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公开(公告)号：CN107354222A
公开(公告)日：2017-11-17
申请号：CN201710761216.3
申请日：2017-08-30
Applicant: 中国林业科学研究院热带林业研究所
Abstract: 本发明公开了用于鉴定桉树无性系的STR引物、PCR试剂盒及方法。本发明通过大量的STR标记分型检测，筛选出了8对多态性高、扩增条带清晰的桉树STR引物用于鉴定桉树无性系，并建立了多重荧光检测体系。将该STR引物组用于鉴定桉树无性系，具有效率高、检测准确、操作方便等优势。本发明可有效甄别假冒和错乱的无性系，切实保障良种培育人和营林种植者的权益；并可为今后快速进行桉树种质资源遗传评价、遗传图谱构建、分子标记辅助育种、无性系指纹图谱构建和鉴定提供重要的技术支撑。
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公开(公告)号：CN106323908A
公开(公告)日：2017-01-11
申请号：CN201610696498.9
申请日：2016-08-19
Applicant: 中国林业科学研究院热带林业研究所
IPC: G01N21/359 , G01N1/28
CPC classification number: G01N21/359 , G01N1/286
Abstract: 本发明公开一种测定大花序桉木材基本密度和生材密度的方法，包括以下步骤：(1)木屑样品采集；(2)木屑样品的近红外光谱扫描；(3)木材基本密度和生材密度的标准测定；(4)光谱预处理和模型的建立与优化；(5)模型外部检验与选择；(6)模型应用。与传统的标准测量木材密度的方法相比，本发明提供的大花序桉木材基本密度和生材密度的近红外光谱测定法是一种对活立木无损的方法，克服了常规的木材密度标准测定时间长和易出现误差的缺点，该方法具有简便快捷、准确性高、可靠性好、成本低等优点。
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公开(公告)号：CN103593659B
公开(公告)日：2016-09-14
申请号：CN201310611263.1
申请日：2013-11-26
Applicant: 华南农业大学 , 中国林业科学研究院热带林业研究所
Abstract: 本发明公开了一种针对二倍体PCR产物的Sanger测序中个体内SNP的识别方法，首先单独分离出色谱图中包含的腺瞟呤A、鸟瞟呤G、胞嘧啶C和胸腺嘧啶T四种碱基的荧光数据；采用小波多尺度分析方法对分离的荧光数据分别进行滤波去噪处理；再分析四种碱基荧光数据的波形特征，检测出波形的第一峰与第二峰，选择波峰距离、高度比值和起伏度比值这三个波形特征，作为SNP位点判别的要素；选择结构为3‑10‑1的BP神经网络作为SNP位点检测的分类器，并采用Levenberg Marquardt算法来对BP神经网络进行训练；采用分段线性变换将输出映射为0～100的SNP评价分数，根据评价分数将SNP位点的类别定义为1～5级，并据此判定该位点的SNP置信度。本发明能够有效检测测序文件的个体内SNP位点。
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公开(公告)号：CN103593659A
公开(公告)日：2014-02-19
申请号：CN201310611263.1
申请日：2013-11-26
Applicant: 华南农业大学 , 中国林业科学研究院热带林业研究所
Abstract: 本发明公开了一种针对二倍体PCR产物的Sanger测序中个体内SNP的识别方法，首先单独分离出色谱图中包含的腺瞟呤A、鸟瞟呤G、胞嘧啶C和胸腺嘧啶T四种碱基的荧光数据；采用小波多尺度分析方法对分离的荧光数据分别进行滤波去噪处理；再分析四种碱基荧光数据的波形特征，检测出波形的第一峰与第二峰，选择波峰距离、高度比值和起伏度比值这三个波形特征，作为SNP位点判别的要素；选择结构为3-10-1的BP神经网络作为SNP位点检测的分类器，并采用Levenberg Marquardt算法来对BP神经网络进行训练；采用分段线性变换将输出映射为0～100的SNP评价分数，根据评价分数将SNP位点的类别定义为1～5级，并据此判定该位点的SNP置信度。本发明能够有效检测测序文件的个体内SNP位点。
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公开(公告)号：CN101899520A
公开(公告)日：2010-12-01
申请号：CN201010239919.8
申请日：2010-07-28
Applicant: 中国林业科学研究院热带林业研究所
Abstract: 本发明提供了一种基于荧光dUTP的自动检测SSR分子标记的方法，包括以下步骤：(1)配制PCR反应体系：取1.0μL 10×buffer、dNTP 25～50μM、MgCl22.0mM、前向引物0.5μM、后向引物0.5μM、Taq酶1个单位、荧光dUTP10pmol和基因组DNA 5ng混合，加超纯水补至10μL；(2)进行降落PCR：94℃4min；20个循环：94℃30s、70～60℃或者66～56℃30s且每个循环降低0.5℃、72℃1min；再26个循环：94℃30s、60或者56℃30s、72℃1min；最后72℃10min，得PCR产物；(3)取PCR产物1.0μL加入9.34μL超纯甲酰胺、0.16μL分子量内标，95℃5min后放置冰上快速冷却，在测序仪上进行标记检测。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN114277172B
