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公开(公告)号:CN110951580A
公开(公告)日:2020-04-03
申请号:CN201910932615.0
申请日:2019-09-29
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
IPC: C12M1/00 , C12M1/38 , C12M1/34 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了一种高通量单细胞转录组与基因突变整合分析一体化装置,包括高通量单细胞编码芯片和整合分析装置;所述整合分析装置包括壳体以及设置在所述壳体内的温控热循环模块、荧光成像模块和数据存储分析模块,所述荧光成像模块包括光源组件、显微物镜、荧光分光组件和成像探测器。本发明通过设计具有微孔空间坐标、细胞核酸标签和分子核酸标签的三重编码功能的高通量单细胞编码芯片,可将单细胞的基因突变、转录组和蛋白表达信息一一对应起来;再通过温控热循环模块可实现PCR扩增,通过荧光成像模块采集样品的荧光图像,通过数据存储分析模块对荧光图像进行存储于分析,能实现单细胞转录组与基因突变整合分析。
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公开(公告)号:CN117523014A
公开(公告)日:2024-02-06
申请号:CN202311315296.1
申请日:2023-10-11
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
IPC: G06T11/00 , G06N3/0455 , G06N3/0464 , G06N3/08
Abstract: 本发明涉及一种内窥SS‑OCT图像分层方法、设备及存储介质,该方法包括以下步骤:获取采集的结直肠内窥OCT图像;对结直肠内窥OCT图像进行预处理;裁剪结直肠内窥OCT图像提取感兴趣区域;将处理后的结直肠内窥OCT图像作为多级上下文信息聚合网络模型的输入,实现结直肠内窥OCT图像粘膜层、固有肌层、混合组织层次区域和肿瘤区域的分层。本发明在Unet编码器阶段采用双分支并行结构,在解码器中采用多级输出结构,在解码器的最底层引入改进的通道注意力机制,不仅提高了内窥扫频光学相干层析图像的分层精确性,还有助于临床医生更有效地观察和诊断病变组织区域,具有重要的应用价值和意义,降低了早期诊断的漏诊率。
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公开(公告)号:CN113655026A
公开(公告)日:2021-11-16
申请号:CN202110897601.7
申请日:2021-08-05
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
IPC: G01N21/359 , G01N21/19 , G01N21/64 , G02B21/00 , G02B21/04
Abstract: 本发明公开了一种椭半球曲面大视野高通量双光子显微镜,包括:近红外飞秒脉冲激光器联组、分束延时模块联组、扫描单元联组、合束拼接模块、椭球曲面大视野反射式物镜、二向色片和光电倍增管探测阵列。本发明通过反射式物镜的设计来实现椭圆曲面大视野,能将平面矩形的激光扫描场转换成椭圆半球面的激光扫描场;通过采用多路激光并行扫描和多路荧光并行的探测方式能实现高通量扫描,利用四色原理,将不相邻区域划分为一组,利用区域间隙和合并式半波片最大化多次偏振合束的能量效率;不组激光之间引入延时,通过同时点的区域不相邻、相邻的区域不同时的方案,在时间和空间上能有效区分荧光信号的来源区域,极大程度地避免荧光散射带来的信号串扰。
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公开(公告)号:CN113643396A
公开(公告)日:2021-11-12
申请号:CN202110897589.X
申请日:2021-08-05
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
Abstract: 本发明公开了一种扫频OCT图像处理方法及装置,该方法包括以下步骤:S1、干涉数据处理:对扫频OCT系统得到的干涉数据进行加窗处理以抑制噪声信号,然后再进行傅里叶变换,得到样品图像P0;S2、去除背景信息:对样品图像P0每行取平均提取条纹背景信息,然后对提取到的背景信息进行膨化操作得到背景图像,最后将样品图像P0减去背景图像,得到去除了图像条纹状伪影的OCT图像。本发明的方法能够对扫频OCT图像出现的散斑噪声、扫频光源噪声和光路条状伪影进行有效去除,从而可对OCT图像进行优化,提高OCT图像质量,应用于医学图像处理中时,能够便于医生从图像中准确、快速获取对诊断和观察病人病情有参考价值的信息。
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公开(公告)号:CN110734854B
公开(公告)日:2021-08-24
申请号:CN201910911821.3
申请日:2019-09-25
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
IPC: C12M1/38 , C12M1/34 , C12M1/00 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种超高通量单细胞核酸分子实时荧光定量分析一体化快速检测系统,包括:微流控芯片、自动加样装置、温控热循环装置、荧光成像系统以及数据存储分析系统;所述自动加样装置具有X轴、Y轴和Z轴方向的自由度,用于将样品和试剂自动加入所述微流控芯片内;所述数据存储分析系统对采集的样品的荧光信号进行分析,识别阳性样本,并绘制出阳性样本的实时荧光定量分析曲线。本发明的超高通量单细胞核酸分子实时荧光定量分析一体化快速检测系统,集成微流控芯片、自动加样装置、温控热循环装置、荧光成像系统以及数据存储分析系统,可实现样品的自动化检测处理,能十万量级、百万量级的单细胞捕获核酸扩增以及实时荧光定量曲线分析。
