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公开(公告)号：CN101914615B
公开(公告)日：2012-09-05
申请号：CN201010186100.X
申请日：2010-05-28
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明涉及一种亚历山大藻荧光定量聚合酶链反应标准品的构建方法，通过提取A.catenella ACDH01的DNA，聚合酶链反应扩增A.catenella的18SrDNA到28S rDNA基因片段，并将扩增产物和T载体连接，构建重组质粒。经确认的重组质粒梯度稀释成聚合酶链式反应标准品；以5.8S-b5’和5.8S-b3’为引物，以重组质粒标准品为模板，real-time聚合酶链反应，根据反应中的临界循环数以及重组质粒标准品的梯度浓度对数值制备标准曲线。本发明建立了带有A.catenella的18S rDNA-28S rDNA基因片段的重组质粒real-time聚合酶链反应标准品，采用一对通用引物，可以准确、高效、快速地对待测的亚历山大藻real-time聚合酶链反应检测。
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公开(公告)号：CN101974626A
公开(公告)日：2011-02-16
申请号：CN201010503053.7
申请日：2010-10-12
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 一种细菌检测技术领域的基于量子点荧光原位杂交的海绵细胞内共生细菌的检测方法，通过获取海绵单细胞，按照经典的荧光原位杂交方法，采用生物素标记的寡核苷酸探针对海绵单细胞内的微生物基因组DNA进行杂交，最后采用链亲和素标记的量子点进行孵育处理，得到在激发光为紫外区的荧光显微镜下呈现蓝色的海绵细胞以及呈现红色的细菌。本发明将机械法与化学法相结合，可以快速获取海绵细胞，避免海绵细胞自发荧光的干扰，成功探测到海绵细胞内的细菌。
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公开(公告)号：CN101914615A
公开(公告)日：2010-12-15
申请号：CN201010186100.X
申请日：2010-05-28
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明涉及一种亚历山大藻荧光定量聚合酶链反应标准品的构建方法，通过提取A.catenella ACDH01的DNA，聚合酶链反应扩增A.catenella的18SrDNA到28S rDNA基因片段，并将扩增产物和T载体连接，构建重组质粒。经确认的重组质粒梯度稀释成聚合酶链式反应标准品；以5.8S-b5’和5.8S-b3’为引物，以重组质粒标准品为模板，real-time聚合酶链反应，根据反应中的临界循环数以及重组质粒标准品的梯度浓度对数值制备标准曲线。本发明建立了带有A.catenella的18S rDNA-28S rDNA基因片段的重组质粒real-time聚合酶链反应标准品，采用一对通用引物，可以准确、高效、快速地对待测的亚历山大藻进行real-time聚合酶链反应检测。
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公开(公告)号：CN101871009A
公开(公告)日：2010-10-27
申请号：CN201010199187.4
申请日：2010-06-13
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明涉及一种海绵共附生抑菌活性菌株筛选方法，将海洋细菌pks基因分子生物学筛选与抑菌活性检测相结合，首先，分离纯化海绵共附生菌株，通过酚-氯仿方法提取海绵共附生菌DNA并以此为模板，以细菌pks基因的ks域通用引物GB1/GB2为引物，进行聚合酶链反应扩增pks基因片段，获得海绵共附生菌的690bp片段经测序后，提交Genbank，并Blast分析；测定pks阳性菌株的抑菌活性；以筛选到有690bp目标片段的抑菌活性菌株DNA为模板，以细菌16S rDNA通用引物27f/1492r为引物，聚合酶链反应扩增目的片段以及测序鉴定，所获得的序列提交GenBank，并Blast分析，确定pks基因片段阳性海绵共附生抑菌活性菌株的种属。
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公开(公告)号：CN109053720B
公开(公告)日：2020-11-06
申请号：CN201810892539.0
申请日：2018-08-07
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07D417/14 , A01N43/78 , A01P13/00 , C12P17/16 , C12R1/07
