SARS-CoV-2 RBD中和核酸适体的筛选方法及核酸适体

    公开(公告)号:CN114250221B

    公开(公告)日:2024-06-04

    申请号:CN202010995577.6

    申请日:2020-09-21

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 本发明公开了一种SARS‑CoV‑2 RBD中和核酸适体的筛选方法及核酸适体,其包括如下序列中的至少一种:SEQ ID NO:1‑SEQ ID NO:15。本发明的核酸适体更容易与RBD蛋白结合并“击垮”RBD蛋白与受体ACE2之间的相互作用,其对SARS‑CoV‑2具有很强的中和效应以及高度的结合亲和力,能够有效地抑制病毒对细胞的侵染。由于本发明的核酸适体特有的生产周期短、生产成本低、免疫原性低等优点,使其在检测、预防和治疗新冠病毒方面很好地节约了时间成本,对于目前新冠病毒的防治具有重要意义,并且在临床上亦有很好的应用前景。

    一种新生外泌体的分离检测方法

    公开(公告)号:CN114990047B

    公开(公告)日:2024-04-19

    申请号:CN202210535247.8

    申请日:2022-05-17

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 本发明公开了一种新生外泌体的分离检测方法,包括如下步骤:1)非天然糖对肿瘤细胞或肿瘤小鼠进行糖代谢标记使得新生外泌体带有叠氮基团;2)分离外泌体或获取具有外泌体的样品;3)在步骤2)的外泌体或具有外泌体的样品中加入能与叠氮基团反应的捕获连接体;4)对修饰上捕获连接体的外泌体进行分离捕捉,得到的外泌体即为新生外泌体。本发明方法可以在不改变外泌体表面蛋白表达的情况下在混合体系样本中选择性的捕获新生成的外泌体,从而更有效的进行新生外泌体分析。

    一种基于可解释深度学习的测序数据特征基因提取方法

    公开(公告)号:CN117877585A

    公开(公告)日:2024-04-12

    申请号:CN202410064040.6

    申请日:2024-01-17

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 一种基于可解释深度学习的测序数据特征基因提取方法,本方法使用可解释深度学习在分类决策过程中对决策起重要作用的特征基因进行提取,使用基因作为输入,对于目标细胞/spot(空间转录组中的测量单位)类型进行分类任务。并且在分类过程中计算基因特征的梯度值作为基因对于目标细胞/spot类型的分类的重要程度(显著性),并依此进行排序。取显著性排名靠前的基因作为特征基因签名,并循环直至排名稳定。稳定的特征基因签名可以用于分析患者预后、分析细胞功能等。该方法适用于基于下一代测序的空间转录组学和单细胞转录组学等转录组数据,具有广泛的适用性。

    一种用于提升寡核苷酸链酶促合成纯度与产率的方法

    公开(公告)号:CN117701658A

    公开(公告)日:2024-03-15

    申请号:CN202311683814.5

    申请日:2023-12-08

    Abstract: 本发明公开了一种用于提升寡核苷酸链酶促合成纯度与产率的方法,包括(1)采用基于生物酶促方法在固相载体上以dNTP‑3’‑R为原料实现寡核苷酸链的碱基延伸;(2)采用TdT在未发生碱基延伸的寡核苷酸链的3’末端的‑OH偶合ddNTP用以实现加帽封闭反应;(3)然后进行脱保护以将发生碱基延伸的寡核苷酸链的3’末端的‑R脱保护形成活化的‑OH;(4)重复步骤(1)至(3)直至实现所需的寡核苷酸链的合成。本发明可实现在寡核苷酸链酶促合成过程中对每一轮未发生延伸反应的羟基基团进行高效封闭反应,以此提升酶促合成终产物的纯度和产率。

    一种基于数字微流控技术的自动化噬菌体淘选平台

    公开(公告)号:CN113176310B

    公开(公告)日:2023-10-20

    申请号:CN202110292203.2

    申请日:2021-03-18

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 本发明公开了一种基于数字微流控技术的自动化噬菌体淘选平台,包括数字微流控平台,所述数字微流控平台由为微流控芯片、集成电路、温控模块、磁分离模块四部分组成,微流控芯片及其集成电路用于流体操纵,温控模块用于提供细菌和噬菌体扩增的适宜温度,磁分离模块用于实现集成化的磁珠洗涤。自动化淘选方案可以在16小时内自动化地完成三轮生物淘选,与传统方法近一周的繁琐人工操作相比,大大解放了劳动力。此外,该方案的试剂用量仅为常规方法的3%,大大降低了试剂成本。总之,本发明将进一步推动亲和多肽筛选及其在诊断、成像、递送和治疗等领域的应用。

