一种基于测序数据的基因单倍型分型方法、设备及介质

    公开(公告)号:CN119580843A

    公开(公告)日:2025-03-07

    申请号:CN202411993225.1

    申请日:2024-12-31

    Inventor: 陈晨 余欢 刘利鹏

    Abstract: 本发明属于等位基因分型技术领域,公开了一种基于测序数据的基因单倍型分型方法、设备及介质,包括获取源自待检样本的待测基因测序数据;根据参考序列将所述测序数据拆分至基因后进行变异信息检测与变异信息过滤;基于变异信息过滤后的序列进行序列拆分后,对序列拆分后的单倍型序列进行矫正,获得待检样本的待测基因单倍型分型结果。本发明采用先拆分序列到基因的方式对复杂的计算进行简化,不完全依赖序列比对结果,采用比对结合回溯变异信息打分的方式来对相似分型进行最终评估,能够有效对分型差异信息进行提炼,减少测序数据噪声对结果的干扰;采用初分型加矫正的方式对单倍型的结果进行多次验证,使结果准确性更高。

    用于纳米孔信号的编码器、解码器、编解码系统和方法

    公开(公告)号:CN117113063A

    公开(公告)日:2023-11-24

    申请号:CN202311352700.2

    申请日:2023-10-19

    Abstract: 本发明公开了一种用于纳米孔信号的编码器、解码器、编解码系统和方法,其中的编码器包括:分窗单元、移位单元和至少两个编码单元;分窗单元将纳米孔信号分割为M个信号段后输出至编码单元,编码单元中至少包括:第一自查询权值计算器;第一自查询权值计算器中包括:至少一个第一注意力模块;第一注意力模块对每个信号段分别进行注意力计算,将M个信号段的注意力计算结果组合成一个注意力计算结果作为信号特征输出;每两个相邻的编码单元之间设置有一个移位单元,用于对信号特征按照预设的平移值进行数据循环平移,将平移后的信号特征重新分割为M个信号段后输出至编码单元。应用本发明可以提高编解码的准确率,提高计算速度、降低内存消耗。

    检测微结构、单元、单元阵列以及芯片

    公开(公告)号:CN116731844A

    公开(公告)日:2023-09-12

    申请号:CN202311008552.2

    申请日:2023-08-10

    Abstract: 本申请公开了一种检测微结构、单元、单元阵列以及芯片,检测微结构包括基体、检测电极和阻隔部;基体开设有容纳槽,容纳槽包括相互连接的第一槽壁和第二槽壁,第一槽壁围设在第二槽壁的周侧,并在远离第二槽壁的一侧形成开口;检测电极设置于第二槽壁;阻隔部与检测电极对应设置,其中,在向检测微结构中导入第一非极性溶液的情况下,阻隔部用于阻隔第一非极性溶液覆盖检测电极。基于此,本申请通过设置阻隔部,有效地阻止了第一非极性溶液在第二槽壁上向检测电极方向的扩散,保护了检测电极,从而确保了检测电极可以正常使用,提高了检测微结构测序时的可靠性。

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