公开(公告)号：CN110767266A

公开(公告)日：2020-02-07

申请号：CN201911064826.3

申请日：2019-11-04

Applicant: 山东省计算中心(国家超级计算济南中心) ,  青岛海洋科学与技术国家实验室发展中心

Inventor： 杨帅 ,  王卓亚 ,  王小红 ,  赵志刚 ,  窦方坤 ,  曹皓伟 ,  魏志强 ,  刘昊 ,  杨金波

IPC: G16B40/00 ,  G16B15/30

Abstract: 本发明的基于图卷积的面向ErbB靶向蛋白家族的打分函数构建方法，包括：a).构建ErbB靶向蛋白数据，对于ErbB包含的4个受体酪氨酸激酶ErbB-1、ErbB-2、ErbB-3和ErbB-4均构建靶向蛋白数据集；b).扩大数据集规模，采用原始构象、旋转构象、优化构象的方法扩大数据集规模；c).构建ErbB靶向蛋白家族机器学习打分函数模型；d).模型的训练和评估。本发明的打分函数构建方法，建了一个ErbB蛋白家族机器学习分子亲和力评估数据集，为ErbB蛋白家族的机器学习任务奠定了数据基础；通过GCN技术突破了经典打分函数的瓶颈，提高了打分函数的性能，解决了机器学习打分函数通用模型准确率低的问题。

公开(公告)号：CN114399006B

公开(公告)日：2022-07-12

申请号：CN202210292433.3

申请日：2022-03-24

Applicant: 山东省计算中心(国家超级计算济南中心)

Inventor： 王英龙 ,  杨帅 ,  武鲁 ,  郭莹 ,  潘景山 ,  王春晓 ,  赵志刚 ,  卢晶晶 ,  李丽君

IPC: G06K9/62 ,  G06F16/901 ,  G06F16/904

Abstract: 本公开提供了一种基于超算的多源异构图数据融合方法及系统，涉及多源异构图数据处理技术领域，采用虚拟化服务器通过镜像模拟知识本体构建工具的运行环境，并以数据服务接口的方式将多个知识本体构建方法进行统一整合，能够集成知识标注、知识抽取、知识融合等图数据处理工具，实现多源异构数据的图数据融合，并且采用大规模知识图谱分布式存储方式，实时存储解析后的多源异构数据；对历史存储的多源异构数据进行统计分析，得到统计分析结果并进行可视化展示，其数据融合自动化程度高、融合速度快，可拓展性强，可支撑一站式图数据处理操作，另外，采用虚拟化技术完成各种工具环境部署，具有算力强大、硬件条件高、安全性高、性能优越的特点。

公开(公告)号：CN114399006A

公开(公告)日：2022-04-26

申请号：CN202210292433.3

申请日：2022-03-24

Applicant: 山东省计算中心(国家超级计算济南中心)

Inventor： 王英龙 ,  杨帅 ,  武鲁 ,  郭莹 ,  潘景山 ,  王春晓 ,  赵志刚 ,  卢晶晶 ,  李丽君

IPC: G06K9/62 ,  G06F16/901 ,  G06F16/904

Abstract: 本公开提供了一种基于超算的多源异构图数据融合方法及系统，涉及多源异构图数据处理技术领域，采用虚拟化服务器通过镜像模拟知识本体构建工具的运行环境，并以数据服务接口的方式将多个知识本体构建方法进行统一整合，能够集成知识标注、知识抽取、知识融合等图数据处理工具，实现多源异构数据的图数据融合，并且采用大规模知识图谱分布式存储方式，实时存储解析后的多源异构数据；对历史存储的多源异构数据进行统计分析，得到统计分析结果并进行可视化展示，其数据融合自动化程度高、融合速度快，可拓展性强，可支撑一站式图数据处理操作，另外，采用虚拟化技术完成各种工具环境部署，具有算力强大、硬件条件高、安全性高、性能优越的特点。

公开(公告)号：CN112380345B

公开(公告)日：2022-03-29

申请号：CN202011313700.8

申请日：2020-11-20

Applicant: 山东省计算中心(国家超级计算济南中心)

Inventor： 杨帅 ,  王小红 ,  赵志刚 ,  窦方坤 ,  曹皓伟 ,  潘景山 ,  魏志强

IPC: G06F16/35 ,  G06F16/36 ,  G06F40/232 ,  G06F40/258 ,  G06F40/284 ,  G06F40/289

Abstract: 本发明的基于GNN的COVID‑19科学文献细粒度分类方法，包括：a).COVID‑19科学文献知识图谱的构建；a‑1).知识类别的划分；a‑2).科学文献中实体设计；a‑3).科学文献中关系设计；a‑4).构建COVID‑19科学文献知识图谱；b).西药治疗知识图谱构建；c).中药治疗知识图谱构建；d).构建图神经网络模型；e).文本分类。本发明的基于GNN的COVID‑19科学文献细粒度分类方法，为医学工作者在海量的（通常大于1万篇）有关COVID‑19科学文献中快速查找到自己所需的知识类别文献，提供了一种行之有效的筛选和分类方法，有益效果显著，适于应用推广。

公开(公告)号：CN112417166B

公开(公告)日：2022-08-26

申请号：CN202011309998.5

申请日：2020-11-20

Applicant: 山东省计算中心(国家超级计算济南中心)

Inventor： 杨帅 ,  王小红 ,  赵志刚 ,  窦方坤 ,  曹皓伟 ,  潘景山 ,  魏志强

IPC: G06F16/36 ,  G16B50/30

Abstract: 本发明的知识图谱三元组置信度评价方法，包括评估阶段、融合阶段和校验阶段，a).实体层面评估；a‑1).数据源角度；a‑2).文献共现角度；a‑3).外链规模角度；a‑4).文本描述角度；a‑5).实体重要性角度；a‑6).实体的度的角度；b).关系层面评估；b‑1).数据源角度；b‑2).文献共现角度；b‑3).对实体间已知关系层面的评价；b‑4).对实体间未知关系层面的评价；c).知识图谱全局层面评估。本发明的知识图谱三元组置信度评价方法，可高效、快速、大规模的发掘知识图谱数据中的错误，进而提升整个知识图谱系统的数据质量；可以对链接预测、关系推理等机器学习任务的结果进行数据可靠性校验。

公开(公告)号：CN111125347A

公开(公告)日：2020-05-08

申请号：CN201911376996.5

申请日：2019-12-27

Applicant: 山东省计算中心(国家超级计算济南中心)

Inventor： 窦方坤 ,  王小红 ,  赵志刚 ,  潘景山 ,  郭莹 ,  霍吉东 ,  杨帅 ,  曹皓伟

IPC: G06F16/338 ,  G06F16/36

Abstract: 本发明的基于unity3d的知识图谱3D可视化方法，包括：a).摄像机、天空盒和场景初始化；b).三元组数据获取；c).预制体的创建及三维物理结构组织；d).三维力学模型构建；e).帧循环；f).沉浸式摄影机脚本；g).全局摄影机脚本；h).属性信息显示及UI绘制；i).检索功能及传送功能；j).沉浸视图、全局视图切换。本发明的基于unity3d的知识图谱3D可视化方法，具有良好的可移植性和可扩展性，可以发布到web、手机、PC等多种平台，而不会像WebGL等技术一样开发后即对平台具有高度依赖；另一方面表现在未来可以方便的扩展至虚拟现实、增强现实等新兴的显示技术上，实现更广阔、更沉浸、更具互动性的知识图谱3D可视化。