质在微阵列上位置,获得对应的与该磁性物质连接的生物分子或生物分子对种类,再通过检测记录磁性物质空间运动轨迹,来分析获得该生物分子或生物分子对的物理化学参量的表征信息。本发明具有高效、连续、高通量测量等优点。
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