一个长链非编码RNA基因及其应用方法

    公开(公告)号:CN103146693A

    公开(公告)日:2013-06-12

    申请号:CN201310060183.1

    申请日:2013-02-26

    Applicant: 中南大学

    Abstract: 本发明涉及一个新克隆的长链非编码RNA基因全长序列及其应用方法,可以采用包括杂交法或扩增法在内的方法在分离样本中检测该基因,该基因可以作为肿瘤标志物,尤其是肝癌的标记物。根据该基因序列,设计并合成实时定量PCR引物和原位杂交探针,在肝癌临床病例标本中检测该长链非编码RNA的表达水平,发现该长链非编码RNA在肝癌中表达显著上调,且该长链非编码RNA表达高的肝癌患者预后较差。根据该基因序列,设计并合成了用于RNA干扰封闭该长链非编码RNA表达的短发夹结构RNA真核表达载体,利用该载体成功地在肝癌细胞系中抑制了该长链非编码RNA的表达。

    一种筛选肿瘤遗传分子标记物的方法

    公开(公告)号:CN101245385A

    公开(公告)日:2008-08-20

    申请号:CN200810030913.2

    申请日:2008-03-26

    Applicant: 中南大学

    Abstract: 本发明公开了一种筛选肿瘤遗传分子标记物的方法:显微切割肿瘤组织标本;纯化提取RNA,体外转录、线性扩增合成aRNA;逆转录、二轮体外扩增制备生物素标记cRNA探针;探针与人类全基因组表达谱芯片杂交,信号扫描,输出数据,构建肿瘤纯化组织的基因表达谱;运用权重赋值算法,使用逐个剔除交叉验证对数据归一化处理,分析筛选与肿瘤相关的分子标记物。本发明结合使用高通量基因芯片、结合显微切割、线性扩增技术,构建不同病理类型、不同临床分期的肿瘤组织中肿瘤基因表达谱,为筛选不同用途的肿瘤分子标记物和潜在的肿瘤药物作用靶点提供了新的方法。

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