公开(公告)号：CN108796097A

公开(公告)日：2018-11-13

申请号：CN201810568290.8

申请日：2018-06-05

Applicant: 哈尔滨工业大学(威海)

Inventor： 谷庆泽 ,  张艾涵 ,  张治洲 ,  宋媛 ,  李凯强

IPC: C12Q1/689 ,  C12Q1/06

CPC classification number: C12Q1/689

Abstract: 本发明属于生物技术领域，涉及一种利用属特异性引物定量检测污损早期不同涂层表面6种菌属附着程度的方法，该方法包含以下步骤：(1)以海上挂板表面样品中测得的6种菌属(不动杆菌属(Acinetobacter)、黄杆菌属(Flavobacterium)、超微细菌属(Glaciecola)、简纳西氏菌属(Jannaschia)、红球菌属(Rhodococcus)、亚硫酸盐杆菌属(Sulfitobacter))为对象，设计对应的特异性引物；(2)污损早期不同涂层表面海水污损样本的采集和宏基因组提取；(3)利用特异性引物进行PCR扩增来定量检测6种对应菌属的附着程度。本发明基于海洋污损原核生物的全基因组序列中的特异性序列设计种、属特异性引物，为在种、属水平上检测样品中污损微生物群落结构动态变化提供了高效、快速的技术手段。

公开(公告)号：CN106222249A

公开(公告)日：2016-12-14

申请号：CN201610552455.3

申请日：2016-07-14

Applicant: 哈尔滨工业大学(威海)

Inventor： 张会敏 ,  李凯强 ,  苏立宇 ,  何鸿魁 ,  余秀娟 ,  曹润杰 ,  汤知辉 ,  王伟民 ,  张治洲

IPC: C12Q1/68 ,  C12Q1/04 ,  C12N15/11

CPC classification number: C12Q1/689 ,  C12Q1/6851 ,  C12Q1/6895 ,  C12Q2531/113 ,  C12Q2545/113 ,  C12Q2563/107

Abstract: 本发明涉及一种测定微生物群落中已知基因组信息物种的种特异性引物的设计方法及测定菌种含量的方法，属于生物技术领域。本发明是一种基于微生物群落中某些已知基因组信息的物种的种特异性引物的设计方法，该设计方法包括近全长的核糖体基因文库克隆测序；生物信息学分析(BLAST等)确定菌群中的物种及其相对丰度；查询已经具备基因组序列的物种；依据PRIMER-BLAST工具设计物种特异性引物；引物特异性检测。菌种含量测定是通过QPCR方法使用本发明的物种特异性引物，定量测定相应物种在微生物群落中的含量。这种测定微生物群落中已知微生物含量的方法可以在种的层次上跟踪考察某些重要微生物物种在重要生物学过程如白酒发酵过程中的数量变化。本发明是针对某些微生物基因组中物种特异性的非核糖体基因序列的