公开(公告)日：2024-05-31
申请号：CN202111523937.3
申请日：2021-12-14
Applicant: 中国林业科学研究院热带林业研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了猴耳环品种鉴定的SSR多重检测引物、试剂盒及方法。与单个标记的独立PCR检测相比，本发明方法具有经济性好、节约试剂和省时高效等优点，为猴耳环和近缘种的群体多样性分析、种质资源遗传评价、品种和药材真实性鉴定等提供了简便可靠的方法；将该方法用于猴耳环品种(扦插无性系)的SSR分子指纹的构建和待检品种的鉴定，具有准确可靠、有效快捷的优点，可有效甄别假冒和错乱的品种以及新的品种，这为保障良种培育人和营林种植者的权益提供了重要的技术支撑。
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公开(公告)号：CN110343741B
公开(公告)日：2023-06-06
申请号：CN201910665025.6
申请日：2019-07-23
Applicant: 中国林业科学研究院热带林业研究所
IPC: C12Q1/6806 , C12N15/10 , C40B50/06
Abstract: 本发明提供了一种基于双酶切的简化基因组测序文库的构建方法，属于全基因组重测序技术领域，包括利用限制性内切酶MspI和MseI对基因组DNA进行酶切，将接头序列分别连接到酶切产物上，得到连接产物；将连接产物进行等质量混合，将得到的混合物进行双轮磁珠分选，得到350bp的片段；以得到的片段为模板，用引物对进行PCR扩增，将得到的扩增产物纯化后，构建得到基于双酶切的简化基因组测序文库；所述引物对的上游引物的序列如SEQ ID No.1所示，下游引物的序列如SEQ ID No.2所示。采用本发明提供的构建方法最终开发的SNP位点有225,744个，提高了SNP位点的开发。
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公开(公告)号：CN109706265B
公开(公告)日：2022-04-01
申请号：CN201910180669.6
申请日：2019-03-11
Applicant: 中国林业科学研究院热带林业研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供了一种SNP组合及其在桉树无性系鉴定中的应用，属于SNP标记技术领域。采用本发明提供的70个SNP标记组合极大提高对无性系检测准确度、缩短检测时间、提高检测水平，可有效应用于桉树无性系鉴定，快速甄别假冒和错乱的无性系，有效减少对桉树无性系鉴定的工作量，为桉树无性系推广、良种市场规范化提供强有力的技术检测，切实保障良种培育人和营林种植者的权益。
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公开(公告)号：CN107354222B
公开(公告)日：2020-10-30
申请号：CN201710761216.3
申请日：2017-08-30
Applicant: 中国林业科学研究院热带林业研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了用于鉴定桉树无性系的STR引物、PCR试剂盒及方法。本发明通过大量的STR标记分型检测，筛选出了8对多态性高、扩增条带清晰的桉树STR引物用于鉴定桉树无性系，并建立了多重荧光检测体系。将该STR引物组用于鉴定桉树无性系，具有效率高、检测准确、操作方便等优势。本发明可有效甄别假冒和错乱的无性系，切实保障良种培育人和营林种植者的权益；并可为今后快速进行桉树种质资源遗传评价、遗传图谱构建、分子标记辅助育种、无性系指纹图谱构建和鉴定提供重要的技术支撑。
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公开(公告)号：CN107385052A
公开(公告)日：2017-11-24
申请号：CN201710671363.1
申请日：2017-08-08
Applicant: 中国林业科学研究院热带林业研究所
Abstract: 本发明公开了用于鉴定桉树无性系的STR引物及其应用。本发明通过大量的STR标记分型检测，筛选出了8对多态性高、扩增条带清晰的桉树STR引物用于鉴定桉树无性系，并建立了多重荧光检测体系。将该STR引物组用于鉴定桉树无性系，具有效率高、检测准确、操作方便等优势。本发明可有效甄别假冒和错乱的无性系，切实保障良种培育人和营林种植者的权益；并可为今后快速进行桉树种质资源遗传评价、遗传图谱构建、分子标记辅助育种、无性系指纹图谱构建和鉴定提供重要的技术支撑。
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