一种基于全基因组STR建立动物亲权鉴定系统的方法

    公开(公告)号:CN104480205B

    公开(公告)日:2017-01-18

    申请号:CN201410757128.2

    申请日:2014-12-10

    Abstract: 本发明涉及种质资源保护领域,特别涉及动物亲权鉴定领域,公开了一种基于全基因组STR建立动物亲权鉴定系统的方法,包括:1)全基因组STR位点查找;2)STR位点的初步筛选;3)引物设计;4)动物群体随机抽样并提取基因组DNA;5)STR位点群体多态性验证;6)对具有遗传多态性的STR位点进行哈迪-温伯格平衡检验,筛选出基因型频率分布满足哈迪-温伯格平衡的STR位点;7)STR位点的法医学学应用价值评价;8)建立STR亲权鉴定系统。该方法具有操作简便的优点,所构建亲权鉴定系统的非父排除率可达0.99以上,能准确进行动物亲权鉴定从而可用于指导珍稀物种的繁育及经济类物种的鉴别及育种。

    一种遗骸核DNA个体识别的新方法

    公开(公告)号:CN101225444B

    公开(公告)日:2012-09-12

    申请号:CN200810017405.0

    申请日:2008-01-25

    Abstract: 本发明公开了一种遗骸(骨、牙)核DNA个体识别的新方法,其原理利用异硫氰酸胍存在的条件下,二氧化硅微粒与核DNA分子特异性的结合,同时用EDTA和PK对遗骸进行脱钙和蛋白消化,最大程度减少DNA分子丢失,达到最大效率分离核酸的目的。该方法和有机溶剂法、盐析法及Chelex-100法相比较,采用等量的骨粉,其DNA提取效率和质量高于以上方法。与此同时,在整个提取过程中,该方法操作步骤简便,易于掌握,无需大型和特殊的仪器设备。提取骨胳、牙齿DNA过程仅需一天的时间就可以完成,骨粉用量为0.25g,能够在1.5ML的管内操作,易于提取过程标准化和省时。该方法重现性好,对同一样本进行盲测检验,结果可以达到高度的一致性。

    线粒体测序用26对PCR引物及基于该引物的分型方法

    公开(公告)号:CN101270390A

    公开(公告)日:2008-09-24

    申请号:CN200810017975.X

    申请日:2008-04-15

    Abstract: 本发明涉及一种核酸检测方法,特别是公开了一种线粒体全部碱基序列分型及其测定方法,具体而言是线粒体测序用26对PCR引物及基于该引物的分型方法。本发明选用的26对PCR引物覆盖了线粒体基因组全长,其中引物15-1、15-2、15-3、24-1、24-2针对中国人群重新设计,对中国人群的分型具有针对性;引物24-1对应的扩增片段最小,为420bp;引物22对应的扩增片段最大,为1162bp;所有PCR片段大小适中,均适宜PCR扩增。本发明的26对PCR引物已在申请人的实验室应用于中华民族群体遗传资料调查,已向GENEBANK数据库提交了中国人群线粒体全序列资料。结果表明,本发明完全可以应用在法医学、人类学、遗传学和疾病等领域的个体识别、亲子鉴定以及基因诊断等领域。

    一种基于全基因组STR建立动物亲权鉴定系统的方法

    公开(公告)号:CN104480205A

    公开(公告)日:2015-04-01

    申请号:CN201410757128.2

    申请日:2014-12-10

    CPC classification number: C12Q1/6888 C12Q2600/156

    Abstract: 本发明涉及种质资源保护领域,特别涉及动物亲权鉴定领域,公开了一种基于全基因组STR建立动物亲权鉴定系统的方法,包括:1)全基因组STR位点查找;2)STR位点的初步筛选;3)引物设计;4)动物群体随机抽样并提取基因组DNA;5)STR位点群体多态性验证;6)对具有遗传多态性的STR位点进行哈迪-温伯格平衡检验,筛选出基因型频率分布满足哈迪-温伯格平衡的STR位点;7)STR位点的法医学学应用价值评价;8)建立STR亲权鉴定系统。该方法具有操作简便的优点,所构建亲权鉴定系统的非父排除率可达0.99以上,能准确进行动物亲权鉴定从而可用于指导珍稀物种的繁育及经济类物种的鉴别及育种。