Abstract: 本发明提供了一种生物碱类化合物，包括结构如式I所示的化合物及其衍生物；式I。其分子式为C20H22N4O2S，分子量382。该化合物的制备方法包括以下步骤：将海洋萎缩芽孢杆菌经平板培养、种子培养和摇瓶发酵，分离纯化后制备即得所述生物碱类化合物。该化合物的衍生物被证明具有抗赤潮藻、淡水有害藻等活性，可用于制备相关药剂。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN105463028B
公开(公告)日：2019-10-08
申请号：CN201510895006.4
申请日：2015-12-07
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种硼替佐米诱导海洋真菌合成次生代谢产物的方法；所述方法具体为在海洋真菌发酵过程中添加硼替佐米，即可；其中，所述发酵包括将所述海洋真菌接种于种子培养基中培养获得种子液的步骤和将所述种子液接种于发酵培养基中进行发酵得到次生代谢产物的步骤。与现有技术相比，本发明具有如下的有益效果：与实验室常规培养海洋真菌的条件相比，通过向培养基中添加硼替佐米，明显提高了海绵共生斑污拟盘多毛孢真菌代谢产物的合成水平。
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公开(公告)号：CN109053720A
公开(公告)日：2018-12-21
申请号：CN201810892539.0
申请日：2018-08-07
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07D417/14 , A01N43/78 , A01P13/00 , C12P17/16 , C12R1/07
Abstract: 本发明提供了一种生物碱类化合物，包括结构如式I所示的化合物及其衍生物；式I。其分子式为C20H22N4O2S，分子量382。该化合物的制备方法包括以下步骤：将海洋萎缩芽孢杆菌经平板培养、种子培养和摇瓶发酵，分离纯化后制备即得所述生物碱类化合物。该化合物的衍生物被证明具有抗赤潮藻、淡水有害藻等活性，可用于制备相关药剂。
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公开(公告)号：CN106167809A
公开(公告)日：2016-11-30
申请号：CN201610396756.1
申请日：2016-06-06
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明提供了一种海洋萎缩芽孢杆菌外源DNA的转入方法，包括如下步骤：对供体菌株、辅助菌株和受体菌株分别进行培养，并分别检测供体菌株培养液、辅助菌株培养液和受体菌株培养液的OD600；将前步骤中培养后的供体菌株、辅助菌株和受体菌株等量混匀，进行三亲本杂交，并筛选出杂交成功的菌株，记为三亲本杂交菌株；筛选出带有质粒菌株的萎缩芽孢杆菌C89/pRP1028；提取质粒pRP1028；将质粒pRP1028转化到大肠杆菌中，并提取大肠杆菌的质粒，进行测序验证。本发明具有如下的有益效果：对特殊培养和难于转化菌株的外源基因的转化带有借鉴意义。
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公开(公告)号：CN105463078A
公开(公告)日：2016-04-06
申请号：CN201510894975.8
申请日：2015-12-07
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种基因分析介导的芳香环聚酮化合物的寻找和鉴定方法，包括通过对待测菌株Ⅱ型聚酮酮合酶基因的扩增筛选具有芳香环聚酮合成潜力的菌株的步骤；通过对所述扩增产物读码的氨基酸序列进行比对、系统进化分析预测产物化学型的步骤；发酵所述菌株并于发酵液提取物中寻找、鉴定所述化学型产物的步骤。与现有技术相比，该方法可用于从野生型放线菌菌株的代谢产物中定向发现芳香环聚酮类化合物。
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公开(公告)号：CN101880713B
公开(公告)日：2013-02-06
申请号：CN201010186101.4
申请日：2010-05-28
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明涉及一种海绵细胞内共生放线菌的分子检测方法，采用机械法与化学法相结合，获取海绵单细胞，提取海绵细胞内内共生微生物总DNA；以提取的总DNA为模板，以放线菌种属特异性引物用聚合酶链式反应扩增放线菌16SrRNA基因片段；将扩增产物纯化后构建克隆文库，随机挑取阳性克隆进行测序至文库饱和，将测序结果及其最相近序列导入ARB序列分析软件包中进行系统发育分析，完成海绵细胞内共生放线菌的分子检测。本发明建立了一套较为全面、准确的海绵细胞内共生放线菌的分子检测方法。
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