一种基于SNPLDB标记的限制性二阶段全基因组关联分析方法

    公开(公告)号:CN104651517B

    公开(公告)日:2017-05-31

    申请号:CN201510092169.9

    申请日:2015-03-02

    Abstract: 本发明公开了一种基于SNPLDB标记的限制性二阶段全基因组关联分析方法,以解决传统方法无法估计复等位基因信息、假阳性率高以及在近交作物中检测功效低的问题。本发明结合基于单倍型区块构建的SNPLDB标记、近交群体关联分析模型偏差的矫正和多位点模型下二阶段关联分析策略,建立了适合于近交作物常规育种的GWAS方法。该方法将SNPLDB标记用于GWAS,为复等位基因估计提供了方法,第一阶段基于单位点模型来筛选候选位点,第二阶段基于多位点模型下的逐步回归分析方法作进一步筛选以平衡缺失遗传率和遗传率估计过高的问题,从而将最终遗传模型的解释率控制到性状遗传率。GWAS使用由SNPLDB标记估计的相似系数矩阵的特征向量和合适的显著水平来提高定位的准确性和功效。

    肠杆菌耐草甘膦基因argF、编码蛋白及其应用

    公开(公告)号:CN105177029A

    公开(公告)日:2015-12-23

    申请号:CN201510694936.3

    申请日:2015-10-22

    Abstract: 本发明属于基因工程技术领域,具体公开了一种肠杆菌耐草甘膦基因argF、编码蛋白及其应用。该基因克隆自草甘膦抗性进化的肠杆菌,其核苷酸序列如Seq ID NO.1所示。本发明发现通过任何一种可以导入外源基因argF的植物表达载体转化植物细胞可获得过表达argF的转基因植株,与未转基因植株相比其耐草甘膦能力得到提高。本发明公开的基因可作为目的基因导入植物,提高转基因植物抗草甘膦的能力,对培育抗草甘膦作物有重要意义。

    一种基于SNPLDB标记的限制性二阶段全基因组关联分析方法

    公开(公告)号:CN104651517A

    公开(公告)日:2015-05-27

    申请号:CN201510092169.9

    申请日:2015-03-02

    Abstract: 本发明公开了一种基于SNPLDB标记的限制性二阶段全基因组关联分析方法,以解决传统方法无法估计复等位基因信息、假阳性率高以及在近交作物中检测功效低的问题。本发明结合基于单倍型区块构建的SNPLDB标记、近交群体关联分析模型偏差的矫正和多位点模型下二阶段关联分析策略,建立了适合于近交作物常规育种的GWAS方法。该方法将SNPLDB标记用于GWAS,为复等位基因估计提供了方法,第一阶段基于单位点模型来筛选候选位点,第二阶段基于多位点模型下的逐步回归分析方法作进一步筛选以平衡缺失遗传率和遗传率估计过高的问题,从而将最终遗传模型的解释率控制到性状遗传率。GWAS使用由SNPLDB标记估计的相似系数矩阵的特征向量和合适的显著水平来提高定位的准确性和功效。

    大豆籽粒蛋白质含量主效QTL的分子标记及其应用

    公开(公告)号:CN103045588B

    公开(公告)日:2014-08-20

    申请号:CN201210531628.5

    申请日:2012-12-11

    Abstract: 本发明公开了大豆籽粒蛋白质含量主效QTL的分子标记及其应用。本发明大豆籽粒蛋白质含量主效QTL,所述主效QTL位点位于大豆第8号染色体Gm08:13000kb-17000kb。该分子标记的上游引物序列为SEQ ID NO.1,下游引物序列为SEQ ID NO.2。在新配置的杂交组合中,以待测F2单株大豆籽粒的基因组DNA为模板,Z56引物对进行PCR扩增,检测扩增产物,扩增产物中具有一个大小为180bp-190bp的特异DNA片段的待测大豆为候选的具有高籽粒蛋白质含量材料。利用本发明的分子标记可以简便快捷的筛选大豆籽粒高蛋白质材料,可以加快大豆籽粒高蛋白质含量育种。

    大豆GmMATE109基因及其应用
    16.
    发明授权

    公开(公告)号:CN116445508B

    公开(公告)日:2024-07-30

    申请号:CN202310501773.7

    申请日:2023-05-06

    Abstract: 本发明公开了大豆GmMATE109基因及其应用,属于植物基因工程领域。所述大豆GmMATE109基因核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,其编码蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。本发明构建了GmMATE109过表达载体,利用根癌农杆菌介导的遗传转化方法,将该基因转入受体大豆中并获得了稳定的过表达转基因大豆株系。在相同逆境处理下,发现该转基因大豆的耐旱性和耐盐性均比野生型大豆强,这说明大豆GmMATE109基因具有调控植物耐盐性和耐旱性的功能。本发明为培育耐逆植物品种奠定了基础,并且对于加速耐逆植物的育种进程以及提高育种效率有重要的理论意义和实践价值。

    大豆显性负效应等位基因Gmspp-D及其应用

    公开(公告)号:CN115851764A

    公开(公告)日:2023-03-28

    申请号:CN202211482169.6

    申请日:2022-11-24

    Abstract: 本发明公开了大豆显性负效应等位基因Gmspp‑D及其应用,本发明克隆了大豆茸毛密度调控因子的2个显性负效应等位基因Gmspp‑D(Gmspp‑D‑CDS‑1和Gmspp‑D‑CDS‑2)并构建了它们的过表达载体,转化大豆栽培品种Williams82(W82)获得了稳定的过表达株系。与对照材料W82相比,两种显性负效应等位基因的过表达都导致了大豆茸毛密度显著降低,实现目的基因的功能验证。本发明提供了大豆显性负效应等位基因Gmspp‑D在调控植物茸毛密度中的用途,并以此为例表明构建显性负效应突变体进行快速基因功能研究的可行性和高效性,在育种技术领域具有良好的应用前景。

    大豆GmCRF4a基因及其应用
    18.
    发明授权

    公开(公告)号:CN112779268B

    公开(公告)日:2022-07-01

    申请号:CN202110052193.5

    申请日:2021-01-15

    Abstract: 本发明公开了大豆GmCRF4a基因在调控植物高度和生育期中的应用。所述大豆GmCRF4a基因核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,其编码蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。研究发现低表达GmCRF4a基因的转基因植株相比野生型植株的株高变矮,生育期缩短;超表达GmCRF4a基因的转基因植株相比野生型植株的株高变高,生育期延长,说明GmCRF4a基因参与调控植物高度、生育期长短的生物学过程。本发明提供了大豆GmCRF4a基因在调控植物高度、生育期中的用途,该基因在育种技术领域具有良好的应用前景。

    大豆始花期主效QTL的分子标记indel15-1及其应用

    公开(公告)号:CN105671039B

    公开(公告)日:2019-05-07

    申请号:CN201610129122.X

    申请日:2016-03-07

    Abstract: 本发明公开了大豆始花期主效QTL的分子标记indel15‑1及其应用。本发明大豆始花期主效QTL位点位于大豆第15号染色体Gm15:48600kb‑49850kb区间,分子标记位于大豆第15号染色体Gm15:49588kb。该分子标记的上游引物序列为Seq ID NO.1,下游引物序列为Seq ID NO.2。在用该引物对扩增NJZNRIL群体中始花期长短不同的两组材料及新配置的次级群体中,含有180bp特异DNA片段的材料有一个较大的始花期表型值。本发明所提供的分子标记可用于大豆品种或品系始花期长短的筛选或鉴定,提高育种效率。

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