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公开(公告)号:CN111938602A
公开(公告)日:2020-11-17
申请号:CN202010897559.4
申请日:2020-08-31
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
IPC: A61B5/00
Abstract: 本发明提供用于OCT成像系统的信号处理方法,包括如下步骤:高速扫频光源模块输出高频激光至主光学系统的同时输出第一脉冲信号至逻辑控制模块;高频激光经过主光学系统后分成两束激光,按原路返回的两束干涉光进入高速平衡探测器探测模块中,逻辑控制模块对第一脉冲信号进行判断处理后输出第三脉冲信号至高速采集集成模块,第三脉冲信号用以触发高速采集集成模块进行数据采集。本发明还涉及OCT成像系统、存储介质。本发明从硬件上准确控制每帧图像的开始位置,上位机提取的图像数据是经过硬件准确对准并经过FPGA硬件进行FFT变换的图像数据,不需要在上位机进行数据校正,不仅提高获取的图像数据的准确性而且降低了工作量。
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公开(公告)号:CN111064325B
公开(公告)日:2025-05-27
申请号:CN201911192544.1
申请日:2019-11-28
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所 , 南京国科精准医学科技有限公司
Abstract: 本发明提供一种FPGA控制板,包括FPGA控制板本体,所述FPGA控制板本体包括板体与若干信号接口,若干信号接口固定安装于板体的边缘处,若干信号接口中包括至少一电源接口;信号接口包括第一接口与第二接口;第一接口与第二接口分别配置于板体的两端面,第一接口与第二接口分别连接相邻且不同的FPGA控制板本体的信号接口。本发明还涉及一种基于FPGA的多电机的拓扑级联装置及协同控制系统。本发明通过一个板体的第一接口对应连接另一个板体的第二接口使得FPGA控制板本体在进行拓扑连接的时候无需其他连接工具,可自行实现三维立体的网络架构且拓扑级联结构通过并行处理方式使得若干电机组件被同时控制,提高多电机组件同步控制的精度。
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公开(公告)号:CN118674662A
公开(公告)日:2024-09-20
申请号:CN202410717283.5
申请日:2024-06-04
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
Abstract: 本发明公开了一种适用于旋转内窥双光子显微成像系统的图像校正方法,属于显微成像领域,通过对原始图像进行预处理,提取预处理后图像中的目标物体每行像素的起始位置和长度,目标每行像素的起始位置是目标最左端的边界点,从目标物体提取的每行像素需要是连续有值,由左向右依次提取,当检测到若干个连续的像素值为0时,则停止提取,已经提取到的长度即为所述的目标每行像素长度;对提取到的起始位置和长度进行扩大,并计算每行的调整偏移量;利用每行的偏移量对原始图像进行校正,通过上述步骤,可以实时提取标记物体的偏移信息,并对目标物体实时校正,提高图像质量,改善视觉体验,纠正图像扭曲错位,并且具有实时反馈和自动化处理的优点。
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公开(公告)号:CN117618069A
公开(公告)日:2024-03-01
申请号:CN202410044521.0
申请日:2024-01-11
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所 , 复旦大学附属华山医院
Abstract: 本发明公开了一种自适应实时反馈血肿清除装置以及方法,属于脑神经外科领域,负压吸引器通过引流管抽吸颅内血肿,固液相态压力传感器安装于引流管端部,固液相态压力传感器测量颅内实时压力以及实时粘弹性,流速传感器测量引流管实时抽吸流速,内窥镜镜体获取颅内实时图像,控制模组包括数据处理模块,数据处理模块根据颅内实时图像判断血肿是否清除干净,当血肿未清除干净时,数据处理模块根据颅内实时压力以及实时粘弹性进行自适应调节,输出负压吸引器的反馈吸引负压和吸引流速,负压吸引器根据反馈的吸引负压和吸引流速工作,实现血肿清除程度的智能反馈和自动控制,减少不同医生手术操作的差异性,实现脑血肿清除术的一致性。
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公开(公告)号:CN117598658A
公开(公告)日:2024-02-27
申请号:CN202410044213.8
申请日:2024-01-11
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所 , 复旦大学附属华山医院
Abstract: 本发明公开了一种脑血肿识别装置以及方法,属于脑神经外科领域,照明组件包括白光光源、近红外光源以及导光束,白光光源以及近红外光源的光经过导光束照射至脑组织,鱼眼透镜安装于镜体末端,分光棱镜位于第一图像传感器以及第二图像传感器之间,鱼眼透镜收集到来自组织的光线后传递至分光棱镜,穿过分光棱镜的透射光进入第二图像传感器形成近红外光图像,分光棱镜反射的光进入第一图像传感器形成白光图像,图像处理组件将近红外光图像与白光图像融合为一幅图像,利用血肿与正常脑组织对近红外光吸收存在的显著差异,增强血肿与脑组织的对比度,能够更加准确地区分血肿与脑组织的边界。
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