    线粒体测序用26对PCR引物及基于该引物的分型方法

    公开(公告)号:CN101270390B

    公开(公告)日:2011-07-27

    申请号:CN200810017975.X

    申请日:2008-04-15

    Abstract: 本发明涉及一种核酸检测方法,特别是公开了一种线粒体全部碱基序列分型及其测定方法,具体而言是线粒体测序用26对PCR引物及基于该引物的分型方法。本发明选用的26对PCR引物覆盖了线粒体基因组全长,其中引物15-1、15-2、15-3、24-1、24-2针对中国人群重新设计,对中国人群的分型具有针对性;引物24-1对应的扩增片段最小,为420bp;引物22对应的扩增片段最大,为1162bp;所有PCR片段大小适中,均适宜PCR扩增。本发明的26对PCR引物已在申请人的实验室应用于中华民族群体遗传资料调查,已向GENEBANK数据库提交了中国人群线粒体全序列资料。结果表明,本发明完全可以应用在法医学、人类学、遗传学和疾病等领域的个体识别、亲子鉴定以及基因诊断等领域。

    一种X染色体STR基因位点分型的荧光检测方法

    公开(公告)号:CN101608233A

    公开(公告)日:2009-12-23

    申请号:CN200910023397.5

    申请日:2009-07-21

    Abstract: 本发明公开了一种X染色体STR基因位点分型的荧光检测方法,包括等位基因分型标准物的制备:分别以包含3个X染色体STR基因位点DXS7132、DXS6799和DXS6804的不同基因型的质粒为模板,以5’端标记有荧光分子的引物对为引物PCR扩增,将全部的等位基因的片段按照分子量等比混合得到等位基因分型标准物;在同一扩增体系PCR扩增待测X染色体包含的3个X染色体的STR等位基因;荧光检测分型以PCR扩增到的带有荧光分子标记的等位基因分型标准物和待测X染色体的STR等位基因片段进行毛细管电泳分离进行标准化分型。本发明应用于亲子鉴定、个体识别、性别鉴定、X连锁遗传致病基因定位、易感基因的检出。

    一种新的10个Y染色体短串联重复序列位点及其分型方法

    公开(公告)号:CN101225386A

    公开(公告)日:2008-07-23

    申请号:CN200810017379.1

    申请日:2008-01-22

    Abstract: 本发明公开了一种新的10个Y染色体STR基因位点及其分型方法,用聚丙烯酰胺凝胶电泳分型,结合银染显色方法筛选出可应用于法医学等领域的10个Y染色体STR位点,并制备了各位点等位基因分型标准物(AllelicLadder),对Y染色体STR位点的PCR引物和扩增条件进行了优化,其中对PCR引物和扩增条件的优化和等位基因分型标准物的制备,可以做到标准化和简单化并适合基层单位普及。可应用于法医学、人类学、遗传学和疾病等领域的个体识别、亲子鉴定以及基因诊断等方面,具有广泛的应用前景。特别适用于法医学实践中父方缺失(如去世或失踪)情况下的亲权鉴定和强(轮)奸案中混合斑的个体认定,对患有无精症或少精症的犯罪嫌疑人的认定更具独到之处。

    一种新的3个人类抗肌萎缩蛋白基因STR位点及其分型方法

    公开(公告)号:CN101712997B

    公开(公告)日:2012-03-28

    申请号:CN200910254562.8

    申请日:2009-12-29

    Abstract: 本发明公开了一种新的3个人类抗肌萎缩蛋白(DMD)基因STR基因位点及其分型方法,其特征在于,该3个DMD基因STR位点分别位于DMD基因的第60、30及2内含子区,分别为DXSDMD-in60,DXSDMD-in30,DXSDMD-in2;该3个基因STR位点位点片段大小适中,均适宜PCR扩增。本发明从NCBI选出DMD基因15个候选新的STR序列,采用基因分型,DNA测序分析和定义,研究DMD基因STR的遗传结构在健康群体中的等位基因频率分布,获得了西安汉族健康群体中的DNA分型结果,经统计学处理证明,这3个STR位点在研究群体中多态性信息含量均>0.60,可用于群体遗传学及法医学实践,为杜氏肌营养不良疾病的基因诊断及分子机制研究提供了理论基础。

    一种新的3个人类抗肌萎缩蛋白基因STR位点及其分型方法

    公开(公告)号:CN101712997A

    公开(公告)日:2010-05-26

    申请号:CN200910254562.8

    申请日:2009-12-29

    Abstract: 本发明公开了一种新的3个人类抗肌萎缩蛋白(DMD)基因STR基因位点及其分型方法,其特征在于,该3个DMD基因STR位点分别位于DMD基因的第60、30及2内含子区,分别为DXSDMD-in60,DXSDMD-in30,DXSDMD-in2;该3个基因STR位点位点片段大小适中,均适宜PCR扩增。本发明从NCBI选出DMD基因15个候选新的STR序列,采用基因分型,DNA测序分析和定义,研究DMD基因STR的遗传结构在健康群体中的等位基因频率分布,获得了西安汉族健康群体中的DNA分型结果,经统计学处理证明,这3个STR位点在研究群体中多态性信息含量均>0.60,可用于群体遗传学及法医学实践,为杜氏肌营养不良疾病的基因诊断及分子机制研究提供了理论基础。

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