    一种自动化原位DNA信息存储与读取方法

    公开(公告)号:CN115458059A

    公开(公告)日:2022-12-09

    申请号:CN202210995527.7

    申请日:2022-08-18

    Abstract: 本发明公开了一种自动化原位DNA信息存储与读取方法,包括如下步骤:(1)将所需存储的数据文件通过信息交换代码转换为三进制数字;(2)依照上述三进制数字与DNA碱基变换的对照编译码表,将上述三进制数字编码为对应的DNA序列;(3)在数字微流控芯片上,采用DNA合成方法合成步骤(2)所编码的对应的DNA序列,以进行所述数据文件的信息的存储;(4)在数字微流控芯片上,采用基于DNA测序方法对步骤(3)所合成的所述DNA序列进行测序,以进行所述数据文件的信息的读取;(5)依据上述对照编译码表对步骤(4)所读取的信息进行译码转换。本发明能够提供DNA信息存储从写入到读取的一体化解决方案。

    一种基于数字微流控技术的单细菌基因组测序方法

    公开(公告)号:CN115197840A

    公开(公告)日:2022-10-18

    申请号:CN202210987383.0

    申请日:2022-08-17

    Abstract: 本发明涉及单细菌测序领域,具体涉及一种基于数字微流控技术的单细菌基因组测序方法。本发明开发了基于全自动数字微流控平台(DMF)的适用于单细菌的微型裂解体系、数字微流控芯片及单细菌基因组测序技术,实验结果表明,裂解体系单细菌细胞裂解迅速、基因完整度好、组装效率及基因覆盖度高;同时该裂解体系及基于该裂解体系的微流控芯片与DMF的联用,减少了试剂的损耗,降低了样品污染风险、提高了反应效率、减小了扩增偏差,使之更适用于单细菌基因组测序。

    一种外泌体PD-L1的研究方法
    149.
    发明授权

    公开(公告)号:CN113219180B

    公开(公告)日:2022-05-13

    申请号:CN202110125651.3

    申请日:2021-01-29

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 本发明公开了一种外泌体PD‑L1的研究方法,包括如下步骤:1)将细胞与非天然糖共培养,细胞泌出含有非天然糖的外泌体;2)将功能性探针标记到非天然糖上,所述的功能性探针具有第一标记;3)适体识别外泌体表面的蛋白,所述的适体具有第二标记;4)第一标记同第二标记相互作用,检测该相互作用的效果,从而检测外泌体蛋白的糖基化信息。即可原位检测外泌体PD‑L1的糖基化,操作简单,无需裂解细胞等侵入性操作,保持细胞的完整性和功能。

    唾液酸结合性免疫球蛋白样凝集素-15蛋白的核酸适配体及其应用

    公开(公告)号:CN113122543A

    公开(公告)日:2021-07-16

    申请号:CN202110358738.5

    申请日:2021-04-01

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 本发明公开了一种唾液酸结合性免疫球蛋白样凝集素‑15(Sialic acid‑bindingimmunoglobulin‑like lectin‑15,Siglec‑15)蛋白的核酸适配体,所述的核酸适配体包括如SEQ IDNO:1至SEQ ID NO:7所示的核苷酸序列。本发明的核酸适配体能够提供Siglec‑15蛋白的快速、精准检测,同时适配体能够阻断其与T细胞表面受体相互作用,一定程度上恢复T细胞增殖活性,从而使得肿瘤微环境的免疫正常化,且不会引起严重的自身免疫反应。Siglec‑15核酸适配体可作为药物用于肿瘤微环境高表达Siglec‑15的癌症,成为肿瘤免疫治疗的潜在核酸药物,可能对抗PD‑L1治疗无效的患者有效,进而补充现有肿瘤诊断和免疫治疗体系。

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